Počet záznamů: 1
Molecular dynamics simulations of guanine quadruplex loops: Advances and force field limitations
- 1.
SYSNO ASEP 0104620 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Ostatní články Název Molecular dynamics simulations of guanine quadruplex loops: Advances and force field limitations Překlad názvu Simulace smyček guaninových kvadruplexů pomocí molekulové dynamiky: pokroky a omezení silových polí Tvůrce(i) Fadrná, E. (CZ)
Špačková, Naďa (BFU-R) RID
Štefl, R. (CZ)
Koča, J. (CZ)
Cheatham III, T. E. (US)
Šponer, Jiří (UFCH-W)Zdroj.dok. Biophysical Journal. - : Cell Press - ISSN 0006-3495
Roč. 87, č. 1 (2004), s. 227-242Poč.str. 16 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova quanine quadruplex ; four-thymidine loop ; locally enhanced sampling Vědní obor RIV BO - Biofyzika CEP LN00A016 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z5004920 - BFU-R Anotace A computational analysis of d(GGGGTTTTGGGG)2 guanine quadruplexes containing either lateral or diagonal four-thymidine loops was carried out using MD simulations in explicit solvent, LES simulations, systematic conformational search, and MM-PBSA calculations with explicit inclusion of monovalent cations. The study provides a qualitatively complete analysis of the available loop conformational space. Pracoviště Biofyzikální ústav Kontakt Jana Poláková, polakova@ibp.cz, Tel.: 541 517 244 Rok sběru 2005
Počet záznamů: 1