Výsledky vyhledávání
- 1.0644776 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Liu, S. - Powell, V. - Yang, Shun-Min - Lam, F. - Bowler, C. - Oborník, Miroslav - Dorrell, R.G.
Dynamic Relocalization and Divergent Expression of a Major Facilitator Carrier Subfamily in Diatoms.
Physiologia Plantarum. Roč. 177, č. 3 (2025), č. článku e70355. ISSN 0031-9317. E-ISSN 1399-3054
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF18_054/0014649; GA ČR(CZ) GA23-06203S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: multiple sequence alignment * phaeodactylum-tricornutum * improved prediction * coenzyme-a * mitochondrial * transporter * family * model * identification * proteins * environmental sequencing * gene co-regulation * GFP-confocal microscopy * plastid proteomes * solute carrier family 25
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.895, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://doi.org/10.1111/ppl.70355DOI: https://doi.org/10.1111/ppl.70355
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0374650 - 2.0640254 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Fussy, Z. - Lampe, R.H. - Arrigo, K.R. - Barry, K. - Brisbin, M.M. - Brussaard, C.P.D. - Decelle, J. - de Vargas, C. - Ditullio, G.R. - Elbourne, L.D.H. - Frischer, M.E. - Goodstein, D. - Grigoriev, I.V. - Hayes, R.D. - Healey, A. L. - James, C.C. - Jenkins, J.W. - Juery, C. - Kumar, M. - Kustka, A. B. - Maumus, F. - Novak Vanclová, A.M.G. - Oborník, Miroslav - Paulsen, I.T. - Probert, I. - Saito, M.A. - Schmutz, J. - Skalický, Tomáš - Tec-Campos, D. - Tomelka, H. - Věchtová, P. - Venepally, P. - Wilson-Mortier, B. - Zengler, K. - Zheng, H. - Allen, A. E.
Genome-resolved biogeography of Phaeocystales, cosmopolitan bloom-forming algae.
Nature Communications. Roč. 16, č. 1 (2025), č. článku 8559. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06203S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ribosomal-rna sequences * global ocean * community structure * protein-sequence * gene prediction * read alignment * southern-ocean * life-cycle * phytoplankton * viruses
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://doi.org/10.1038/s41467-025-63565-1DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-025-63565-1
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0370799 - 3.0637044 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Gruber, Ansgar - Vohnoutová, M. - McKay, C. - Rocap, G. - Oborník, Miroslav
ASAFind 2.0: multi-class protein targeting prediction for diatoms and algae with complex plastids.
Plant Journal. Roč. 122, č. 5 (2025), č. článku e70138. ISSN 0960-7412. E-ISSN 1365-313X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-26115S; GA ČR(CZ) GA23-06203S; GA MŠMT(CZ) LM2023055
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: putative carbonic-anhydrases * fatty-acid-metabolism * 2 marine diatoms * phaeodactylum-tricornutum * secondary plastids * functional-characterization * signal peptides * in-silico * localization * evolution * diatoms * organelle * genome annotation * secretory pathway * chloroplast * mitochondria * periplastidic compartment * protein transport * evolution * gene transfer * technical advance
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.7, rok: 2024 ; AIS: 1.647, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://doi.org/10.1111/tpj.70138DOI: https://doi.org/10.1111/tpj.70138
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0369347 - 4.0618398 - BC 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Yang, Shun-Min - Gruber, Ansgar - Jiroutová, Kateřina - Richtová, Jitka - Vancová, Marie - Tesařová, Martina - Masařová, Petra - Dorrell, R.G. - Oborník, Miroslav
Localization of heme biosynthesis in the diatom Phaeodactylum tricornutum and differential expression of multi-copy enzymes.
Frontiers in Plant Science. Roč. 16, MAR 2025 (2025), č. článku 1537037. ISSN 1664-462X. E-ISSN 1664-462X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06203S; GA ČR(CZ) GA21-26115S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045; GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA MŠMT(CZ) LM2023055
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: protoporphyrinogen-ix-oxidase * thalassiosira-pseudonana * mitochondrial localization * subcellular-localization * evolutionary history * molecular phylogeny * ferrochelatase * transport * proteins * chlorophyll * chloroplast * tetrapyrrole * horizontal gene transfer * algae * organelle * evolution * endosymbiosis
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 4.8, rok: 2024 ; AIS: 0.964, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://doi.org/10.3389/fpls.2025.1537037DOI: https://doi.org/10.3389/fpls.2025.1537037
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0373471 - 5.0617429 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Terpis, K.X. - Salomaki, Eric David - Barcyté, D. - Pánek, T. - Verbruggen, H. - Kolísko, Martin - Bailey, J.C. - Eliáš, M. - Lane, C. E.
Multiple plastid losses within photosynthetic stramenopiles revealed by comprehensive phylogenomics.
Current Biology. Roč. 35, č. 3 (2025), s. 483-499.e8. ISSN 0960-9822. E-ISSN 1879-0445
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06203S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA22-22538S; GA MŠMT(CZ) EF20_079/0017809
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: classis nova * genome * heterokonta * lineage * classification * organization * prediction * algorithm * evolution * alignment
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 7.5, rok: 2024 ; AIS: 3.993, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
Web výsledku:
https://doi.org/10.1016/j.cub.2024.11.065DOI: https://doi.org/10.1016/j.cub.2024.11.065
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0365061 - 6.0603879 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bartošová-Sojková, Pavla - Butenko, Anzhelika - Richtová, Jitka - Fiala, Ivan - Oborník, Miroslav - Lukeš, Julius
Inside the Host: Understanding the Evolutionary Trajectories of Intracellular Parasitism.
Annual Review of Microbiology. Roč. 78, APR (2024), s. 39-59. ISSN 0066-4227. E-ISSN 1545-3251
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-01026S; GA ČR(CZ) GX19-28399X; GA ČR(CZ) GA21-03224S; GA ČR(CZ) GA23-06203S; GA ČR(CZ) GA23-07695S
Grant ostatní: Gordon and Betty Moore Foundation(US) GBMF9354
Program: Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genome reduction * apicomplexan * microsporidia * chromera * invasion * diversity * phylogeny * reveals * spp. * cell * symbiosis * intracellular parasite * parallel evolution * adaptation * genomic * features * comparative analysis
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 9.9, rok: 2024 ; AIS: 5.061, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://doi.org/10.1146/annurev-micro-041222-025305DOI: https://doi.org/10.1146/annurev-micro-041222-025305
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0361177Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Bartosova_2024_ARM.pdf 1 472.4 KB Vydavatelský postprint povolen - 7.0580594 - BC 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Richtová, Jitka - Bazalova, O. - Horák, Aleš - Tomčala, A. - Gonepogu, V.G. - Oborník, Miroslav - Doležel, David
Circadian rhythms and circadian clock gene homologs of complex alga iChromera velia/i.
Frontiers in Plant Science. Roč. 14, DEC (2023), č. článku 1226027. ISSN 1664-462X. E-ISSN 1664-462X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-03224S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA22-10088S; GA ČR(CZ) GA23-06203S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: blue-light * ectocarpus phaeophyta * fast responses * protein * photosynthesis * photoreceptors * identification * localization * cryptochrome * mechanisms * apicomplexa * Chromera velia * circadian clock * cryptochrome * zoospore formation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.1, rok: 2023 ; AIS: 0.91, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2023.1226027/fullDOI: https://doi.org/10.3389/fpls.2023.1226027
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349358Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Richtova_2023_FPS.pdf 2 3.3 MB Vydavatelský postprint povolen