Výsledky vyhledávání
- 1.0569371 - BFÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kejnovský, Eduard - Jedlička, Pavel
Nucleic acids movement and its relation to genome dynamics of repetitive DNA Is cellular and intercellular movement of DNA and RNA molecules related to the evolutionary dynamic genome components?
BioEssays. Roč. 44, č. 4 (2022), č. článku e2100242. ISSN 0265-9247. E-ISSN 1521-1878
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-00258S; GA ČR(CZ) GA21-00580S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna * genome dynamics * horizontal gene transfer * migration * movement * small RNA * transposable elements
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/bies.202100242
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340689 - 2.0568619 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Schley, R. J. - Pellicer, J. - Ge, X. - Barrett, C. - Bellot, S. - Guignard, M. S. - Novák, Petr - Suda, Jan - Fraser, D. - Baker, W. J. - Dodsworth, S. - Macas, Jiří - Leitch, A. R. - Leitch, I. J.
The ecology of palm genomes: repeat-associated genome size expansion is constrained by aridity.
New Phytologist. Roč. 236, č. 2 (2022), s. 433-446. ISSN 0028-646X. E-ISSN 1469-8137
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:67985939
Klíčová slova: adaptation * Arecaceae (palms) * ecology * genome size * phylogenetic regression * plant evolution * trait evolution * transposable elements
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3); Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BU-J)
Impakt faktor: 9.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.18323
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0339892 - 3.0568618 - BC 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hofstatter, P. G. - Thangavel, G. - Lux, T. - Neumann, Pavel - Vondrak, Tihana - Novák, Petr - Zhang, M. - Costa, L. - Castellani, M. - Scott, A. - Toegelová, Helena - Fuchs, J. - Mata-Sucre, Y. - Dias, Y. - Vanzela, A.L.L. - Huettel, B. - Almeida, C. C. S. - Šimková, Hana - Souza, G. - Pedrosa-Harand, A. - Macas, Jiří - Mayer, K. F. X. - Houben, A. - Marques, A.
Repeat-based holocentromeres influence genome architecture and karyotype evolution.
Cell. Roč. 185, č. 17 (2022), s. 3153-3168. ISSN 0092-8674. E-ISSN 1097-4172
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-24252S; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61389030
Klíčová slova: spatial genome organization * holocentric chromosomes * genome regulation * centromere * Rhynchospora * transposable elements * whole-genome duplication
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3); Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (UEB-Q)
Impakt faktor: 64.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867422007978?via%3Dihub#kwrds0010
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0339891 - 4.0562790 - ÚEB 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Varotto, S. - Krugman, T. - Aiese Cigliano, R. - Kashkush, K. - Kondić-Špika, A. - Aravanopoulos, F. A. - Pradillo, M. - Consiglio, F. - Aversano, R. - Pečinka, Aleš - Miladinović, D.
Exploitation of epigenetic variation of crop wild relatives for crop improvement and agrobiodiversity preservation.
Theoretical and Applied Genetics. Roč. 135, č. 11 (2022), s. 3987-4003. ISSN 0040-5752. E-ISSN 1432-2242
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: DNA METHYLATION VARIATION * EMMER WHEAT POPULATIONS * TRANSPOSABLE ELEMENTS
Obor OECD: Biochemical research methods
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1007/s00122-022-04122-y
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0336846Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2022_Varotto_THEORETICAL AND APPLIED GENETICS_3987.pdf 1 1 MB Jiná povolen - 5.0561925 - BÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sammarco, Iris - Pieters, Janto - Salony, S. - Toman, I. - Zolotarov, G. - Lafon Placette, C.
Epigenetic targeting of transposon relics: beating the dead horses of the genome?
Epigenetics. Roč. 17, č. 11 (2022), s. 1331-1344. ISSN 1559-2294. E-ISSN 1559-2308
GRANT EU: European Commission(XE) 764965 - EPIDIVERSE
Institucionální podpora: RVO:67985939 ; RVO:61389030
Klíčová slova: transposable elements * epigenetic silencing * host genome defence * adaptive epimutations * transposable elements relics
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.7, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1080/15592294.2021.2022066
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0336628 - 6.0560041 - BFÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lexa, Matej - Čechová, M. - Nguyen, S. H. - Jedlička, Pavel - Tokan, Viktor - Kubát, Zdeněk - Hobza, Roman - Kejnovský, Eduard
HiC-TE: a computational pipeline for Hi-C data analysis to study the role of repeat family interactions in the genome 3D organization.
Bioinformatics. Roč. 38, č. 16 (2022), s. 4030-4032. ISSN 1367-4803. E-ISSN 1460-2059
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-00580S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: TRANSPOSABLE ELEMENTS * SEQUENCE
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/38/16/4030/6628581?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340534 - 7.0555388 - BFÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Herklotz, V. - Kovařík, Aleš - Wissemann, V. - Lunerová Bedřichová, Jana - Vozárová, Radka - Buschmann, B. - Olbricht, K. - Groth, M. - Ritz, C.
Power and Weakness of Repetition Evaluating the Phylogenetic Signal From Repeatomes in the Family Rosaceae With Two Case Studies From Genera Prone to Polyploidy and Hybridization (Rosa and Fragaria).
Frontiers in Plant Science. Roč. 12, DEC 7 2021 (2021), č. článku 738119. ISSN 1664-462X. E-ISSN 1664-462X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GC20-14133J
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: transposable elements * section caninae * genus rosa * dna-sequences * ribosomal dna * wild roses * genome
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 6.627, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2021.738119/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329905 - 8.0544549 - BFÚ 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Bartas, M. - Bowater, R. P.
Evolution of Diverse Strategies for Promoter Regulation.
Trends in Genetics. Roč. 37, č. 8 (2021), s. 730-744. ISSN 0168-9525. E-ISSN 1362-4555
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: inverted repeat sequences * g-quadruplex structures * dna g-quadruplex * non-b dna * gene-regulation * transposable elements
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 11.821, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168952521000846
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0321397 - 9.0539921 - BFÚ 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lexa, Matej - Jedlička, Pavel - Vanat, I. - Červeňanský, Michal - Kejnovský, Eduard
TE-greedy-nester: structure-based detection of LTR retrotransposons and their nesting.
Bioinformatics. Roč. 36, č. 20 (2020), s. 4991-4999. ISSN 1367-4803. E-ISSN 1460-2059
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-00258S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: transposable elements * visualization * annotation * identification * paleontology
Obor OECD: Biochemical research methods
Impakt faktor: 6.937, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/36/20/4991/5871348
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0317612 - 10.0539877 - BFÚ 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Jedlička, Pavel - Lexa, M. - Kejnovský, Eduard
What Can Long Terminal Repeats Tell Us About the Age of LTR Retrotransposons, Gene Conversion and Ectopic Recombination?
Frontiers in Plant Science. Roč. 11, MAY 20 2020 (2020), č. článku 644. ISSN 1664-462X. E-ISSN 1664-462X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-00258S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: rna-mediated recombination * transposable elements * genome size * evolution * rice * plants
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 5.754, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2020.00644/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0317575