Výsledky vyhledávání
- 1.0471959 - BFÚ 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kührová, P. - Best, R.B. - Bottaro, S. - Bussi, G. - Šponer, Jiří - Otyepka, Michal - Banáš, Pavel
Computer Folding of RNA Tetraloops: Identification of Key Force Field Deficiencies.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 12, č. 9 (2016), s. 4534-4548. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR GAP208/12/1878
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: molecular-dynamics simulations * base-pairs * tertiary interactions * explicit-solvent
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 5.245, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0269320 - 2.0459939 - ÚOCHB 2017 CZ eng A - Abstrakt
Lepšík, Martin - Ajani, Haresh - Haldar, Susanta - Fanfrlík, Jindřich - Hobza, Pavel
Explicit-solvent effects in protein-ligand binding: Molecular dynamics complements quantum mechanical scoring.
Prague Protein Spring Meeting 2016: Proteins and their Design. Praha: Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, 2016. s. 69. ISBN 978-80-86241-55-5.
[Prague Protein Spring Meeting 2016: Proteins and their Design /4./. 05.05.2016-08.05.2016, Praha]
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: explicit-solvent molecular dynamics * quantum mechanical methods * noncovalent interactions
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0260098 - 3.0394735 - ÚOCHB 2014 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Standara, Stanislav - Kulhánek, P. - Marek, R. - Straka, Michal
Xe-129 NMR chemical shift in Xe@C-60 calculated at experimental conditions: Essential role of the relativity, dynamics, and explicit solvent.
Journal of Computational Chemistry. Roč. 34, č. 22 (2013), s. 1890-1898. ISSN 0192-8651. E-ISSN 1096-987X
Grant CEP: GA ČR GA203/09/2037; GA ČR GA13-03978S
Grant ostatní: 7th European Community Framework Program(XE) FP7-286154; CEITEC-Central European Institute of Technology (European Regional Development)(XE) CZ.1.05/1.1.00/02.0068; Operational Program Research and Development for Innovations(XE) CZ.1.05/3.2.00/08.0144
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Xe-129 NMR * Xe@C-60 * dynamical averaging * explicit solvent * relativistic effects
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.601, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0223099 - 4.0320441 - ÚOCHB 2009 US eng J - Článek v odborném periodiku
Chocholoušová, Jana - Feig, M.
Implicit solvent simulations of DNA and DNA-protein complexes: Agreement with explicit solvent vs experiment.
[Simulace DNA a DNA-Protein komplexů v implicitním rozpouštědle: shoda s explicitním rozpouštědlem vs. experiment.]
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 110, č. 34 (2006), s. 17240-17251. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Klíčová slova: implicit solvent * explicit solvent * protein DNA complex
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.115, rok: 2006
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0005049 - 5.0126770 - BFU-R 20023069 CZ cze A - Abstrakt
Špačková, Naďa
Studium neobvyklých forem nukleových kyselin metodou molekulové dynamiky.
[Molecular dynamics studies of unusual nucleic acids forms.]
Chemické listy. Česká společnost chemická. Roč. 96, č. 6 (2002), s. 426. ISSN 0009-2770. E-ISSN 1213-7103.
[Sjezd chemických společností /54./. 30.06.2002-04.07.2002, Brno]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z5004920
Klíčová slova: molecular dynamics * explicit solvent * G-quadruplex
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0024998