Počet záznamů: 1
DNA in phosphorus atom representation: the heteronomous double helices of poly(dA)poly(dT) and poly(dG)poly(dC) and simulation of the yeast genome and of a human chromosome DNA
- 1.
SYSNO ASEP 0104648 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Ostatní články Název DNA in phosphorus atom representation: the heteronomous double helices of poly(dA)poly(dT) and poly(dG)poly(dC) and simulation of the yeast genome and of a human chromosome DNA Překlad názvu DNA v reprezentaci fosforových atomů: heteronomní dvoušroubovice poly(dA)poly(dT) a poly(dG)poly(dC) a simulace genomu kvasinky a DNA lidského chromozómu Tvůrce(i) Hanzálek, Petr (BFU-R)
Kypr, Jaroslav (BFU-R) RIDZdroj.dok. Journal of Theoretical Biology. - : Elsevier - ISSN 0022-5193
Roč. 232, č. 1 (2005), s. 83-91Poč.str. 9 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. GB - Velká Británie Klíč. slova DNA crystal structures ; phosphorus atom representation ; tertiary structures Vědní obor RIV BO - Biofyzika CEP IAA1004201 GA AV ČR - Akademie věd CEZ AV0Z50040507 - BFU-R (2005-2011) Anotace We extracted phosphorus atom coordinates from the database of DNA crystal structures and calculated geometrical parameters needed to reproduce the crystal structures in the phosphorus atom representation. Using the geometrical parameters we wrote a piece of software assigning the phosphorus atom coordinates to the DNA of any nucleotide sequence. The software demonstrates non-negligible influence of the primary structure on DNA helicity, which may stand behind the heteromonous double helices of poly(dA)·poly(dT) and poly(dG)·poly(dC). In addition, the software is so simple that it makes possible to simulate the "crystal" structures of not only viral DNAs, but also the whole genome of Saccharomyces cerevisiae as well as the DNA human chromosome 22 having dozens of megabases in length. Pracoviště Biofyzikální ústav Kontakt Jana Poláková, polakova@ibp.cz, Tel.: 541 517 244 Rok sběru 2005
Počet záznamů: 1