Výsledky vyhledávání
- 1.0542518 - ÚFCH JH 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Petera, Lukáš - Mráziková, Klaudia - Nejdl, L. - Zemánková, K. - Vaculovičová, M. - Pastorek, Adam - Civiš, Svatopluk - Kubelík, Petr - Heays, Alan - Cassone, Giuseppe - Šponer, Jiří - Ferus, Martin - Šponer, Judit E.
Prebiotic Route to Thymine from Formamide-A Combined Experimental-Theoretical Study.
Molecules. Roč. 26, č. 8 (2021), č. článku 2248. E-ISSN 1420-3049
Grant CEP: GA ČR GA19-03314S; GA MŠMT EF16_019/0000778
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:68081707
Klíčová slova: formamide * thymine * uracil * prebiotic chemistry * origin of life
Obor OECD: Physical chemistry; Biochemistry and molecular biology (BFU-R)
Impakt faktor: 4.927, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319915Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0542518.pdf 3 2.4 MB open access Vydavatelský postprint povolen - 2.0501656 - BFÚ 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Chen, J. - Zhang, Y. - Cheng, M. - Guo, Y. - Šponer, Jiří - Monchaud, D. - Mergny, Jean-Louis - Ju, H. - Zhou, J.
How Proximal Nucleobases Regulate the Catalytic Activity of G-Quadruplex/Hemin DNAzymes.
ACS Catalysis. Roč. 8, č. 12 (2018), s. 11352-11361. ISSN 2155-5435. E-ISSN 2155-5435
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-13721S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: repair thymine dimers * peroxidase-activity * activity enhancement * binding-site
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 12.221, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0293649 - 3.0430484 - ÚOCHB 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Dršata, Tomáš - Špačková, Naďa - Jurečka, P. - Zgarbová, M. - Šponer, Jiří - Lankaš, Filip
Mechanical properties of symmetric and asymmetric DNA A-tracts: implications for looping and nucleosome positioning.
Nucleic Acids Research. Roč. 42, č. 11 (2014), s. 7383-7394. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA14-21893S
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) ED2.1.00/03.0058; GA MŠk(CZ) ED1.1.00/02.0068
Program: ED; ED
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68081707
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * sequence-directed curvature * adenine-thymine tract
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 9.112, rok: 2014
http://nar.oxfordjournals.org/content/42/11/7383
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0235562 - 4.0430313 - ÚOCHB 2015 DE eng A - Abstrakt
Tanaka, Y. - Okamoto, I. - Furuita, K. - Šebera, Jakub - Kondo, J. - Torigoe, H. - Urata, H. - Dairaku, T. - Ono, A. - Kojima, C. - Sychrovský, Vladimír
NMR spectroscopic studies on metallo-base-pair in DNA duplex.
Journal of Biological Inorganic Chemistry. Springer. Roč. 19, Suppl 2 (2014), S732-S733. ISSN 0949-8257. E-ISSN 1432-1327.
[European Biological Inorganic Chemistry Conference /12./. 24.08.2014-28.08.2014, Zurich]
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: NMR * DNA * mercury * thymine
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0235298 - 5.0394209 - ÚOCHB 2014 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Haldar, Susanta - Spiwok, V. - Hobza, Pavel
On the Association of the Base Pairs on the Silica Surface Based on Free Energy Biased Molecular Dynamics Simulation and Quantum Mechanical Calculations.
Journal of Physical Chemistry C. Roč. 117, č. 21 (2013), s. 11066-11075. ISSN 1932-7447. E-ISSN 1932-7455
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016
Grant ostatní: Operational Program Research and Development for Innovations(XE) CZ.1.05/2.1.00/03.0058
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: isolated snall peptides * center-dot-thymine * force-field * ab-initio * stacked structures * atomic charges
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.835, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0222541 - 6.0330814 - ÚOCHB 2010 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Rejman, Dominik - Kovačková, Soňa - Pohl, Radek - Dračínský, Martin - Fiedler, Pavel - Rosenberg, Ivan
A convenient, high-yield synthesis of 1-substituted uracil and thymine derivatives.
Tetrahedron. Roč. 65, č. 41 (2009), s. 8513-8523. ISSN 0040-4020. E-ISSN 1464-5416
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06077; GA MŠMT(CZ) LC06061; GA AV ČR KAN200520801; GA ČR GA203/09/0820; GA MZd NR9138
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: uracil * thymine
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 3.219, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0176511 - 7.0329591 - ÚOCHB 2010 GB eng A - Abstrakt
Pohl, Radek - Rulíšek, Lubomír - Rejman, Dominik
Reagents for introduction of thymine and uracil - NMR and DFT study.
[Činidla na výstavbu thyminu a uracilu - NMR a DFT studie.]
Nucleic Acids at the Chemistry - Biology Interface. Manchester: University of Manchester, 2009. s. 68-68.
[Nucleic Acids at the Chemistry - Biology Interface. 07.09.2009-08.09.2009, Manchester]
Grant CEP: GA MZd NR9138; GA MŠMT 2B06065
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: thymine * uracil * NMR * DFT
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0175588 - 8.0329256 - ÚOCHB 2010 CZ eng A - Abstrakt
Pohl, Radek - Rejman, Dominik
Stability of novel reagents for introduction of uracil and thymine monitored by NMR.
[Studium stability nových činidel pro výstavbu uracilu a thyminu pomocí NMR.]
24th NMR Valtice. Central European NMR Meeting. Brno: Masaryk University, 2009. C33-C33. ISBN 978-80-86441-40-5.
[Central European NMR Meeting. NMR Valtice /24./. 26.04.2009-29.04.2009, Valtice]
Grant CEP: GA MŠMT 2B06065; GA MZd NR9138
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: uracil * thymine * NMR
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0175343 - 9.0327968 - ÚOCHB 2010 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Ran, Jiong - Hobza, Pavel
Nature of Bonding in Nine Planar Hydrogen-Bonded Adenine . Thymine Base Pair.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 113, č. 9 (2009), s. 2933-2936. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: adenine...thymine base pair * hydrogen-bonded structures * correlated ab initio calculations
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.471, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0005403 - 10.0327939 - ÚOCHB 2010 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pitoňák, Michal - Janowski, T. - Neogrady, P. - Pulay, P. - Hobza, Pavel
Convergence of the CCSD(T) Correction Term for the Stacked Complex Methyl Adenine-Methyl Thymine: Comparison with Lower-Cost Alternatives.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 5, č. 7 (2009), s. 1761-1766. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA MŠMT LC512
Grant ostatní: NSF(US) CHE0515922; NSF(US) MRE072265; SRDA(SK) APVV-20-018405
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: CCSD(T) correction term * stacked complex * methyl adenine-methyl thymine
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.804, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0174364