Výsledky vyhledávání
- 1.0583694 - ÚMG 2025 GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kvapilová, K. - Misenko, P. - Radvanszky, J. - Brzon, O. - Budis, J. - Gazdarica, J. - Pos, O. - Korabecna, M. - Kašný, M. - Szemes, T. - Kvapil, P. - Pačes, Jan - Kozmik, Zbyněk
Validated WGS and WES protocols proved saliva-derived gDNA as an equivalent to blood-derived gDNA for clinical and population genomic analyses.
BMC Genomics. Roč. 25, č. 1 (2024), č. článku 187. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Genomics variant analysis * Saliva-derived gDNA * Whole genome sequencing * Whole exome sequencing * Validation guideline
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-024-10080-0
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352871 - 2.0580941 - BC 2024 RIV GB eng O - Ostatní výsledky
Barth, J.M.I. - Handley, S.A. - Kintzl, D. - Leonard, G. - Malinsky, M. - Matschiner, M. - Meyer, B.S. - Salzburger, W. - Štefka, Jan - Trucchi, E.
The history and organization of the Workshop on Population and Speciation Genomics.
2023. Evolution: Education and Outreach. BioMed Central. Roč. 16, FEB (2023), č. článku 2. ISSN 1936-6426. E-ISSN 1936-6434
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: organization * Workshop on population * genome sequencing
Obor OECD: Microbiology
Způsob publikování: Open access
https://evolution-outreach.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12052-023-00182-w#Ack1
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352391 - 3.0580269 - MBÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Jeřábková, M. - Šmrhová, T. - Lopez-Echartea, E. - Dresler, J. - Šuman, J. - Kapinusová, G. - Cajthaml, Tomáš - Škrob, Zdena - Kyclt, R. - Fagerman, J. - Strejček, M. - Uhlík, O.
Silvimonas soli sp. nov., a new member of Chromobacteriaceae isolated from soil in Norrbyskär island, Sweden
.
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Roč. 73, č. 9 (2023), č. článku 006048. ISSN 1466-5026. E-ISSN 1466-5034
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023055
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: 16S rRNA gene analysis * Chromobacteriaceae * Norrbyskär * novel species * Silvimonas * soil bacteria and whole genome sequencing
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijsem.0.006048
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349020 - 4.0579314 - ÚEB 2024 RIV IN eng J - Článek v odborném periodiku
Doležel, Jaroslav - Urbiš, Petr - Said, Mahmoud - Lucretti, S. - Molnár, I.
Flow cytometric analysis and sorting of plant chromosomes.
NUCLEUS. Roč. 66, č. 3 (2023), s. 355-369. ISSN 0029-568X
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: Chromosome sorting * Flow cytometry * Gene cloning * Genome sequencing * Physical mapping
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1007/s13237-023-00450-6
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0348149Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2023_Dolezel_NUCLEUS_355.pdf 1 3.2 MB Jiná povolen - 5.0575164 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Albanaz, A.T.S. - Carrington, M. - Frolov, A. - Ganyukova, A.I. - Gerasimov, E. S. - Kostygov, A.Y. - Lukeš, Julius - Malysheva, M. N. - Votýpka, Jan - Zakharova, A. - Záhonová, Kristýna - Zimmer, S.L. - Yurchenko, V. - Butenko, Anzhelika
Shining the spotlight on the neglected: new high-quality genome assemblies as a gateway to understanding the evolution of Trypanosomatidae.
BMC Genomics. Roč. 24, č. 1 (2023), č. článku 471. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA22-14356S; GA ČR(CZ) GA23-07695S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Trypanosomatids * Genome assembly * Whole-genome sequencing * Monoxenous * Dixenous * Parasite * Protist
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-023-09591-z
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345274 - 6.0566945 - MBÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Maritan, E. - Gallo, M. - Šrůtková, Dagmar - Jelínková, Anna - Benada, Oldřich - Kofroňová, Olga - Silva-Soares, N. F. - Hudcovic, Tomáš - Gifford, I. - Barrick, J. E. - Schwarzer, Martin - Martino, M. E.
