Výsledky vyhledávání
- 1.0581769 - ÚEM 2024 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Nieuwenhuis, B. - Laperrousaz, E. - Tribble, J.R. - Verhaagen, J. - Fawcett, James - Martin, K.R. - Williams, P.A. - Osborne, A.
Improving adeno-associated viral (AAV) vector-mediated transgene expression in retinal ganglion cells: comparison of five promoters.
Gene Therapy. Roč. 30, č. 9 (2023), s. 503-519. ISSN 0969-7128. E-ISSN 1476-5462
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF15_003/0000419
Institucionální podpora: RVO:68378041
Klíčová slova: posttranscriptional regulatory element * aug initiator codon * heparan-sulfate proteoglycan * growth-factor receptor * gene-therapy
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41434-022-00380-z
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350408 - 2.0576287 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Valášek, Leoš Shivaya - Kučerová, Michaela - Zeman, Jakub - Beznosková, Petra
Cysteine tRNA acts as a stop codon readthrough-inducing tRNA in the human HEK293T cell line.
RNA. Roč. 29, č. 9 (2023), s. 1379-1387. ISSN 1355-8382. E-ISSN 1469-9001
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-00579S; GA ČR(CZ) GF23-08669L
Grant ostatní: AV ČR(CZ) Premium Academiae of the Academy of Sciences of the Czech Republic
Program: Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: cysteine tRNA * near-cognate tRNA * readthrough-inducing tRNA * translation * stop codon readthrough
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://rnajournal.cshlp.org/content/29/9/1379
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345856 - 3.0571500 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kachale, Ambar - Pavlíková, Z. - Nenarokova, Anna - Roithova, A. - Durante, Ignacio Miguel - Miletinova, P. - Záhonová, Kristýna - Nenarokov, Serafim - Votýpka, Jan - Horáková, Eva - Ross, R.L. - Yurchenko, V. - Beznosková, P. - Paris, Zdeněk - Valášek, L. S. - Lukeš, Julius
Short tRNA anticodon stem and mutant eRF1 allow stop codon reassignment.
Nature. Roč. 613, č. 7945 (2023), s. 751-+. ISSN 0028-0836. E-ISSN 1476-4687
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15962S; GA ČR(CZ) GA22-14356S; GA ČR(CZ) GA20-11585S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Grant ostatní: Gordon and Betty Moore Foundation(US) GBMF9354
Program: Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: tRNA * eRF1 * codon
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 64.8, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.nature.com/articles/s41586-022-05584-2
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0343713 - 4.0561240 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Brož, Břetislav - Tureček, F. - Marek, Aleš
Low-scale syringe-made synthesis of 15N-labeled oligonucleotides.
Journal of Labelled Compounds and Radiopharmaceuticals. Roč. 65, č. 12 (2022), s. 309-314. ISSN 0362-4803. E-ISSN 1099-1344
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA19094
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: 15N-labeled oligonucleotides * low-scale * phosphoramidite synthesis * syringe-made codon synthesis
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 1.8, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/jlcr.4000
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0333924 - 5.0560255 - BC 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Vargova, R. - Hanousková, P. - Salamonová, J. - Zihala, D. - Silberman, Jeffrey Donald - Eliáš, M. - Čepička, I.
Evidence for an Independent Hydrogenosome-to-Mitosome Transition in the CL3 Lineage of Fornicates.
Frontiers in Microbiology. Roč. 13, MAY (2022), č. článku 866459. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ20-14903Y
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Caviomonadidae * caviomonads * codon reassignment * Fornicata * hydrogenosome * mitochondrial evolution * mitosome
Obor OECD: Behavioral sciences biology
Impakt faktor: 5.2, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2022.866459/full
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340543 - 6.0552026 - BC 2023 RIV IN eng J - Článek v odborném periodiku
Ahmed, A. - Gupta, S. - Mukherjee, Indranil - Babu, V. - Singh, R.
Comparative studies of codon usage profile of Anisakis simplex (Nematoda) and Carassius gibelio (Prussian carp).
Journal of Environmental Biology. Roč. 43, č. 1 (2022), s. 123-132. ISSN 0254-8704. E-ISSN 0254-8704
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: gene expressivity * base composition * evolution * proteins * Anisakis simplex * Codon usage bias * Parasite
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 0.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.22438/jeb/43/1/MRN-1845
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340854 - 7.0533104 - MBÚ 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wagner, Susan - Herrmannová, Anna - Hronová, Vladislava - Gunišová, Stanislava - Sen, N. D. - Hannan, R. D. - Hinnebusch, A. G. - Shirokikh, N. E. - Preiss, T. - Valášek, Leoš Shivaya
Selective Translation Complex Profiling Reveals Staged Initiation and Co-translational Assembly of Initiation Factor Complexes.
Molecular Cell. Roč. 79, č. 4 (2020), s. 546-560. ISSN 1097-2765. E-ISSN 1097-4164
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-25821X
GRANT EU: Wellcome Trust(CZ) 090812/B/09/Z
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: short upstream orfs * gcn4 messenger-rna * in-vivo * multifactor complex * start-codon * read alignment * reinitiation * eif3 * ribosomes
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 17.970, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276520303890?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0311594 - 8.0518352 - MBÚ 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Beznosková, Petra - Pavlíková, Zuzana - Zeman, Jakub - Aitken, C.E. - Valášek, Leoš Shivaya
Yeast applied readthrough inducing system (YARIS): an invivo assay for the comprehensive study of translational readthrough.
Nucleic Acids Research. Roč. 47, č. 12 (2019), s. 6339-6350. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-02014S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Frameshifting * Codon * Ribosomal frameshifting
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 11.502, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/47/12/6339/5487265
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0303510Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 128_Yeast applied readthrough inducing system (YARIS).pdf 4 1.9 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 9.0510318 - MBÚ 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Zeman, Jakub - Itoh, Y. - Kukačka, Zdeněk - Rosůlek, Michal - Kavan, Daniel - Kouba, Tomáš - Jansen, Myrte Esmeralda - Mohammad, Mahabub Pasha - Novák, Petr - Valášek, Leoš Shivaya
Binding of eIF3 in complex with eIF5 and eIF1 to the 40S ribosomal subunit is accompanied by dramatic structural changes.
Nucleic Acids Research. Roč. 47, č. 15 (2019), s. 8282-8300. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-06238S; GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LM2015043
GRANT EU: European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS; European Commission(CZ) EPIC-XS
Výzkumná infrastruktura: CIISB - 90043
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: initiation-factor 3 * rna recognition motif * start codon recognition
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 11.502, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/47/15/8282/5530675
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0300829Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 128_Binding of eIF3 in complex with.pdf 5 15.8 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 10.0507481 - ÚMG 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Panek, T. - Zihala, D. - Sokol, M. - Derelle, R. - Klimeš, V. - Hradilová, Miluše - Zadrobilkova, E. - Susko, E. - Roger, A. J. - Čepička, I. - Eliáš, M.
Nuclear genetic codes with a different meaning of the UAG and the UAA codon.
BMC BIOLOGY. Roč. 15, February (2017), č. článku 8. E-ISSN 1741-7007
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Codon reassignment * Evolution * Evolutionary constraint * Fornicata * Genetic code * Iotanema spirale * Lygus hesperus * Protists * Rhizaria * Transcriptome
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 5.770, rok: 2017
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-017-0353-y
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0298463