Počet záznamů: 1
Dissecting large and complex genomes: flow sorting and BAC cloning of individual chromosomes from bread wheat
- 1.
SYSNO ASEP 0107485 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Ostatní články Název Dissecting large and complex genomes: flow sorting and BAC cloning of individual chromosomes from bread wheat Překlad názvu Rozdělení velkých a komplexních genomů na části: třídění a klonování jednotlivých typů chromozómů pšenice Tvůrce(i) Šafář, Jan (UEB-Q) RID, ORCID
Bartoš, Jan (UEB-Q) RID, ORCID
Janda, Jaroslav (UEB-Q)
Bellec, A. (FR)
Kubaláková, Marie (UEB-Q) RID
Valárik, Miroslav (UEB-Q) RID, ORCID
Pateyron, S. (FR)
Weiserová, Jitka (UEB-Q)
Tušková, Radka (UEB-Q)
Čihalíková, Jarmila (UEB-Q) RID
Vrána, Jan (UEB-Q) RID, ORCID
Šimková, Hana (UEB-Q) RID, ORCID
Faivre-Rampant, P. (FR)
Sourdille, P. (FR)
Caboche, M. (FR)
Bernard, M. (FR)
Doležel, Jaroslav (UEB-Q) RID, ORCID
Chalhoub, B. (FR)Zdroj.dok. Plant Journal. - : Wiley - ISSN 0960-7412
Roč. 39, - (2004), s. 960-968Poč.str. 9 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. GB - Velká Británie Klíč. slova wheat ; flow sorting ; DNA library Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie CEP GA522/03/0354 GA ČR - Grantová agentura ČR GA521/04/0607 GA ČR - Grantová agentura ČR QC1336 GA MZe - Ministerstvo zemědělství CEZ AV0Z5038910 - UEB-Q Anotace The analysis of the complex genome of common wheat (Triticum aestivum, 2n = 6x = 42, genome formula AABBDD) is hampered by its large size (~17 000 Mbp) and allohexaploid nature. In order to simplify its analysis, we developed a generic strategy for dissecting such large and complex genomes into individual chromosomes. Chromosome 3B was successfully sorted by flow cytometry and cloned into a bacterial artificial chromosome (BAC), using only 1.8 million chromosomes and an adapted protocol developed for this purpose. The BAC library (designated as TA-3B) consists of 67 968 clones with an average insert size of 103 kb. It represents 6.2 equivalents of chromosome 3B with 100% coverage and 90% specificity as confirmed by genetic markers. This method was validated using other chromosomes and its broad application and usefulness in facilitating wheat genome analysis were demonstrated by target characterization of the chromosome 3B structure through cytogenetic mapping. This report on the successful cloning of flow-sorted chromosomes into BACs marks the integration of flow cytogenetics and genomics and represents a great leap forward in genetics and genomic analysis. Pracoviště Ústav experimentální botaniky Kontakt David Klier, knihovna@ueb.cas.cz, Tel.: 220 390 469 Rok sběru 2005
Počet záznamů: 1