Výsledky vyhledávání
- 1.0579881 - ÚMG 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Durydivka, Oleh - Gazdarica, Matej - Večerková, Kateřina - Radenkovic, Silvia - Blahoš, Jaroslav
Multiple Sgip1 splice variants inhibit cannabinoid receptor 1 internalization.
Gene. Roč. 892, Jan (2024), č. článku 147851. ISSN 0378-1119. E-ISSN 1879-0038
Grant CEP: GA ČR GA19-24172S; GA ČR GA21-02371S; GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA MŠMT LM2023036; GA MŠMT EF18_046/0015861
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: amino-acid-composition * protein-phosphorylation * platform * association * enrichment * domain * Alternative splicing * Cannabinoid receptor * Clathrin-mediated endocytosis * Isoform * Molecular cloning * RNA
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 3.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378111923006923?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0348669 - 2.0575856 - ÚEB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Timofeyenko, Ksenia - Kanavalau, D. - Alexiou, P. - Kalyna, M. - Růžička, Kamil
Catsnap: a user-friendly algorithm for determining the conservation of protein variants reveals extensive parallelisms in the evolution of alternative splicing.
New Phytologist. Roč. 238, č. 4 (2023), s. 1722-1732. ISSN 0028-646X. E-ISSN 1469-8137
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-08067S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000738
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: alternative splicing * bioinformatics * determinism * isoforms * machine learning * molecular evolution * transcriptome
Obor OECD: Environmental biotechnology
Impakt faktor: 9.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/nph.18799
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345561Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2023_Timofeyenko_New Phytologist_1722___@@@.pdf 1 887.1 KB Jiná povolen - 3.0574060 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Trsová, I. - Hruštincová, A. - Krejčík, Z. - Kundrát, D. - Holoubek, A. - Štaflová, Karolína - Janstová, L. - Vaníková, Š. - Szikszai, K. - Kléma, J. - Ryšavý, P. - Beličková, M. - Kaisrlíková, M. - Veselá, J. - Čermák, J. - Jonášová, A. - Dostál, Jiří - Frič, J. - Musil, J. - Dostálová Merkerová, M.
Expression of circular RNAs in myelodysplastic neoplasms and their association with mutations in the splicing factor gene SF3B1.
Molecular Oncology. Roč. 17, č. 12 (2023), s. 2565-2583. ISSN 1574-7891. E-ISSN 1878-0261
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: circular RNA * myelodysplastic neoplasms * SF3B1 * splicing * ZEB1
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/1878-0261.13486
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344427
Vědecká data: NCBI SRA - 4.0570767 - ÚMG 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Klimešová, Klára - Petržílková, Hana - Bařinka, Cyril - Staněk, David
SART3 associates with a post-splicing complex.
Journal of Cell Science. Roč. 136, č. 2 (2023), č. článku jcs260380. ISSN 0021-9533. E-ISSN 1477-9137
Grant CEP: GA ČR GA21-04132S
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:86652036
Klíčová slova: Splicing * Recycling * U6 snRNA * U2 snRNP
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://journals.biologists.com/jcs/article-abstract/136/2/jcs260380/286729/SART3-associates-with-a-post-splicing-complex?redirectedFrom=fulltext
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342107 - 5.0565617 - ÚEB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kashkan, Ivan - Timofeyenko, Ksenia - Růžička, Kamil
How alternative splicing changes the properties of plant proteins.
Quantitative Plant Biology. Roč. 3, Jul (2022), č. článku e14. E-ISSN 2632-8828
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000738
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: alternative splicing * competitive inhibition * feedback loop
Obor OECD: Biochemical research methods
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1017/qpb.2022.9
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0337134Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2022_Kashkan_Quantitative Plant Biology_e14.pdf 2 573 KB Jiná povolen - 6.0562222 - ÚBO 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Liu, M. - Yu, C. - Zhang, Z. - Song, M. - Sun, X. - Piálek, Jaroslav - Jacob, J. - Lu, J. - Cong, L. - Zhang, H. - Wang, Y. - Li, G. - Feng, Z. - Du, Z. - Wang, M. - Wan, X. - Wang, D. - Wang, Y.-L. - Li, H. - Wang, Z. - Zhang, B. - Zhang, Z.
