Výsledky vyhledávání
- 1.0574464 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Obiol, A. - Lopez-Escardo, D. - Salomaki, Eric David - Wisniewska, Monika Magdalena - Forn, I. - Sa, E. - Vaque, D. - Kolísko, Martin - Massana, R.
Gene expression dynamics of natural assemblages of heterotrophic flagellates during bacterivory.
Microbiome. Roč. 11, č. 1 (2023), č. článku 134. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF20_079/0017809
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Bacterivory * Heterotrophic flagellates * Metatranscriptomics * Functional genes * Unamended incubations * Phagocytosis * Peptidases * Glycosidases
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 15.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-023-01571-5
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345915 - 2.0558788 - BC 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Tashyreva, Daria - Simpson, A.G.B. - Prokopchuk, Galina - Škodová-Sveráková, Ingrid - Butenko, Anzhelika - Hammond, Michael John - George, E.E. - Flegontova, Olga - Záhonová, Kristýna - Faktorová, Drahomíra - Yabuki, A. - Horák, Aleš - Keeling, P.J. - Lukeš, Julius
Diplonemids-A Review on New Flagellates on the Oceanic Block.
Protist. Roč. 173, č. 2 (2022), č. článku 125868. ISSN 1434-4610. E-ISSN 1618-0941
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-23787S; GA MŠMT(CZ) LL1601; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Grant ostatní: Gordon and Betty Moore Foundation(US) #9354
Program: Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ambulator larsen * phylogenetic position * microbial eukaryotes * euglena-gracilis * diversity * sea * patterson * protozoa * light * gene * Protists * taxonomic revision * ultrastructure * Euglenozoa * ecology * marine flagellates
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 2.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S143446102200013X?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340424 - 3.0542712 - MBÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Piwosz, Kasia - Mukherjee, Indranil - Salcher, Michaela M. - Grujcic, V. - Šimek, Karel
CARD-FISH in the Sequencing Era: Opening a New Universe of Protistan Ecology.
Frontiers in Microbiology. Roč. 12, MAR 4 2021 (2021), č. článku 640066. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ18-14095Y; GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417; GA ČR(CZ) GA13-00243S
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: aquatic microbial food webs * card-fish * grazing by protists * protists * unicellular eukaryotes * bacterivorous * omnivorous and predatory flagellates * heterotrophic and mixotrophic flagellates
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 6.064, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2021.640066/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320081 - 4.0538633 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Grujčič, Vesna - Mukherjee, Indranil - Kasalický, Vojtěch - Nedoma, Jiří - Posch, T. - Mehrshad, Maliheh - Salcher, Michaela M.
Cascading effects in freshwater microbial food webs by predatory Cercozoa, Katablepharidacea and ciliates feeding on aplastidic bacterivorous cryptophytes.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 96, č. 10 (2020), č. článku fiaa121. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ciliates * bacterivorous and predatory flagellates * Cercozoa * Cryptophyceae * freshwater microbial food webs * Katablepharidacea
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 4.194, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/femsec/fiaa121
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0316400Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup SIMEK FEMS Microbiol Ecol 2020.pdf 0 3.9 MB Autorský preprint povolen - 5.0520426 - BC 2020 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Prokopchuk, Galina - Tashyreva, Daria - Yabuki, A. - Horák, Aleš - Masařová, Petra - Lukeš, Julius
Morphological, Ultrastructural, Motility and Evolutionary Characterization of Two New Hemistasiidae Species.
Protist. Roč. 170, č. 3 (2019), s. 259-282. ISSN 1434-4610. E-ISSN 1618-0941
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-18699S; GA ČR(CZ) GA18-23787S; GA MŠMT(CZ) LL1601; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) LM2015062; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: diplonema-ambulator larsen * flagellates protista * sequence alignment * phylogeny * marine * patterson * redescription * euglenozoon * homologies * colorless * Diplonemids * Hemistasiidae * rickettsiid * endosymbiosis * extrusome
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 1.989, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1434461018301391?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0305102 - 6.0517802 - BC 2021 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Weinbauer, M.G. - Suominen, S. - Jezbera, Jan - Kerros, M. E. - Marro, S. - Dolan, J. R. - Šimek, Karel
Shifts in cell size and community composition of bacterioplankton due to grazing by heterotrophic flagellates: evidence from a marine system.
Aquatic Microbial Ecology. Roč. 83, č. 3 (2019), s. 295-308. ISSN 0948-3055. E-ISSN 1616-1564
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: flagellates * bacteria * diversity * life strategies * grazing defense
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 1.841, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.int-res.com/abstracts/ame/v83/n3/p295-308/
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0303308 - 7.0507429 - BC 2020 RIV GB eng M - Část monografie knihy
Stern, R. - Esson, Heather - Balestreri, C.
PHYTOPLANKTON: FLAGELLATES.
MOŘSKÝ PLANKTON: PRAKTICKÝ PRŮVODCE EKOLOGII, METODOLOGII A TAXONOMY. 1. New York: Oxford : University Press, 2016, 2017, s. 167-179. ISBN 9780199233267
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: marine flagellates * taxonomy * phytoplankton * life cycle * ecology * morphology
Obor OECD: Ecology
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0298416 - 8.0498832 - BC 2019 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Tashyreva, Daria - Prokopchuk, Galina - Yabuki, A. - Kaur, Binnypreet - Faktorová, Drahomíra - Votýpka, Jan - Kusaka, C. - Fujikura, K. - Shiratori, T. - Ishida, K. I. - Horák, Aleš - Lukeš, Julius
Phylogeny and Morphology of New Diplonemids from Japan.
Protist. Roč. 169, č. 2 (2018), s. 158-179. ISSN 1434-4610. E-ISSN 1618-0941
Grant CEP: GA MŠMT LL1601; GA ČR(CZ) GA14-23986S; GA MŠMT(CZ) LM2015062
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: description * Diplonema * Euglenozoa * flagellates. * phylogeny * ultrastructure
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.000, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0291105 - 9.0450149 - BC 2016 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Weinbauer, M.G. - Dolan, J. R. - Šimek, Karel
A population of giant tailed virus-like particles associated with heterotrophic flagellates in a lake-type reservoir.
Aquatic Microbial Ecology. Roč. 76, č. 2 (2015), s. 111-116. ISSN 0948-3055. E-ISSN 1616-1564
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: viral infection * virus induced mortality * burst size * heterotrophic flagellates
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 2.109, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0251651 - 10.0445920 - BC 2016 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Grujčič, Vesna - Kasalický, Vojtěch - Šimek, Karel
Prey-specific growth responses of freshwater flagellate communities induced by morphologically distinct bacteria from the genus Limnohabitans.
Applied and Environmental Microbiology. Roč. 81, č. 15 (2015), s. 4993-5002. ISSN 0099-2240. E-ISSN 1098-5336
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA MŠMT(CZ) EE2.3.30.0032
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: freshwater reservoir * heterotrophic flagellate bacterivory * Limnohabitans * bacterial food quality * growth responses of flagellates
Kód oboru RIV: EH - Ekologie - společenstva
Impakt faktor: 3.823, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0251537