Výsledky vyhledávání
- 1.0584024 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Selicharová, Irena - Fabre, Benjamin - Garre Hernández, María Soledad - Lubos, Marta - Pícha, Jan - Voburka, Zdeněk - Mitrová, Katarína - Jiráček, Jiří
Combinatorial libraries of bipodal binders of the insulin receptor.
ChemMedChem. (2024), e202400145. ISSN 1860-7179. E-ISSN 1860-7187
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: insulin * receptor * library * scaffold * peptide * combinatorial chemistry
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 3.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/cmdc.202400145
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352016Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 10.1002cmdc.202400145.pdf 0 1.1 MB Vydavatelský postprint povolen - 2.0583294 - ÚOCHB 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Vetýšková, Veronika - Hubálek, Martin - Šulc, Josef - Procházka, Jan - Vondrášek, Jiří - Vydra Boušová, Kristýna
Proteolytic profiles of two isoforms of human AMBN expressed in E. coli by MMP-20 and KLK-4 proteases.
Heliyon. Roč. 10, č. 2 (2024), č. článku e24564. ISSN 2405-8440. E-ISSN 2405-8440
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: ameloblastin * MMP-20 * Ameloblastin * proteolytic analysis * KLK-4 * enzymatic cleavage products
Impakt faktor: 4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2024.e24564
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351295 - 3.0583040 - ÚOCHB 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Brouns, T. - Lux, Vanda - Van Belle, S. - Christ, F. - Veverka, Václav - Debyser, Z.
The Impact of Lens Epithelium-Derived Growth Factor p75 Dimerization on Its Tethering Function.
Cells. Roč. 13, č. 3 (2024), č. článku 227. E-ISSN 2073-4409
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-03028S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: DNA-binding protein * protein-DNA interaction * protein-protein interaction * chromatin structure * protein dynamic * LEDGF/p75 * DNA-induced protein binding
Impakt faktor: 6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/cells13030227
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351072 - 4.0580493 - BC 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Martins, Larissa Almeida - Buša, Michal - Chlastáková, A. - Kotál, Jan - Beránková, Z. - Stergiou, N. - Jmel, Mohamed Amine - Schmitt, E. - Chmelař, J. - Mareš, Michael - Kotsyfakis, Michalis
Protease-bound structure of Ricistatin provides insights into the mechanism of action of tick salivary cystatins in the vertebrate host.
Cellular and Molecular Life Sciences. Roč. 80, č. 11 (2023), č. článku 339. ISSN 1420-682X. E-ISSN 1420-9071
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-07247S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) LTAUSA19109
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61388963
Klíčová slova: ray crystal-structure * sialostatin-l * functional expression * cysteine cathepsins * mammalian legumain * ixodes-scapularis * inhibitors * stefin * generation * peptidase * Ixodes ricinus * Tick saliva * Cystatins * Protease inhibition * Protein structure * Host-parasite interactions
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 8, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://link.springer.com/article/10.1007/s00018-023-04993-4
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349268 - 5.0579941 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Faltejsková, Kateřina - Vondrášek, Jiří
PAPerFly: Partial Assembly-based Peak Finder for ab initio binding site reconstruction.
BMC Bioinformatics. Roč. 24, č. 1 (2023), č. článku 487. ISSN 1471-2105. E-ISSN 1471-2105
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: ChIP-seq * DNA recognition * transcription factor * peak analysis * algorithm * graph theory
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12859-023-05613-5
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0348738 - 6.0577780 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kertisová, Anna - Žáková, Lenka - Macháčková, Kateřina - Marek, Aleš - Šácha, Pavel - Pompach, Petr - Jiráček, Jiří - Selicharová, Irena
Insulin receptor Arg717 and IGF-1 receptor Arg704 play a key role in ligand binding and in receptor activation.
Open Biology. Roč. 13, č. 11 (2023), č. článku 230142. E-ISSN 2046-2441
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA ČR(CZ) GA22-17978S; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0015974; GA MŠMT LM2023042
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:86652036
Klíčová slova: mutagenesisin vitro * peptide hormone * eceptor modification * eceptor tyrosine kinase * structure–function
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1098/rsob.230142
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346886Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 10.1098rsob.230142.pdf 2 2 MB Vydavatelský postprint povolen - 7.0576137 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Inniss, N. L. - Kozic, Ján - Li, F. - Rosas-Lemus, M. - Minasov, G. - Rybáček, Jiří - Zhu, Y. - Pohl, Radek - Shuvalova, L. - Rulíšek, Lubomír - Brunzelle, J. S. - Bednárová, Lucie - Štefek, Milan - Kormaník, Ján Michael - Andris, Erik - Šebestík, Jaroslav - Li, A. S. M. - Brown, P. J. - Schmitz, U. - Saikatendu, K. - Chang, E. - Nencka, Radim - Vedadi, M. - Satchell, K. J. F.
Discovery of a Druggable, Cryptic Pocket in SARS-CoV-2 nsp16 Using Allosteric Inhibitors.
ACS Infectious Diseases. Roč. 9, č. 10 (2023), s. 1918-1931. ISSN 2373-8227
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MZd(CZ) NU20-05-00472
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: coronavirus * NSP16 methyltransferase * covalent inhibitors * structural biology * antiviral
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 5.3, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acsinfecdis.3c00203
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345731 - 8.0575033 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Koutná, Eliška - Lux, Vanda - Kouba, Tomáš - Škerlová, Jana - Nováček, J. - Srb, Pavel - Hexnerová, Rozálie - Šváchová, Hana - Kukačka, Zdeněk - Novák, Petr - Fábry, Milan - Poepsel, S. - Veverka, Václav
Multivalency of nucleosome recognition by LEDGF.
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 18 (2023), s. 10011-10025. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-03028S; GA ČR(CZ) GA22-27695S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) LO1304
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127; CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: PWWP domain * recombinant histones * structural basis
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (MBU-M)
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkad674
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344870 - 9.0574400 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Potalitsyn, Pavlo - Mrázková, Lucie - Selicharová, Irena - Tencerová, Michaela - Ferenčáková, Michaela - Chrudinová, Martina - Turnovská, Tereza - Brzozowski, A. M. - Marek, Aleš - Kaminský, Jakub - Jiráček, Jiří - Žáková, Lenka
Non-glycosylated IGF2 prohormones are more mitogenic than native IGF2.
Communications Biology. Roč. 6, č. 1 (2023), č. článku 863. E-ISSN 2399-3642
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-14069S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:67985823
Klíčová slova: hormone * prohormone * precursor * mitogenic * receptor * IGF
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s42003-023-05239-6
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344735Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 10.1038s42003-023-05239-6.pdf 1 2.1 MB Vydavatelský postprint povolen - 10.0574393 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Khoroshyy, Petro - Martinez-Seara, Hector - Myšková, J. - Lazar, Josef
Dynamics of transition dipole moment orientation in representative fluorescent proteins.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 25, č. 33 (2023), s. 22117-22123. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: quantitative analysis * anisotropy * FRET
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D3CP01242E
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344721