Mezidruhový polymorfismus vybraných genů vrozené a získané imunity u sýkor (Paridae)

0454408 - ÚBO 2016 CZ cze A - Abstrakt
Těšický, M. - Vinkler, M. - Bryjová, Anna - Reifová, R. - Bainová, Z. - Bainová, H.
Mezidruhový polymorfismus vybraných genů vrozené a získané imunity u sýkor (Paridae).
Zoologické dny Brno 2015: sborník abstraktů z konference 12.-13. února 2015. Brno: Ústav biologie obratlovců AV ČR, 2015 - (Bryja, J.; Řehák, Z.; Zukal, J.). s. 245-246. ISBN 978-80-87189-18-4.
[Zoologické dny. 12.02.2015-13.02.2015, Brno]
Institucionální podpora: RVO:68081766 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Toll-like receptors * MHC genes
Kód oboru RIV: EG - Zoologie

Studium funkční variability imunitních genů představuje u volně žijících živočichů ideální systém pro výzkum obecných principů adaptace v koevoluci hostitele a parazita. Koncept mezidruhového polymorfismu (Trans-species polymorfismus, TSP) předpokládá, že působením balancující selekce dochází k přenosu několika výhodných alel od společného předka druhů dceřiným druhům a zároveň k dlouhodobému udržovaní těchto alel. Většina studií zabývajících se TSP se v současnosti zaměřuje především na geny hlavního histokompatibilního komplexu (MHC geny) a jen výrazně menší pozornost je věnována jiným skupinám genů. V těchto studiích jsou navíc jen velmi omezeně testovány další evoluční mechanismy vysvětlující přítomnost sdíleného polymorfismu u příbuzných druhů (jako např. konvergence či introgrese). Cílem této práce je zjistit, zda se TSP vyskytuje u čtyř vybraných genů vrozené i získané imunity na populačním vzorku 384 jedinců 20 druhů sýkor. Pomocí neutrálních markerů chceme odlišit případný TSP od dalších principů vysvětlujících sdílení polymorfismu. Jako geny vrozené imunity jsme vybrali Toll-like receptory (TLR4 a TLR5) a jako geny adaptivní imunity MHC geny (MHC I a MHC IIB). Tyto geny hrají u obratlovců naprosto klíčovou roli pro zajištění imunitní odpovědi proti intracelulárním i extracelulárním parazitům. Pomocí NGS platformy MiSeq (Illumina) chceme osekvenovat vazebné úseky těchto imunitních genů, které přímo fyzicky interagují s patogenními strukturami a nacházejí se tak pod silnou pozitivní selekcí. Dalšími cíli je popsat vnitrodruhovou a mezidruhovou variabilitu těchto vazebných oblastí imunitních genů, identifikovat působení pozitivní selekce, detekovat případnou rekombinaci a na základě neutrálních markerů posoudit míru genového toku mezi druhy. Chceme také testovat hypotézu adaptivní introgrese, tedy přednostní introgresi a udržování výhodných alel imunitních genů v porovnání s neutrálními markery.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0255096