Výsledky vyhledávání
- 1.0580389 - MBÚ 2024 RIV US eng M - Část monografie knihy
Vávra, J. - Sergunin, A. - Stráňava, M. - Kádek, Alan - Shimitzu, T. - Man, Petr - Martínková, M.
Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry of Heme-Based Oxygen Sensor Proteins.
Oxygen Sensing. Methods and Protocols.. New York: Humana, 2023 - (Weinert, E.), s. 99-122. ISBN 978-1-0716-3079-2
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Hydrogen/deuterium exchange * Mass spectrometry * Protein conformational dynamics * Ligand binding * Signal transduction * Globin-coupled histidine kinase * Heme-containing oxygen sensors
Obor OECD: Biochemical research methods
https://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1-0716-3080-8_8
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349167 - 2.0579255 - FZÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Vávra, J. - Sergunin, A. - Pompach, P. - Savchenko, Dariia - Hraníček, J. - Šloufová, I. - Shimizu, T. - Martinková, M.
Characterization of the interaction between the tumour suppressor p53 and heme and its role in the protein conformational dynamics studied by various spectroscopic techniques and hydrogen/deuterium exchange coupled with mass spectrometry.
Journal of Inorganic Biochemistry. Roč. 243, June (2023), č. článku 112180. ISSN 0162-0134. E-ISSN 1873-3344
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000760
Grant ostatní: OP VVV - SOLID21(XE) CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000760
Institucionální podpora: RVO:68378271
Klíčová slova: conformational dynamics * intrinsically disordered regions * Heme interaction * Heme-responsive sensor * p53 transcription factor * signal transduction
Obor OECD: Inorganic and nuclear chemistry
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.jinorgbio.2023.112180
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0348102 - 3.0556556 - ÚOCHB 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Mondal, I. C. - Galkin, Maksym - Sharma, S. - Murugan, N. A. - Yushchenko, Dmytro A. - Girdhar, K. - Karmakar, A. - Mondal, P. - Gaur, Pankaj - Ghosh, S.
Organosulfur/selenium-based Highly Fluorogenic Molecular Probes for Live-Cell Nucleolus Imaging.
Chemistry-An Asian Journal. Roč. 17, č. 7 (2022), č. článku e202101281. ISSN 1861-4728. E-ISSN 1861-471X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: conformational dynamics * fluorescent probe * nucleic acid * nucleolus imaging * organochalcogens
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.1, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/asia.202101281
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0331015 - 4.0543856 - FGÚ 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vyklický, Vojtěch - Stanley, Ch. - Habrian, Ch. - Isacoff, E. Y.
Conformational rearrangement of the NMDA receptor amino-terminal domain during activation and allosteric modulation.
Nature Communications. Roč. 12, č. 1 (2021), č. článku 2694. E-ISSN 2041-1723
Grant ostatní: AV ČR(CZ) MSM200111601
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institucionální podpora: RVO:67985823
Klíčová slova: NMDA receptor * smFRET * conformational dynamics
Obor OECD: Neurosciences (including psychophysiology
Impakt faktor: 17.694, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-021-23024-z
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320968 - 5.0500166 - MBÚ 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kokkonen, P. - Sýkora, J. - Prokop, Z. - Ghose, Avisek - Bednář, D. - Amaro, M. - Beerens, K. - Bidmanová, Š. - Slanská, M. - Březovský, J. - Dambrovský, J. - Hof, M.
Molecular Gating of an Engineered Enzyme Captured in Real Time.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 140, č. 51 (2018), s. 17999-18008. ISSN 0002-7863. E-ISSN 1520-5126
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015055; GA MŠMT(CZ) LM2015047
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: photoinduced electron-transfer * conformational dynamics * catalytic mechanism
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.695, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0292296 - 6.0435268 - ÚVGZ 2015 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Pandey, Saurabh Kumar - Řeha, David - Zayats, Vasilina - Melicherčík, Milan - Carey, J. - Ettrich, Rüdiger
Binding-competent states for L-arginine in E. coli arginine repressor apoprotein.
Journal of Molecular Modeling. Roč. 20, č. 7 (2014), s. 2330. ISSN 1610-2940. E-ISSN 0948-5023
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: allostery * ArgRC * conformational dynamics * principal components analysis * salt bridges * temporal evolution of conformers
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 1.736, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0239206 - 7.0091338 - UCHP-M 20070193 CZ eng A - Abstrakt
Krupková, Alena - Vlachová, A. - Císařová, I. - Sýkora, Jan - Čermák, Jan
Synthesis and NMR Study of Conformational Dynamics of [(C5Me4CnF2n+1)RhLCl2] Complexes with Nitrogen Ligands.
[Syntéza a NMR studie konformační dynamiky komplexů typu[(C5Me4CnF2n+1)RhLCl2] s dusíkatými ligandy.]
Book of Abstracts. Praha: Vydavatelství VŠCHT, 2007 - (Církva, V.; Hovorka, L.; Kvíčala, J., J.; Paleta, O.). s. 303. ISBN 978-80-70-021-8.
[European Symposium on Fluorine Chemistry /15./. 15.07.2007-20.07.2007, Praha]
Grant CEP: GA AV ČR(CZ) IAA4072203; GA MŠMT(CZ) LC06070
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40720504
Klíčová slova: rhodium complexes * conformational dynamics * perfluoroalkyl
Kód oboru RIV: CA - Anorganická chemie
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0151946 - 8.0081633 - BFÚ 2007 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šefčíková, J. - Krasovská, Maryna V. - Špačková, Naďa - Šponer, Jiří - Walter, N.G.
Impact of an extruded nucleotide on cleavage activity and dynamic catalytic core conformation of the hepatitis delta virus ribozyme.
[Vliv vytěsněného nukleotidu na aktivitu štěpení a konformační dynamiku katalytického jádra hepatitis delta virus ribozymu.]
Biopolymers. Roč. 85, 5-6 (2007), s. 392-406. ISSN 0006-3525. E-ISSN 1097-0282
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA203/05/0388; GA ČR(CZ) GA203/05/0009; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581; GA MŠMT(CZ) LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: conformational dynamics * hepatitis delta virus * molecular dynamics
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 2.389, rok: 2007
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0145436 - 9.0055269 - UCHP-M 20060259 ES eng A - Abstrakt
Žádný, Jaroslav - Krupková, Alena - Vlachová, A. - Císařová, I. - Sýkora, Jan - Čermák, Jan
Synthesis of [(C5Me4CnF2n+1)RhLX2] Complexes with Series of Phosphines and Nitrogen Ligands and NMR Study of Their Conformational Dynamics.
[Syntéza [(C5Me4CnF2n+1)RhLX2] komplexů s fosfinovými a dusíkatými ligandy a studium jejich konformační dynamiky pomocí NMR.]
Poster Presentations.. Zaragoza: -, 2006 - (Oro, L.). s. 421
[International Conference on Organometallic Chemistry /22./. 23.07.2006-28.07.2006, Zaragoza]
Grant CEP: GA AV ČR(CZ) IAA4072203; GA MŠMT(CZ) LC06070
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40720504
Klíčová slova: rhodium complexes * conformational dynamics * ligand cleavage
Kód oboru RIV: CA - Anorganická chemie
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0143070