Výsledky vyhledávání
- 1.0542712 - MBÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Piwosz, Kasia - Mukherjee, Indranil - Salcher, Michaela M. - Grujcic, V. - Šimek, Karel
CARD-FISH in the Sequencing Era: Opening a New Universe of Protistan Ecology.
Frontiers in Microbiology. Roč. 12, MAR 4 2021 (2021), č. článku 640066. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ18-14095Y; GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417; GA ČR(CZ) GA13-00243S
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: aquatic microbial food webs * card-fish * grazing by protists * protists * unicellular eukaryotes * bacterivorous * omnivorous and predatory flagellates * heterotrophic and mixotrophic flagellates
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 6.064, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2021.640066/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320081 - 2.0538633 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Grujčič, Vesna - Mukherjee, Indranil - Kasalický, Vojtěch - Nedoma, Jiří - Posch, T. - Mehrshad, Maliheh - Salcher, Michaela M.
Cascading effects in freshwater microbial food webs by predatory Cercozoa, Katablepharidacea and ciliates feeding on aplastidic bacterivorous cryptophytes.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 96, č. 10 (2020), č. článku fiaa121. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ciliates * bacterivorous and predatory flagellates * Cercozoa * Cryptophyceae * freshwater microbial food webs * Katablepharidacea
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 4.194, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/femsec/fiaa121
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0316400Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup SIMEK FEMS Microbiol Ecol 2020.pdf 0 3.9 MB Autorský preprint povolen - 3.0510316 - BC 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Sirová, Dagmara
Fluorescently Labeled Bacteria as a Tracer to Reveal Novel Pathways of Organic Carbon Flow in Aquatic Ecosystems.
Jove-Journal of Visualized Experiments. Roč. 151, Sep (2019), č. článku e59903. ISSN 1940-087X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR(CZ) GA19-16554S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: environmental sciences * aquatic microbial food webs * carbon
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 1.163, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.jove.com/video/59903/fluorescently-labeled-bacteria-as-tracer-to-reveal-novel-pathways
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0301298 - 4.0397010 - BC 2014 CZ cze B - Monografie kniha jako celek
Rulík, M. - Baudišová, D. - Růžička, J. - Šimek, Karel
Mikrobiální ekologie vod.
[Aquatic mnicrobial ecology (textbook).]
Olomouc: Univerzita Palackého v Olomouci, 2013. 292 s. Skripta. ISBN 978-80-244-3477-3
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: freshwater * microbial ecology * microbial growth * microbial food webs
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0224662 - 5.0150575 - HBU-Z 20033062 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Mašín, Michal - Jezbera, Jan - Nedoma, Jiří - Straškrábová, Viera - Hejzlar, Josef - Šimek, Karel
Changes in bacterial community composition and microbial activities along the longitudinal axis of two canyon-shaped reservoirs with different inflow loading.
Hydrobiologia. Roč. 504, - (2003), s. 99-113. ISSN 0018-8158. E-ISSN 1573-5117.
[Reservoir Limnology and Water Quality /4./. České Budějovice, 12.08.2002-16.08.2002]
Grant CEP: GA ČR GA206/99/0028; GA ČR GA206/02/0003
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z6017912
Klíčová slova: reservoirs * microbial food webs * bacterial production and community composition
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 0.720, rok: 2003
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0048105 - 6.0150574 - HBU-Z 20033061 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Comerma, M. - García, J. C. - Romero, M. - Armengol, J. - Šimek, Karel
Carbon flow dynamics in the pelagic community of the Sau Reservoir (Catalonia, NE Spain).
Hydrobiologia. Roč. 504, - (2003), s. 87-98. ISSN 0018-8158. E-ISSN 1573-5117.
[Reservoir Limnology and Water Quality /4./. České Budějovice, 12.08.2002-16.08.2002]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z6017912
Klíčová slova: reservoir * longitudinal plankton succession * carbon flow through microbial food webs
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 0.720, rok: 2003
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0048104 - 7.0150524 - HBU-Z 20033011 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Horňák, K. - Mašín, M. - Christaki, U. - Nedoma, Jiří - Weinbauer, M. G. - Dolan, J. R.
Comparing the effects of resource enrichment and grazing on a bacterioplankton community of a meso-eutrophic reservoir.
Aquatic Microbial Ecology. Roč. 31, č. 2 (2003), s. 123-135. ISSN 0948-3055. E-ISSN 1616-1564
Grant CEP: GA ČR GA206/99/0028; GA ČR GA206/02/0003; GA MŠMT KONTAKT 22-2000/9513514
Grant ostatní: CNRS(FR) PICS 1111
Výzkumný záměr: CEZ:MSM 123100004
Klíčová slova: reservoir * top-down and bottom-up control * microbial food webs
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 2.116, rok: 2003
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0048056 - 8.0150370 - HBU-Z 20013095 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Armengol, J. - Comerma, M. - Garcia, J. C. - Kojecká, P. - Nedoma, Jiří - Hejzlar, Josef
Changes in the epilimnetic bacterial community composition, production, and protist-induced mortality along the longitudinal axis of a highly eutrophic reservoir.
Microbial Ecology. Roč. 42, - (2001), s. 359-371. ISSN 0095-3628. E-ISSN 1432-184X
Grant CEP: GA ČR GA206/99/0028; GA ČR GA206/98/0727; GA AV ČR IPP1011802
Grant ostatní: SIMCST(ES) CICYT HID99-599-CO2-O1
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z6017912
Klíčová slova: bacterial community composition * eutrophic reservoir * microbial food webs
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 2.891, rok: 2001
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0047908 - 9.0104282 - HBU-Z 20043017 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Jezbera, Jan - Horňák, Karel - Vrba, Jaroslav - Seďa, Jaromír
Role of diatom-attached choanoflagellates of the genus Salpingoeca as pelagic bacterivores.
[Role přisedlých choanoflagelátů rodu Salpingoeca jako konzumentů bakterioplanktonu.]
Aquatic Microbial Ecology. Roč. 36, č. 3 (2004), s. 257-269. ISSN 0948-3055. E-ISSN 1616-1564
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA206/02/0003
Klíčová slova: reservoir * microbial food webs * protistan bacterivory
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 2.255, rok: 2004
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0011556 - 10.0024837 - HBU-Z 2006 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Horňák, Karel - Jezbera, Jan - Mašín, Michal - Nedoma, Jiří - Gasol, J. M. . - Schauer, M.
Influence of top-down and bottom-up manipulations on the R-BT065 subcluster of Betaproteobacteria, an abundant group in bacterioplankton of a freshwater reservoir.
[Vliv pokusných manipulací s dostupností substrátu a intenzitou predace na dynamiku početné podskupiny bakterioplanktonu (podskupina R-BT065 z Betaproteobacteria) přehradní nádrže.]
Applied and Environmental Microbiology. Roč. 71, č. 5 (2005), s. 2381-2390. ISSN 0099-2240. E-ISSN 1098-5336
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA206/05/0007; GA ČR(CZ) GA206/02/0003
Grant ostatní: CSIC(ES) DGICYT REN2001-2120/MAR; EU(XE) EVK3-CT-2002-00078; Austrian Science Foundation(AT) P15655
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z60170517
Klíčová slova: reservoir * top-down and bottom-up control * microbial food webs * bacterivory * bacterial community composition
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 3.818, rok: 2005
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0115319