Výsledky vyhledávání
- 1.0584246 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Macas, Jiří - Robledillo, Laura Avila - Kreplak, J. - Novák, Petr - Koblížková, Andrea - Vrbová, Iva - Burstin, J. - Neumann, Pavel
Assembly of the 81.6 Mb centromere of pea chromosome 6 elucidates the structure and evolution of metapolycentric chromosomes.
PLoS Genetics. Roč. 19, č. 2 (2023), č. článku e1010633. ISSN 1553-7404. E-ISSN 1553-7404
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genome * kinetochore * duplication * annotation * generation * alignment * sequence * provides * shows * gene
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 4.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1010633
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352322 - 2.0583104 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nothias, L-F. - Schmid, Robin - Garlet, A. - Cameron, H. - Leoty-Okombi, S. - Andre-Frei, V. - Fuchs, R. - Dorrestein, P. C. - Ternes, P.
Functional metabolomics of the human scalp: a metabolic niche for Staphylococcus epidermidis.
mSystems. Roč. 9, č. 2 (2024). ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: metabolomics * skin microbiome * scalp * metabolite annotation * multi-omics integration
Impakt faktor: 6.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1128/msystems.00356-23
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351103 - 3.0582766 - BC 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Qi, Z. - Etebari, K. - Nouzová, Marcela - Noriega, F. G. - Asgari, S.
Differential gene expression and microRNA profile in icorpora allata-corpora cardiaca/i of iAedes aegypti/i mosquitoes with weak juvenile hormone signalling.
BMC Genomics. Roč. 25, č. 1 (2024), č. článku 113. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21244S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: troponin-t * drosophila * biosynthesis * maintenance * annotation * evolution * homolog * pathway * body * Aedes aegypti * Mosquito * Transcriptome * RNA-Seq * Epoxidase * Juvenile hormone * microRNA * Corpora allata
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-024-10007-9
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351361 - 4.0580521 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Novák, L.V.F. - Treitli, S.C. - Pyrih, J. - Halakuc, P. - Pipaliya, S.V. - Vacek, V. - Brzon, O. - Soukal, P. - Eme, L. - Dacks, Joel Bryan - Karnkowska, A. - Eliáš, M. - Hampl, V.
Genomics of Preaxostyla Flagellates Illuminates the Path Towards the Loss of Mitochondria.
PLoS Genetics. Roč. 19, č. 12 (2023), č. článku e1011050. ISSN 1553-7404. E-ISSN 1553-7404
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: entamoeba-histolytica * golgi stacking * annotation * metabolism * reduction * evolution * proteins * sequence * dehydrogenase * localization
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1011050
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349292 - 5.0574879 - FGÚ 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Čajka, Tomáš - Hricko, Jiří - Rudl Kulhavá, Lucie - Paučová, Michaela - Nováková, Michaela - Fiehn, O. - Kuda, Ondřej
Exploring the Impact of Organic Solvent Quality and Unusual Adduct Formation during LC-MS-Based Lipidomic Profiling.
Metabolites. Roč. 13, č. 9 (2023), č. článku 966. E-ISSN 2218-1989
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU20-01-00186; GA MZd(CZ) NU22-02-00161; GA ČR(CZ) GA20-21114S; GA MŠMT(CZ) LTAUSA19124; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104; GA ČR(CZ) GA21-00477S
Grant ostatní: AV ČR(CZ) LQ200111901
Program: Prémie Lumina quaeruntur
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:67985823
Klíčová slova: lipidomics * metabolomics * liquid chromatography * mass spectrometry * method development * solvent quality * adduct formation * MS/MS annotation * misidentification * lipids
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 4.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2218-1989/13/9/966
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344811Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 23_0075_0574879.pdf 4 2.4 MB Vydavatelský postprint povolen - 6.0572698 - ÚEB 2024 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Boden, S. A. - McIntosh, R.A. - Uauy, C. - Krattinger, S.G. - Dubcovsky, J. - Rogers, W. J. - Xia, X. C. - Badaeva, E.D. - Bentley, A. R. - Brown-Guedira, G. - Caccamo, M. - Cattivelli, L. - Chhuneja, P. - Cockram, J. - Contreras-Moreira, B. - Dreisigacker, S. - Edwards, D. - González, F. G. - Guzmán, C. - Ikeda, T. M. - Karsai, I. - Nasuda, S. - Pozniak, C. - Prins, R. - Sen, T. Z. - Silva, P. J. - Šimková, Hana - Zhang, Y.
