Výsledky vyhledávání
- 1.0580396 - MBÚ 2024 RIV US eng M - Část monografie knihy
Štursová, Martina - López-Mondejár, Rubén - Baldrian, Petr
Investigating the Bacterial and Fungal Communities Involved in Dead Biomass Degradation in Forest Soils.
Microbial Environmental Genomics (MEG). New York: Humana, 2023 - (Martin, F.; Uroz, S.), s. 157-168. Methods in Molecular Biology. ISBN 978-1-0716-2870-6
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-14961S; GA ČR(CZ) GA22-30769S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Stable isotope probing * Microbial communities * Soil ecology * Organic matter decomposition * Metagenomics * metatranscriptomics
Obor OECD: Microbiology
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349169 - 2.0576258 - BC 2024 RIV US eng M - Část monografie knihy
Jameson, E. - Taubert, M. - Angel, Roey - Coyotzi, S. - Chen, Y. - Eyice, Ö. - Schäfer, H. - Murrell, J.C. - Neufeld, J.D. - Dumont, M.G.
DNA-, RNA-, and protein-based stable-isotope probing for high-throughput biomarker analysis of active microorganisms.
Metagenomics: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology. New York: Humana, 2023 - (Streit, W.; Daniel, R.), Roč. 2555 (2023), s. 261-282. ISBN 978-1-0716-2794-5
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: DNA * metagenomics * metatranscriptomics * protein * proteomics * RNA * Stable-isotope probing
Obor OECD: Microbiology
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345837 - 3.0564845 - MBÚ 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Vergani, L. - Mapelli, F. - Folkmanová, M. - Papík, J. - Jansa, Jan - Uhlík, O. - Borin, S.
DNA stable isotope probing on soil treated by plant biostimulation and flooding revealed the bacterial communities involved in PCB degradation.
Scientific Reports. Roč. 12, č. 1 (2022), č. článku 19232. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
GRANT EU: European Commission(CZ) 841317
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Polychlorinated biphenyl (PCB) * microbial PCB degraders * stable isotope probing SIP incubation * illumina MiSeq * sequencing * soil bacterial communities * Betaproteobacteria * Actinobacteria
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-022-23728-2
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0336409 - 4.0563402 - BÚ 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Forczek, S. T. - Bukovská, P. - Püschel, David - Janoušková, Martina - Blažková, Alena - Jansa, J.
Drought rearranges preferential carbon allocation to arbuscular mycorrhizal community members co-inhabiting roots of Medicago truncatula.
Environmental and Experimental Botany. Roč. 199, JUL 2022 (2022), č. článku 104897. ISSN 0098-8472. E-ISSN 1873-7307
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-12166S
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: arbuscular mycorrhizal symbiosis * drought stress * quantitative stable isotope probing (qSIP)
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 5.7, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.envexpbot.2022.104897
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0336067 - 5.0562838 - MBÚ 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Forczek, Sándor Tamas - Bukovská, Petra - Püschel, David - Janoušková, M. - Blažková, A. - Jansa, Jan
Drought rearranges preferential carbon allocation to arbuscular mycorrhizal community members co-inhabiting roots of Medicago truncatula.
Environmental and Experimental Botany. Roč. 199, JUL 2022 (2022), č. článku 104897. ISSN 0098-8472. E-ISSN 1873-7307
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-12166S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Arbuscular mycorrhizal symbiosis * 13 C isotopic labeling * Drought stress * Environmental context * Signature fatty acids * Quantitative stable isotope probing (qSIP) * Species competition * Synthetic communities
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.7, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0098847222001198?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0335028 - 6.0550065 - MBÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Polerecky, L. - Eichner, Meri - Masuda, Takako - Zavřel, Tomáš - Rabouille, S. - Campbell, D. A. - Halsey, K.
Calculation and Interpretation of Substrate Assimilation Rates in Microbial Cells Based on Isotopic Composition Data Obtained by nanoSIMS.
Frontiers in Microbiology. Roč. 12, NOV 30 2021 (2021), č. článku 621634. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-17627S; GA ČR(CZ) GJ20-02827Y; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA MŠMT(CZ) EF16_027/0007990
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652079
Klíčová slova: stable isotope probing * assimilation rates * storage inclusions * cell growth model
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 6.064, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03469894/
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0325915 - 7.0536304 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Wu, W. - Meador, Travis Blake - Könneke, M. - Elvert, M. - Wegener, G. - Hinrichs, K.-U.
Substrate-dependent incorporation of carbon and hydrogen for lipid biosynthesis by Methanosarcina barkeri.
Environmental Microbiology Reports. Roč. 12, č. 5 (2020), s. 555-567. ISSN 1758-2229. E-ISSN 1758-2229
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015075; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001782
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: stable isotope probing * carbon fixation * methanogen * anaplerotic
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.541, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/pdfdirect/10.1111/1758-2229.12876
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0315096 - 8.0472656 - MBÚ 2017 RIV US eng M - Část monografie knihy
Větrovský, Tomáš - Štursová, Martina - Baldrian, Petr
Fungal Communities in Soils: Soil Organic Matter Degradation.
Microbial Environmental Genomics (MEG). Totowa: HUMANA PRESS INC, 2016 - (Martin, F.; Uroz, S.), 89-100-89-100. Methods in Molecular Biology. ISBN 978-1-4939-3369-3
Grant CEP: GA ČR GA13-06763S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Stable isotope probing * Microbial communities * Soil ecology
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0269905 - 9.0454407 - ÚMG 2016 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Wald, J. - Hroudová, Miluše - Jansa, Jan - Vrchotová, B. - Macek, T. - Uhlík, O.
Pseudomonads Rule Degradation of Polyaromatic Hydrocarbons in Aerated Sediment.
Frontiers in Microbiology. Roč. 6, č. 1268 (2015). ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:61388971
Klíčová slova: biodegradation * polyaromatic hydrocarbons * stable isotope probing
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 4.165, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0255088 - 10.0371337 - ÚOCHB 2012 RIV GB eng M - Část monografie knihy
Uhlík, O. - Musilová, L. - Demnerová, K. - Macek, Tomáš - Macková, M.
Stable isotope probing: uses in metagenomics.
Metagenomics: Current Innovations and Future Trends. Wymondham: Caister Academic Press, 2011 - (Marco, D.), s. 89-97. ISBN 978-1-904455-87-5
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: Metagenomics * stable isotope probing * high-throughput sequencing * microbial ecology
Kód oboru RIV: EI - Biotechnologie a bionika
http://www.horizonpress.com/metagenomics-advances
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0204874