Whole-genome sequencing reveals the genetic mechanisms of domestication in classical inbred mice.
Genome Biology. Roč. 23, č. 1 (2022), č. článku 203. ISSN 1474-760X. E-ISSN 1474-760X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-23773S
Institucionální podpora: RVO:68081766
Klíčová slova: Mus musculus * Domestication * Positively selected gene * Genome sequencing * Alternative splicing
Obor OECD: Zoology
Impakt faktor: 12.3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-022-02772-1
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0334839Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0562222.pdf 0 3.3 MB Vydavatelský postprint povolen - 7.0560424 - ÚEM 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Arzalluz-Luque, A. - Cabrera, J.L. - Skottman, H. - Benguria, A. - Bolinches-Amorós, A. - Cuenca, N. - Lupo, V. - Dopazo, A. - Tarazona, S. - Delas, B. - Carballo, M. - Pascual, B. - Hernan, I. - Erceg, Slaven - Lukovic, D.
Mutant PRPF8 Causes Widespread Splicing Changes in Spliceosome Components in Retinitis Pigmentosa Patient iPSC-Derived RPE Cells.
Frontiers in Neuroscience. Roč. 15, apr. (2021), č. článku 636969. E-ISSN 1662-453X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-04393S; GA MŠMT(CZ) EF15_003/0000419
Institucionální podpora: RVO:68378041
Klíčová slova: iPSC * RPE * RNA-Seq * retinitis pigmentosa * pre-mRNA splicing
Obor OECD: Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions (pharmacogenomics, gene-based therapeutics)
Impakt faktor: 5.152, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fnins.2021.636969/full
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0333345 - 8.0559398 - BC 2023 RIV SE eng J - Článek v odborném periodiku
Selinger, Martin - Věchtová, P. - Tykalová, Hana - Oslejskova, P. - Rumlová, M. - Štěrba, J. - Grubhoffer, Libor
Integrative RNA profiling of TBEV-infected neurons and astrocytes reveals potential pathogenic effectors.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 20, JUN (2022), s. 2759-2777. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTARF18021; GA ČR(CZ) GA18-27204S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Alternative splicing * Astrocytes * miRNA * Neurons * Response to infection * Neuropathogenesis * Tick-borne encephalitis virus * Transcriptomics
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037022002070?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340284 - 9.0556808 - FGÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Lusk, R. - Hoffman, P.L. - Mahaffey, S. - Rosean, S. - Smith, H. - Šilhavý, Jan - Pravenec, Michal - Tabakoff, B. - Saba, L. M.
Beyond Genes: Inclusion of Alternative Splicing and Alternative Polyadenylation to Assess the Genetic Architecture of Predisposition to Voluntary Alcohol Consumption in Brain of the HXB/BXH Recombinant Inbred Rat Panel.
Frontiers in genetics. Roč. 13, Mar 15 (2022), č. článku 821026. E-ISSN 1664-8021
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-04420S
Grant ostatní: AV ČR(CZ) AP1502
Program: Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:67985823
Klíčová slova: voluntary alcohol consumption * alternative splicing * alternative polyadenylation * HXB/BXH recombinant inbred strains
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fgene.2022.821026
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0331116 - 10.0555576 - BFÚ 2022 RIV SE eng J - Článek v odborném periodiku
Vičar, Tomáš - Gumulec, J. - Kolář, R. - Kopečná, Olga - Pagáčová, Eva - Falková, Iva - Falk, Martin
DeepFoci: Deep learning-based algorithm for fast automatic analysis of DNA double-strand break ionizing radiation-induced foci.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 19, DEC 2021 (2021), s. 6465-6480. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Grant CEP: GA ČR GC20-04109J; GA ČR(CZ) GA19-09212S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: alternative splicing variant * complex cell responses * gamma-h2ax foci * chromatin-structure * h2ax phosphorylation * nanoscopy techniques * histone h2ax
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.155, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037021004840?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0330038