Výsledky vyhledávání
- 1.0583620 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Porubiakova, Otilia - Havlík, J. - Indu, Indu - Sedy, M. - Přepechalová, Veronika - Bartas, M. - Bidula, S. - Šťastný, J. - Fojta, Miroslav - Brázda, Václav
Variability of Inverted Repeats in All Available Genomes of Bacteria.
Microbiology Spectrum. Roč. 11, č. 4 (2023). ISSN 2165-0497. E-ISSN 2165-0497
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna-structure * sticky dna * sp-nov. * evolution * stability * binding * server * gene * rnas
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/epub/10.1128/spectrum.01648-23
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351624 - 2.0574529 - BTÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Svoboda, Jakub - Berdár, Daniel - Kolenko, Petr - Černý, Jiří - Nováková, Zora - Pavlíček, Jiří - Schneider, Bohdan
Conformation-based refinement of 18-mer DNA structures.
Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography. Roč. 79, JUL 2023 (2023), s. 655-665. ISSN 1399-0047. E-ISSN 2059-7983
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA18197; GA MŠMT EF16_019/0000778
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: DNA structure * dnatco.datmos.org * structure validation * structure refinement * base pairing
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?S2059798323004679
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345411 - 3.0540782 - BTÚ 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kolenko, Petr - Svoboda, Jakub - Černý, Jiří - Charnavets, Tatsiana - Schneider, Bohdan
Structural variability of CG-rich DNA 18-mers accommodating double T-T mismatches.
Acta Crystallographica Section D-Structural Biology. Roč. 76, DEC 1 2020 (2020), s. 1233-1243. ISSN 2059-7983. E-ISSN 2059-7983
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018127; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) LTAUSA18197; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001776; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: DNA structure * noncanonical base pairs * T– * T mismatch
Obor OECD: Biochemical research methods
Impakt faktor: 7.652, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?S2059798320014151
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0318385 - 4.0537727 - BFÚ 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Luo, Y. - Bartas, M. - Kaura, P. - Porubiakova, Otilia - Šťastný, J. - Pečinka, P. - Verga, D. - Da Cunha, V. - Takahashi, T. - Forterre, P. - Myllykallio, H. - Fojta, Miroslav - Mergny, Jean-Louis
G-Quadruplexes in the Archaea Domain.
Biomolecules. Roč. 10, č. 9 (2020), č. článku 1349. E-ISSN 2218-273X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: genome-wide * replication origins * inverted repeats * dna-structure * motifs * rna * radiodurans
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.879, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
http://apps.webofknowledge.com/InboundService.do?customersID=Alerting&mode=FullRecord&IsProductCode=Yes&product=WOS&Init=Yes&Func=Frame&DestFail=https%3A%2F%2Fwww.webofknowledge.com&action=retrieve&SrcApp=Alerting&SrcAuth=Alerting&SID=E4SFQpVfVUW1Pa8UB8d&UT=WOS%3A000580139600001
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0315583 - 5.0501564 - ÚOCHB 2020 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Andrushchenko, Valery
Eu3+ as a luminescence probe in DNA studies: Structural and conformational implications.
Spectrochimica Acta Part A-Molecular and Biomolecular Spectroscopy. Roč. 213, Apr 15 (2019), s. 456-462. ISSN 1386-1425. E-ISSN 1873-3557
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-04902S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: DNA structure * DNA condensation * lanthanide ions * luminescence probe * vibrational circular dichroism (VCD) * infrared (IR)
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 3.232, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1386142519301027?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0296372 - 6.0499565 - BTÚ 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Schneider, Bohdan - Božíková, Paulina - Nečasová, Iva - Čech, P. - Svozil, D. - Černý, Jiří
A DNA structural alphabet provides new insight into DNA flexibility.
Acta Crystallographica Section D-Structural Biology. Roč. 74, JAN 2018 (2018), s. 52-64. ISSN 2059-7983. E-ISSN 2059-7983
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LM2015047
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) EF16_013/0001777
Program: EF - Operační program výzkum, vývoj, vzdělávání (2014 - 2020)
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: DNA structure * X-ray structure * NMR structure
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.227, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0291765 - 7.0399419 - BFÚ 2014 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šponer, Jiří - Šponer, Judit E. - Mládek, Arnošt - Banáš, Pavel - Jurečka, P. - Otyepka, Michal
How to understand quantum chemical computations on DNA and RNA systems? A practical guide for non-specialists.
Methods. Roč. 64, č. 1 (2013), s. 3-11. ISSN 1046-2023. E-ISSN 1095-9130
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0068; GA ČR(CZ) GAP208/12/1878; GA ČR(CZ) GBP208/12/G016
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) ED2.1.00/03.0058; GA ČR(CZ) GBP305/12/G034; GA ČR(CZ) GPP301/11/P558
Program: ED; GB; GP
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040702
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: DNA structure * Quantum chemistry * Molecular mechanics
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 3.221, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0226766 - 8.0334785 - BFÚ 2010 CZ eng A - Abstrakt
Fojta, Miroslav
Mercury electrodes as unique tools for nucleic acids studies.
[Rtuťové elektrody jako unikátní nástroje pro studium nukleových kyselin.]
Abstract. Praha, 2009. s236. ISSN 0009-2770. E-ISSN 1213-7103.
[Modern Electroanalytical Methods 2009. 09.12.2009-13.12.2009, Praha]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA203/07/1195; GA AV ČR(CZ) IAA400040903; GA MŠMT(CZ) LC06035
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: mercury electrodes * electrochemistry * DNA structure
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0179419 - 9.0333800 - BFÚ 2010 CR eng A - Abstrakt
Brázda, Václav - Brázdová Jagelská, Eva - Arrowsmith, Ch.
Influence of non-B DNA structures and DNA methylations to p53 sequence specific binding.
[Vliv struktury a metylace DNA na sekvenčně specifickou vazbu proteinu p53.]
Program & Abstract Book. Hilton Papagayo Resort, 2009. s. 62.
[The fifth meeting on Chromatin Structure & Function. 16.11.2009-19.11.2009, Hilton Papagayo Resort]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GP301/07/P160
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: p53 * DNA structure * methylation of DNA
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0178705 - 10.0329499 - BFÚ 2010 IT eng A - Abstrakt
Kejnovská, Iva - Vorlíčková, Michaela - Renčiuk, Daniel - Kypr, Jaroslav
Circular dichroism and conformational polymorphism of DNA.
[Cirkulární dichroismus a strukturní polymorfismus DNA.]
Abstract Book. Palermo, 2009. s. 46.
[XIII European Conference on the Spectroscopy of Biological Molecules. 28.08.2009-02.09.2009, Palermo]
Grant CEP: GA MZd(CZ) NR9147; GA ČR(CZ) GA204/07/0057; GA AV ČR(CZ) IAA500040903
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: circular dichroism spectroscopy * DNA structure * quadruplex
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0175518