Výsledky vyhledávání
- 1.0549886 - ÚEB 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Xing, L. - Yuan, L. - Lv, Z. - Wang, Q. - Yin, C. - Huang, Z. - Liu, J. - Cao, S. - Zhang, R. - Chen, P. - Karafiátová, Miroslava - Vrána, Jan - Bartoš, Jan - Doležel, Jaroslav - Cao, A.
Long-range assembly of sequences helps to unravel the genome structure and small variation of the wheat–Haynaldia villosa translocated chromosome 6VS.6AL.
Plant Biotechnology Journal. Roč. 19, č. 8 (2021), s. 1567-1578. ISSN 1467-7644. E-ISSN 1467-7652
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: Chicago long-range linkage assembly * genome annotation * InDel markers * physical bin map * wheat–Haynaldia villosa translocation line T6VS·6AL
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.263, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
http://doi.org/10.1111/pbi.13570
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0325777Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2021_Xing_PLANT BIOTECHNOLOGY JOURNAL_1567.pdf 1 2.6 MB Jiná povolen - 2.0549498 - ÚEB 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Fernandez-Pozo, N. - Metz, T. - Chandler, J. O. - Gramzow, L. - Mérai, Z. - Maumus, F. - Mittelsten Scheid, O. - Theißen, G. - Schranz, M. E. - Leubner-Metzger, Gerhard - Rensing, S. A.
Aethionema arabicum genome annotation using PacBio full-length transcripts provides a valuable resource for seed dormancy and Brassicaceae evolution research.
Plant Journal. Roč. 106, č. 1 (2021), s. 275-293. ISSN 0960-7412. E-ISSN 1365-313X
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: Aethionema arabicum * alternative splicing * Brassicaceae evolution * genome annotation * Iso-seq * seed germination * transcription factors
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.091, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
http://doi.org/10.1111/tpj.15161
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0325491Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2021_Fernandez-Pozo_PLANT JOURNAL_275.pdf 1 1.4 MB Jiná povolen - 3.0523026 - BC 2020 RIV eng U - Uspořádání akce
Macas, Jiří - Novák, Petr - Neumann, Pavel
8th Workshop on the Application of Next Generation Sequencing to Repetitive DNA Analysis in Plants.
[České Budějovice, 21.05.2019-23.05.2019, (W-WRD 44/28)]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: RepeatExplorer * genomics * genome annotation * repetitive sequences
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
http://repeatexplorer.org/?page_id=1046
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0307441 - 4.0505457 - ÚEB 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lonardi, S. - Muñoz-Amatriaín, M. - Liang, Q. - Shu, S. - Wanamaker, S. - Lo, S. - Tanskanen, J. - Schulman, A. H. - Zhu, T. - Luo, M.C. - Alhakami, H. - Ounit, R. - Hasan, A. M. - Verdier, J. - Roberts, P. A. - Santos, J. R.P. - Ndeve, A. - Doležel, Jaroslav - Vrána, Jan - Hokin, S. A. - Farmer, A. D. - Cannon, S. B. - Close, T.J.
The genome of cowpea (Vigna unguiculata [L.] Walp.).
Plant Journal. Roč. 98, č. 5 (2019), s. 767-782. ISSN 0960-7412. E-ISSN 1365-313X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LO1204
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: chromosomal inversion * cowpea * domestication * genome annotation * genome evolution * genome size * legumes * next-generation sequencing * Phaseolus vulgaris * repetitive elements * Vigna unguiculata
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 6.141, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
http://doi.org/10.1111/tpj.14349
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0296954Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2019_Lonardi_PLANT JOURNAL_767.pdf 1 1.1 MB Jiná povolen - 5.0502912 - BC 2019 RIV eng U - Uspořádání akce
Macas, Jiří - Novák, Petr - Neumann, Pavel
7th Workshop on the Application of Next Generation Sequencing to Repetitive DNA Analysis in Plants.
[České Budějovice, 22.05.2018-24.05.2018, (W-WRD 48/33)]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genomics * RepeatExplorer * genome annotation * repetitive sequences
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
http://repeatexplorer.org/?page_id=14
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0294754 - 6.0495205 - MBÚ 2019 RIV JP eng J - Článek v odborném periodiku
Kopejtka, Karel - Tomasch, J. - Bunk, B. - Sproeer, C. - Wagner-Doebler, I. - Koblížek, Michal
The complete genome sequence of Rhodobaca barguzinensis alga05 (DSM 19920) documents its adaptation for life in soda lakes.
Extremophiles. Roč. 22, č. 6 (2018), s. 839-849. ISSN 1431-0651. E-ISSN 1433-4909
Grant CEP: GA ČR GBP501/12/G055; GA MŠMT(CZ) LO1416
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Element cycles * Genome annotation * Haloalkaliphiles
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.046, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288222 - 7.0486310 - ÚMG 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Karnkowska, A. - Vacek, V. - Zubáčová, Z. - Treitli, S.C. - Petrzelkova, R. - Eme, L. - Novák, L. - Žárský, V. - Barlow, L.D. - Herman, E.K. - Soukal, P. - Hroudová, Miluše - Doležal, P. - Stairs, C.W. - Roger, A. J. - Eliaš, M. - Dacks, J.B. - Vlček, Čestmír - Hampl, V.
A Eukaryote without a Mitochondrial Organelle.
Current Biology. Roč. 26, č. 10 (2016), s. 1274-1284. ISSN 0960-9822. E-ISSN 1879-0445
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA ČR GAP506/12/1010
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: arginine dihydrolase pathway * tail-anchored proteins * fe-s cluster * trichomonas-vaginalis * entamoeba-histolytica * giardia-intestinalis * tritrichomonas-fetus * genome annotation * energy-metabolism * gene-transfer
Obor OECD: Developmental biology
Impakt faktor: 8.851, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0281161 - 8.0483917 - BC 2018 RIV eng U - Uspořádání akce
Macas, Jiří - Novák, Petr - Neumann, Pavel
5th Workshop on the Application of Next Generation Sequencing to Repetitive DNA Analysis in Plants.
[České Budějovice, 24.05.2016-26.05.2016, (W-WRD 32/22)]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genomics * repetitive sequences * RepeatExplorer * genome annotation
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
http://repeatexplorer.org/?page_id=14
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0279092 - 9.0483838 - BC 2018 RIV eng U - Uspořádání akce
Macas, Jiří - Novák, Petr - Neumann, Pavel
6th Workshop on the Application of Next Generation Sequencing to Repetitive DNA Analysis in Plants.
[České Budějovice, 23.05.2017-25.05.2017, (W-WRD 36/27)]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genomics * RepeatExplorer * genome annotation * repetitive sequences
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
http://repeatexplorer.org/?page_id=14
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0278992