Výsledky vyhledávání
- 1.0582377 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Valková, Natalia - Dobrovolná, Michaela - Mergny, Jean-Louis
Abundance of G-Quadruplex Forming Sequences in the Hepatitis Delta Virus Genomes.
ACS Omega. Roč. 9, č. 3 (2024), s. 4096-4101. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: rna g-quadruplex * dna
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.3c09288
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352960 - 2.0574950 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Qiu, D. - Cheng, M. - Stadlbauer, Petr - Chen, J. - Langer, M. - Zhang, X. - Gao, Q. - Ju, H. - Šponer, Jiří - Mergny, Jean-Louis - Monchaud, D. - Zhou, J.
Topology of DNA G-Quadruplexes Can Be Harnessed in Holliday Junction-Based DNA Suprastructures to Control and Optimize Their Biocatalytic Properties.
ACS Catalysis. Roč. 13, č. 16 (2023), s. 10722-10733. ISSN 2155-5435. E-ISSN 2155-5435
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA21-23718S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G-quadruplex * DNAzyme * Holliday junction * molecular dynamics simulations * catalytic mechanism
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 12.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acscatal.3c02818
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349523 - 3.0574524 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Valková, Natalia - Kratochvilova, L. - Martinková, L. - Brázda, Václav
Dual mode of IFI16 binding to supercoiled and linear DNA: A closer insight.
Biochemical and Biophysical Research Communications. Roč. 667, JUL 30 2023 (2023), s. 89-94. ISSN 0006-291X. E-ISSN 1090-2104
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: ifi16 * Superhelicity * dna * afm * G-quadruplex * Inverted repeat
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.1, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006291X23006125?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349252 - 4.0574518 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Ferret, L. - Alvarez-Valadez, K. - Riviere, J. - Muller, A. - Bohalova, Natalia - Yu, L. - Guittat, L. - Brázda, Václav - Kroemer, G. - Mergny, Jean-Louis - Djavaheri-Mergny, M.
G-quadruplex ligands as potent regulators of lysosomes.
Autophagy. Roč. 19, č. 7 (2023), s. 1901-1915. ISSN 1554-8627. E-ISSN 1554-8635
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Autophagy * guanine-quadruplex * lysosome membrane permeabilization * tfeb * transcriptional regulation
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 13.3, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/15548627.2023.2170071
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350465 - 5.0574514 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Goswami, Pratik - Šislerová, Lucie - Dobrovolná, Michaela - Havlík, J. - Šťastný, J. - Brázda, Václav
Interaction of C-terminal p53 isoforms depends strongly upon DNA sequence and topology.
Biochimie. Roč. 208, MAY 2023 (2023), s. 93-99. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: p53 isoforms * G-quadruplex * Atomic force microscopy * p53-DNA binding * Supercoiled DNA
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908422003352?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350064 - 6.0574511 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Stadlbauer, Petr - Mlýnský, Vojtech - Krepl, Miroslav - Šponer, Jiří
Complexity of Guanine Quadruplex Unfolding Pathways Revealed by Atomistic Pulling Simulations.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 63, č. 15 (2023), s. 4716-4731. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-23718S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: TELOMERIC G-QUADRUPLEX * DNA G-QUADRUPLEXES * MOLECULAR-DYNAMICS
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.3c00171
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350040 - 7.0572387 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Dobrovodský, Daniel - Di Primo, C.
Do conformational changes contribute to the surface plasmon resonance signal?
Biosensors and Bioelectronics. Roč. 232, JUL 15 2023 (2023), č. článku 115296. ISSN 0956-5663. E-ISSN 1873-4235
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Surface plasmon resonance * Conformational change * G-quadruplex * Refractive index increment * Thrombin binding aptamer
Obor OECD: Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)
Impakt faktor: 12.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0956566323002385?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350035 - 8.0571535 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Havlík, J. - Brázda, Václav - Stanek, K. - Ježek, M. - Šťastný, J.
Feature-overlapper: The tool for DNA analysis overlap.
SOFTWARE IMPACTS. Roč. 16, MAY 2023 (2023), č. článku 100498. ISSN 2665-9638
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna * R-loop * G-quadruplex * Annotation
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 2.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2665963823000350?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349900 - 9.0571533 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Školáková, Petra - Gajarský, M. - Palacký, Jan - Šubert, Denis - Renčiuk, Daniel - Trantírek, L. - Mergny, Jean-Louis - Vorlíčková, Michaela
DNA i-motif formation at neutral pH is driven by kinetic partitioning.
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 6 (2023), s. 2950-2962. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-17063S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G-QUADRUPLEX * THERMODYNAMICS * STABILITY * PROMOTER
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/51/6/2950/7076469?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349778 - 10.0571529 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Jedlička, Pavel - Tokan, Viktor - Kejnovská, Iva - Hobza, Roman - Kejnovský, Eduard
Telomeric retrotransposons show propensity to form G-quadruplexes in various eukaryotic species.
Mobile DNA. Roč. 14, č. 1 (2023), č. článku 3. ISSN 1759-8753. E-ISSN 1759-8753
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-00580S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Telomere * G-quadruplex * Retrotransposon * Drosophila * Het-A * tart * tahre
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 4.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://mobilednajournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13100-023-00291-9
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345689