Výsledky vyhledávání
- 1.0571664 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Shope, B. - Magers, D. B. - Pelczer, I. - Řeha, David - Minofar, Babak - Carey, Jannette
NMR and computational studies of ammonium ion binding to dibenzo-18-crown-6.
Structural Chemistry. Roč. 34, č. 2 (2023), s. 713-722. ISSN 1040-0400. E-ISSN 1572-9001
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Host-guest systems * Ligand-binding affinity * Forward and reverse titration * Molar ratio of binding * Stoichiometric titration * Conformational transitions * Synergy of experiment and computation
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 1.7, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://link.springer.com/article/10.1007/s11224-022-02017-8
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0343186 - 2.0475086 - ÚOCHB 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pecina, Adam - Haldar, Susanta - Fanfrlík, Jindřich - Meier, R. - Řezáč, Jan - Lepšík, Martin - Hobza, Pavel
SQM/COSMO Scoring Function at the DFTB3-D3H4 Level: Unique Identification of Native Protein-Ligand Poses.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 57, č. 2 (2017), s. 127-132. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP208/12/G016; GA ČR(CZ) GJ16-11321Y
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: aldose reductase inhibition * binding affinity * PM6 method
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.804, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0271962 - 3.0458893 - ÚOCHB 2017 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Pecina, Adam - Meier, R. - Fanfrlík, Jindřich - Lepšík, Martin - Řezáč, Jan - Hobza, Pavel - Baldauf, C.
The SQM/COSMO filter: reliable native pose identification based on the quantum-mechanical description of protein-ligand interactions and implicit COSMO solvation.
Chemical Communications. Roč. 52, č. 16 (2016), s. 3312-3315. ISSN 1359-7345. E-ISSN 1364-548X
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: empirical scoring functions * density functional theory * binding affinity
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 6.319, rok: 2016
http://pubs.rsc.org/en/content/articlepdf/2016/cc/c5cc09499b
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0259109Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0458893.pdf 1 2 MB Vydavatelský postprint povolen - 4.0447258 - BTÚ 2016 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Černý, Jiří - Biedermannová, Lada - Mikulecký, Pavel - Zahradník, Jiří - Charnavets, Tatsiana - Šebo, Peter - Schneider, Bohdan
Redesigning Protein Cavities as a Strategy for Increasing Affinity in Protein-Protein Interaction: Interferon-gamma Receptor 1 as a Model.
BioMed Research International. Roč. 716945, 28 April 2015 (2015). ISSN 2314-6133. E-ISSN 2314-6141
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA ČR GAP305/10/2184
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: CONFORMATIONAL ENTROPY * MOLECULAR RECOGNITION * BINDING-AFFINITY
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 2.134, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0249219 - 5.0436908 - ÚOCHB 2015 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Németh, E. - Körtvélyesi, T. - Kožíšek, Milan - Thulstrup, P. W. - Christensen, H. E. M. - Asaka, M. N. - Nagata, K. - Gyurcsik, B.
Substrate binding activates the designed triple mutant of the colicin E7 metallonuclease.
Journal of Biological Inorganic Chemistry. Roč. 19, č. 8 (2014), s. 1295-1303. ISSN 0949-8257. E-ISSN 1432-1327
Grant ostatní: OPPC(XE) CZ.2.16/3.1.00/24016; Seventh Framework Programme of the European Union(XE) FP7-312284
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: binding affinity * calorimetry * zinc nuclease * substrate induced folding * protein engineering
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 2.538, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0240863 - 6.0394206 - ÚOCHB 2014 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Brahmkshatriya, Pathik - Dobeš, P. - Fanfrlík, Jindřich - Řezáč, Jan - Paruch, K. - Bronowska, A. - Lepšík, Martin - Hobza, Pavel
Quantum Mechanical Scoring: Structural and Energetic Insights into Cyclin-Dependent Kinase 2 Inhibition by Pyrazolo[1,5-a]pyrimidines.
Current Computer-Aided Drug Design. Roč. 9, č. 1 (2013), s. 118-129. ISSN 1573-4099. E-ISSN 1875-6697
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016
Grant ostatní: Operational Program Research and Development for Innovations(XE) CZ.1.05/2.1.00/03.0058
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: binding affinity * cyclin-dependent kinase 2 * QM/SQM/MM * PM6 * pyrazolo[1,5-a]pyrimidine * semiempirical quantum mechanics * scoring function
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 1.942, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0222539 - 7.0392307 - ÚOCHB 2014 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kwiatkowska, A. - Lewandowska, M. - Borovičková, Lenka - Slaninová, Jiřina - Lammek, B. - Prahl, A.
Design, Synthesis and Structure-Activity Relationship of New Arginine Vasopressin Analogues Containing Proline Derivatives in Position 2.
Chemical Biology & Drug Design. Roč. 81, č. 3 (2013), s. 420-428. ISSN 1747-0277. E-ISSN 1747-0285
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antidiuretic hormone * arginine vasopressin * binding affinity to OTR * conformational restriction * proline derivatives
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 2.507, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0221227 - 8.0379680 - ÚOCHB 2013 RIV AT eng J - Článek v odborném periodiku
Kwiatkowska, A. - Ptach, M. - Borovičková, Lenka - Slaninová, Jiřina - Lammek, B. - Prahl, A.
Design, synthesis and biological activity of new neurohypophyseal hormones analogues conformationally restricted in the N-terminal part of the molecule. Highly potent OT receptor antagonists.
Amino Acids. Roč. 43, č. 2 (2012), s. 617-627. ISSN 0939-4451. E-ISSN 1438-2199
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: oxitocin antagonists * Atosiban * neurohypophyseal hormones analogues * arginine vasopressin (AVP) * antidiuretic hormone * binding affinity
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.914, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0210577 - 9.0364839 - BC 2012 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Calvo, E. - Mizurini, D.M. - Sa-Nunes, A. - Ribeiro, J.M.C. - Andersen, J. F. - Mans, B.J. - Monteiro, R.Q. - Kotsyfakis, Michalis - Francischetti, I.M.B.
Alboserpin, a Factor Xa Inhibitor from the Mosquito Vector of Yellow Fever, Binds Heparin and Membrane Phospholipids and Exhibits Antithrombotic Activity.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 286, č. 32 (2011), 27998-28010. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z60220518
Klíčová slova: serpin * mosquito * Aedes albopictus * phospholipids * Factor Xa * heparin * binding affinity * coagulation * thrombus * bleeding
Kód oboru RIV: GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicína
Impakt faktor: 4.773, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0200216 - 10.0338390 - ÚOCHB 2010 US eng A - Abstrakt
Jiráček, Jiří - Žáková, Lenka - Kazdová, L. - Hančlová, Ivona - Protivínská, Eva - Šanda, Miloslav - Buděšínský, Miloš
Insulin analogues with modifications at position B26. Divergence of binding affinity and biological activity.
[Analogy insulinu s modifikacemi v pozici B26. Divergence vazebné afinity a biologické aktivity.]
Biopolymers. Roč. 92, č. 4 (2009), s. 341-341. ISSN 0006-3525. E-ISSN 1097-0282.
[American Peptide Symposium /21./. 07.06.2009-12.06.2009, Bloomington]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: insulin * binding affinity * N-methylation
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0182173