Updated guidelines for gene nomenclature in wheat.
Theoretical and Applied Genetics. Roč. 136, č. 4 (2023), č. článku 72. ISSN 0040-5752. E-ISSN 1432-2242
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: Abiotic stress tolerances * Gene annotation * Genetic information
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1007/s00122-023-04253-w
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0343305Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2023_Boden_Theoretical and Applied Genetics_72.pdf 3 1.2 MB Jiná povolen - 7.0571535 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Havlík, J. - Brázda, Václav - Stanek, K. - Ježek, M. - Šťastný, J.
Feature-overlapper: The tool for DNA analysis overlap.
SOFTWARE IMPACTS. Roč. 16, MAY 2023 (2023), č. článku 100498. ISSN 2665-9638
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna * R-loop * G-quadruplex * Annotation
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 2.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2665963823000350?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349900 - 8.0571406 - FGÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Habart, D. - Koza, A. - Leontovyč, I. - Kosinová, L. - Berková, Z. - Kříž, J. - Zacharovová, K. - Brinkhof, B. - Cornelissen, D. J. - Magrane, N. - Bittenglová, K. - Čapek, Martin - Valečka, J. - Habartová, Alena - Saudek, F.
IsletSwipe, a mobile platform for expert opinion exchange on islet graft images.
Islets. Roč. 15, č. 1 (2023), č. článku 2189873. ISSN 1938-2014. E-ISSN 1938-2022
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU22-01-00141; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104; GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045
Institucionální podpora: RVO:67985823 ; RVO:61388963
Klíčová slova: consensus building * deep learning * expert opinion exchange * ground truth * human islets * image annotation * islet counting * mobile application * islet graft quality control * islet isolation * islet transplantation * user experience
Obor OECD: Transplantation; Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8) (UOCHB-X)
Impakt faktor: 2.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1080/19382014.2023.2189873
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342639Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 23_0035_0571406.pdf 0 12.6 MB Vydavatelský postprint povolen - 9.0571233 - MBÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Novák, Jiří - Schug, K. A. - Havlíček, Vladimír
Quantitation of small molecules from liquid chromatography-mass spectrometric accurate mass datasets using CycloBranch.
European Journal of Mass Spectrometry. Roč. 29, č. 2 (2023), s. 102-110. ISSN 1469-0667
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-06771S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Siderophores * dereplication * annotation * quantitation * mass spectrometry * high resolution
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 1.3, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://journals.sagepub.com/doi/10.1177/14690667231164766
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342505 - 10.0571021 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Fallon, T. R. - Čalounová, Tereza - Mokrejš, Martin - Weng, J. K. - Pluskal, Tomáš
transXpress: a Snakemake pipeline for streamlined de novo transcriptome assembly and annotation.
BMC Bioinformatics. Roč. 24, č. 1 (2023), č. článku 133. ISSN 1471-2105. E-ISSN 1471-2105
Grant CEP: GA ČR(CZ) GM21-11563M
GRANT EU: European Commission(XE) 891397 - KavaTarget
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: de novo transcriptome assembly * RNA-seq * non-model organisms * transcriptome annotation * differential expression analysis * reproducible software * high-performance computing
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12859-023-05254-8
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342339Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 10.1186s12859-023-05254-8.pdf 0 1.9 MB Vydavatelský postprint povolen