Výsledky vyhledávání
- 1.0583773 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Choma, M. - Bače, R. - Čapek, P. - Kaňa, Jiří - Kaštovská, E. - Tahovská, K. - Kopáček, Jiří
Surviving trees are key elements in the fate of ectomycorrhizal community after severe bark-beetle forest disturbance.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 99, č. 8 (2023), č. článku fiad082. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
Grant CEP: GA ČR GA22-05421S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: mountain spruce forest * ips-typographus * ectomycorrhizal fungi * forest disturbance * natural regeneration * DNA metabarcoding
Obor OECD: Soil science
Impakt faktor: 4.2, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1093/femsec/fiad082
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351773 - 2.0580385 - MBÚ 2024 RIV CH eng M - Část monografie knihy
Baldrian, Petr - Kohout, Petr - Větrovský, Tomáš
Global Fungal Diversity Estimated from High-Throughput Sequencing.
Evolution of Fungi and Fungal-Like Organisms. Cham: Springer Nature, 2023 - (Pöggele, S.; James, T.), s. 227-238. The Mycota. ISBN 978-3-031-29198-2
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17749S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Fungal diversity * High-throughput sequencing * Metabarcoding * Biogeography * Fungal ecology
Obor OECD: Microbiology
https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-031-29199-9_10
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349162 - 3.0579021 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vacher, C. - Francioni, C. - Michel, M. - Fort, Tania - D'Arcier, J. F. - Chancerel, E. - Delmotte, F. - Delmas, C. E. L.
Fungal Metabarcoding Data for Two Grapevine Varieties (Regent and Vitis vinifera'Cabernet-Sauvignon') Inoculated with Powdery Mildew (Erysiphe necator) Under Drought Conditions.
Phytobiomes Journal. Roč. 6, č. 4 (2022), s. 358-367. E-ISSN 2471-2906
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: phyllosphere * disease * drought stress * Erysiphe necator * fungal communities * grapevine * metabarcoding * plant microbiome * powdery mildew * Vitis vinifera
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://apsjournals.apsnet.org/doi/10.1094/PBIOMES-06-22-0037-A
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0347927 - 4.0578266 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Veselská, Tereza - Švec, Karel - Kostovčík, Martin - Peral-Aranega, E. - García Fraile, Paula - Křížková, Barbora - Havlíček, Václav - Saati-Santamaria, Zaki - Kolařík, Miroslav
Proportions of taxa belonging to the gut core microbiome change throughout the life cycle and season of the bark beetle Ips typographus.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 99, č. 8 (2023), č. článku fiad072. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-09072S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: dendroctonus-ponderosae coleoptera * picea-abies * bacterial communities * vectored fungi * diversity * spruce * plant * phytopathogenicity * visualization * verbenone * bark beetles * core microbiome * DNA and RNA metabarcoding * gut fungal and bacterial community * Ips typographus * seasonality
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/femsec/article/99/8/fiad072/7209148?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0347289 - 5.0576721 - MBÚ 2025 GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hakimzadeh, A. - Abdala Asbun, A. - Albanese, D. - Bernard, M. - Buchner, D. - Callahan, B. - Caporaso, J. G. - Curd, E. - Djemiel, C. - Brandstrom Durling, M. - Elbrecht, V. - Gold, Z. - Gweon, H. S. - Hajibabaei, M. - Hildebrand, F. - Mikryukov, V. - Normandeau, E. - Ozkurt, E. - M. Palmer, J. - Pascal, G. - Porter, T. M. - Straub, D. - Vasar, M. - Větrovský, Tomáš - Zafeiropoulos, H. - Anslan, S.
A pile of pipelines: An overview of the bioinformatics software for metabarcoding data analyses.
Molecular Ecology Resources. (2023). ISSN 1755-098X. E-ISSN 1755-0998
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17749S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: amplicon data analysis * bioinformatics * environmental DNA * metabarcoding * pipeline * review
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 7.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1755-0998.13847
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346151 - 6.0575161 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Flegontova, Olga - Lukeš, Julius - Horák, Aleš
Intragenomic diversity of the V9 hypervariable domain in eukaryotes has little effect on metabarcoding.
iScience. Roč. 26, č. 8 (2023), č. článku 107291. E-ISSN 2589-0042
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-26209S; GA ČR(CZ) GX23-06479X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Intragenomic * eukaryotic * metabarcoding
Obor OECD: Zoology
Impakt faktor: 5.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004223013688?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345275 - 7.0575076 - BC 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Schauer, B. - Thorn, Simon - Blaschke, M. - Kudernatsch, T.
Conversion of pure spruce to mixed spruce beech stands: Effects on alpha and beta diversity of multiple taxonomic groups.
Forest Ecology and Management. Roč. 545, OCT 01 (2023), č. článku 121297. ISSN 0378-1127. E-ISSN 1872-7042
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: beech * spruce * metabarcoding
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378112723005315/pdfft?md5=1634ec6780fe73bda2e5d21506768a0d&pid=1-s2.0-S0378112723005315-main.pdf
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349858 - 8.0574273 - BÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Černajová, Ivana - Steinová, J. - Škvorová, Z. - Škaloud, P.
The curious case of Cladonia luteoalba: no support for its distinction.
Lichenologist. Roč. 54, č. 6 (2022), s. 345-354. ISSN 0024-2829. E-ISSN 1096-1135
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: Asterochloris * chemotypes * lichen * metabarcoding * mycobiont culture * phylogeny * Sanger sequencing
Obor OECD: Mycology
Impakt faktor: 1.4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1017/S002428292200024X
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0348979 - 9.0573913 - ÚVGZ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Ferrin, M. - Penuelas, J. - Gargallo-Garriga, Albert - Iribarren, P.A. - Janssens, I. A. - Maranon Jimenez, S. - Murienne, J. - Richter, A. - Sigurdsson, B.D. - Peguero, G.
Responses of soil hexapod communities to warming are mediated by microbial carbon and nitrogen in a subarctic grassland.
European Journal of Soil Biology. Roč. 117, JUL-AUG (2023), č. článku 103513. ISSN 1164-5563. E-ISSN 1778-3615
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS IV - 90248
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: Climate change * Environmental DNA * Metabarcoding * Microbial communities * Community composition * DOC * DON
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 4.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1164556323000493?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344292Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 1-s2.0-S1164556323000493-main.pdf 4 2.3 MB Vydavatelský postprint povolen - 10.0572140 - BÚ 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Vasar, M. - Davison, J. - Moora, M. - Sepp, S. - Anslan, S. - Al-Quraishy, S. - Bahram, M. - Bueno, C. G. - Cantero, J. J. - Fabiano, E. C. - Decocq, G. - Drenkhan, T. - Fraser, L. - Oja, J. - Garibay-Orijel, R. - Hiiesalu, I. - Koorem, K. - Mucina, L. - Öpik, M. - Pölme, S. - Pärtel, M. - Phosri, C. - Semchenko, M. - Vahter, T. - Doležal, Jiří - Vasco-Palacios, A. M. - Tedersoo, L. - Zobel, M.
Metabarcoding of soil environmental DNA to estimate plant diversity globally.
Frontiers in Plant Science. Roč. 14, APR 18 2023 (2023), č. článku 1106617. ISSN 1664-462X. E-ISSN 1664-462X
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: Metabarcoding * soil environmental DNA * plant diversity globally
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fpls.2023.1106617
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346066