Gut microbe Lactiplantibacillus plantarum undergoes different evolutionary trajectories between insects and mammals.
BMC BIOLOGY. Roč. 20, č. 1 (2022), č. článku 290. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA ČR(CZ) GM21-19640M
Grant ostatní: EMBO European Molecular Biology Organization(CZ) 4139 EMBO
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Drosophila melanogaster * Experimental evolution * Gut microbiota evolution * Host–microbe symbiosis * Lactiplantibacillus plantarum * Mouse * Whole genome sequencing
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-022-01477-y
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0338210 - 7.0566474 - MBÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vodickova, P. - Šuman, J. - Benešová, E. - Strejček, M. - Neumann-Schaal, M. - Cajthaml, Tomáš - Rídl, Jakub - Pajer, P. - Ulbrich, P. - Uhlík, O. - Lipovová, P.
Arthrobacter polaris sp. nov., a new cold-adapted member of the family Micrococcaceae isolated from Antarctic fellfield soil.
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Roč. 72, č. 10 (2022), č. článku 005541. ISSN 1466-5026. E-ISSN 1466-5034
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:68378050
Klíčová slova: Antarctica * Arthrobacter * cold-adapted microorganisms * Micrococcaceae * whole-genome sequencing
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (UMG-J)
Impakt faktor: 2.8, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijsem.0.005541
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0337797 - 8.0562222 - ÚBO 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Liu, M. - Yu, C. - Zhang, Z. - Song, M. - Sun, X. - Piálek, Jaroslav - Jacob, J. - Lu, J. - Cong, L. - Zhang, H. - Wang, Y. - Li, G. - Feng, Z. - Du, Z. - Wang, M. - Wan, X. - Wang, D. - Wang, Y.-L. - Li, H. - Wang, Z. - Zhang, B. - Zhang, Z.
Whole-genome sequencing reveals the genetic mechanisms of domestication in classical inbred mice.
Genome Biology. Roč. 23, č. 1 (2022), č. článku 203. ISSN 1474-760X. E-ISSN 1474-760X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-23773S
Institucionální podpora: RVO:68081766
Klíčová slova: Mus musculus * Domestication * Positively selected gene * Genome sequencing * Alternative splicing
Obor OECD: Zoology
Impakt faktor: 12.3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-022-02772-1
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0334839Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0562222.pdf 0 3.3 MB Vydavatelský postprint povolen - 9.0557084 - MBÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Sedláček, I. - Holochová, P. - Busse, H. - Koublová, V. - Králová, S. - Švec, P. - Sobotka, Roman - Staňková, E. - Pilný, Jan - Šedo, O. - Smolíková, J. - Sedlář, K.
Characterisation of Waterborne Psychrophilic Massilia Isolates with Violacein Production and Description of Massilia antarctica sp. nov.
Microorganisms. Roč. 10, č. 4 (2022), č. článku 704. E-ISSN 2076-2607
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127; CzechPolar2 - 90078
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: emended description * lipid-composition * bacteria * genome * database * soil * gene * classification * degradation * restriction * Massilia * violacein * psychrophilic * description * whole-genome sequencing * Antarctica
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2076-2607/10/4/704
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0331255 - 10.0555017 - ÚMG 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lopez-Echartea, E. - Šuman, J. - Šmrhová, T. - Rídl, Jakub - Pajer, P. - Strejček, M. - Uhlík, O.
Genomic analysis of dibenzofuran-degrading Pseudomonas veronii strain Pvy reveals its biodegradative versatility.
G3-Genes, Genomes, Genetics. Roč. 11, č. 2 (2021), č. článku jkaa030. ISSN 2160-1836. E-ISSN 2160-1836
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR-CZ - 90047
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Pseudomonas veronii strain Pvy * biodegradation * dioxygenase * dibenzofuran * whole-genome sequencing * nanopore technology * denitrification * organic phosphate mineralization * heavy-metal tolerance
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.542, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/g3journal/article/11/2/jkaa030/6029021?login=false
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329634