Počet záznamů: 1
Comparative Analysis of the PDCD2-TBP-PSMB1 Region in Vertebrates
- 1.
SYSNO ASEP 0105328 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Ostatní články Název Comparative Analysis of the PDCD2-TBP-PSMB1 Region in Vertebrates Překlad názvu Srovnávací analýza oblasti PDCD2-TBP-PSMB1 u obratlovců Tvůrce(i) Trachtulec, Zdeněk (UMG-J) RID, ORCID
Vlček, Čestmír (UMG-J) RID
Mihola, Ondřej (UMG-J) RID, ORCID
Forejt, Jiří (UMG-J) ORCID, RIDZdroj.dok. Gene. - : Elsevier - ISSN 0378-1119
Roč. 335, - (2004), s. 151-157Poč.str. 7 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. NL - Nizozemsko Klíč. slova Conserved synteny Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie CEP LN00A079 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy GV204/98/K015 GA ČR - Grantová agentura ČR IAA5052709 GA AV ČR - Akademie věd CEZ AV0Z5052915 - UMG-J Anotace Three orthologous genes encoding programmed cell death 2 (PDCD2), TATA-binding protein (TBP), and proteasomal subunit C5 (PSMB1) proteins have been shown previously to be nonrandomly distributed in both mammalian and invertebrate genomes. Here we analyze a conserved synteny of the PDCD2, TBP, and PSMB1 orthologs in four nonmammalian vertebrates. Homologous genes of the chicken, zebrafish, fugu, and Tetraodon nigroviridis were identified. A chicken cosmid harboring the orthologs of these three genes was completely sequenced. The fish genes were analyzed in silico. In all vertebrates thus far investigated, the PDCD2 and TBP genes were located tail-to-tail. In all species but the zebrafish, the PSMB1 gene mapped head-to-head or in the close vicinity to the TBP. A comparative analysis revealed the distribution of putative matrix-attached regions (MARs), which may affect the synteny conservation Pracoviště Ústav molekulární genetiky Kontakt Nikol Škňouřilová, nikol.sknourilova@img.cas.cz, Tel.: 241 063 217 Rok sběru 2005
Počet záznamů: 1