Výsledky vyhledávání
- 1.0543807 - MBÚ 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Filandrová, Růžena - Vališ, Karel - Černý, Jiří - Chmelík, Josef - Slavata, Lukáš - Fiala, Jan - Rosůlek, Michal - Kavan, Daniel - Man, Petr - Chum, Tomáš - Cebecauer, Marek - Fabris, D. - Novák, Petr
Motif orientation matters: Structural characterization of TEAD1 recognition of genomic DNA.
Structure. Roč. 29, č. 4 (2021), s. 345-356. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) LH15010; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) LO1509; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LM2015043
GRANT EU: European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS
Výzkumná infrastruktura: CIISB - 90043
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652036 ; RVO:61388955
Klíčová slova: TEAD1 * genomic DNA * M-CAT motifs * ChIP-qPCR * presence of M-CAT
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biophysics (BTO-N); Physical chemistry (UFCH-W)
Impakt faktor: 5.871, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0969212620304652?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320930Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0543807preprint.pdf 5 2.2 MB Autorský preprint povolen - 2.0542387 - MBÚ 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kukačka, Zdeněk - Rosůlek, Michal - Jelínek, Jan - Slavata, Lukáš - Kavan, Daniel - Novák, Petr
LinX: A Software Tool for Uncommon Cross-Linking Chemistry.
Journal of Proteome Research. Roč. 20, č. 4 (2021), s. 2021-2027. ISSN 1535-3893. E-ISSN 1535-3907
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-16084S; GA MŠMT(CZ) LH15010; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) LD15089; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
GRANT EU: European Commission(XE) 731077 - EU_FT-ICR_MS
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: mass spectrometry * high resolution * chemical cross-linking * proteins
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.370, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jproteome.0c00858
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319810 - 3.0533400 - MBÚ 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Skořepa, O. - Pažický, S. - Kalousková, B. - Bláha, J. - Abreu, C. - Ječmen, T. - Rosůlek, Michal - Fish, A. - Sedivy, A. - Harlos, K. - Dohnálek, Jan - Skálová, Tereza - Vaněk, O.
Natural Killer Cell Activation Receptor NKp30 Oligomerization Depends on ItsN-Glycosylation.
Cancers (Basel). Roč. 12, č. 7 (2020), č. článku 1998. E-ISSN 2072-6694
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-10687S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LM2015043
Výzkumná infrastruktura: CIISB - 90043
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652036
Klíčová slova: NK cell * NKp30 * B7-H6 * glycosylation * oligomerization
Obor OECD: Microbiology; Oncology (BTO-N)
Impakt faktor: 6.639, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2072-6694/12/7/1998
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0312045 - 4.0519095 - MBÚ 2020 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Slavata, Lukáš - Chmelík, Josef - Kavan, Daniel - Filandrová, Růžena - Fiala, Jan - Rosůlek, Michal - Mrázek, Hynek - Kukačka, Zdeněk - Vališ, Karel - Man, Petr - Miller, M. - McIntyre, W. - Fabris, D. - Novák, Petr
MS-Based Approaches Enable the Structural Characterization of Transcription Factor/DNA Response Element Complex.
Biomolecules. Roč. 9, č. 10 (2019), č. článku 535. E-ISSN 2218-273X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) LH15010; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LO1509
GRANT EU: European Commission(XE) 731077 - EU_FT-ICR_MS; European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS; European Commission(CZ) FP7WeNMR-261572; European Commission(CZ) H2020 West-Life 675858
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: transcription factor * protein * protein-nucleic acid cross-linking
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.082, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2218-273X/9/10/535
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0304158Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 163_MS-Based Approaches Enable the Structural Characterization.pdf 5 4 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 5.0518684 - MBÚ 2020 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Rosůlek, Michal - Darebná, Petra - Pompach, Petr - Slavata, Lukáš - Novák, Petr
Proteases Immobilization for In Situ Time-Limited Proteolysis on MALDI Chips.
Catalysts. Roč. 9, č. 10 (2019), č. článku 833. E-ISSN 2073-4344
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) LH15010; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
GRANT EU: European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: protease * enzyme * ambient ion landing
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.520, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2073-4344/9/10/833
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0303757 - 6.0510318 - MBÚ 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Zeman, Jakub - Itoh, Y. - Kukačka, Zdeněk - Rosůlek, Michal - Kavan, Daniel - Kouba, Tomáš - Jansen, Myrte Esmeralda - Mohammad, Mahabub Pasha - Novák, Petr - Valášek, Leoš Shivaya
Binding of eIF3 in complex with eIF5 and eIF1 to the 40S ribosomal subunit is accompanied by dramatic structural changes.
Nucleic Acids Research. Roč. 47, č. 15 (2019), s. 8282-8300. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-06238S; GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LM2015043
GRANT EU: European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS; European Commission(CZ) EPIC-XS
Výzkumná infrastruktura: CIISB - 90043
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: initiation-factor 3 * rna recognition motif * start codon recognition
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 11.502, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/47/15/8282/5530675
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0300829Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 128_Binding of eIF3 in complex with.pdf 5 15.8 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 7.0508013 - MBÚ 2020 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Hernychová, Lucie - Rosůlek, Michal - Kádek, Alan - Mareška, V. - Chmelík, Josef (ed.) - Adámková, Ljubina - Grobárová, Valeria - Šebesta, O. - Kukačka, Zdeněk - Skála, Kristián - Spiwok, V. - Černý, J. - Novák, Petr
The C-type lectin-like receptor Nkrp1b: Structural proteomics reveals features affecting protein conformation and interactions.
Journal of Proteomics. Roč. 196, MAR 30 (2019), s. 162-172. ISSN 1874-3919. E-ISSN 1876-7737
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging - 90062
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Structural mass spectrometry * Chemical cross-linking * Ion mobility
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.509, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S187439191830397X?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0298974 - 8.0498388 - FGÚ 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šmídová, Aneta - Alblová, Miroslava - Kalábová, Dana - Pšenáková, Katarína - Rosůlek, Michal - Herman, P. - Obšil, Tomáš - Obšilová, Veronika
14-3-3 protein masks the nuclear localization sequence of caspase-2.
FEBS Journal. Roč. 285, č. 22 (2018), s. 4196-4213. ISSN 1742-464X. E-ISSN 1742-4658
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-00726S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:67985823 ; RVO:61388971
Klíčová slova: 14‐3‐3 protein * caspase‐2 * fluorescence * nuclear localization sequence * protein–protein interactions * small angle X‐ray scattering
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.739, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0290764 - 9.0489608 - MBÚ 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Rozbeský, Daniel - Rosůlek, Michal - Kukačka, Zdeněk - Chmelík, Josef - Man, Petr - Novák, Petr
Impact of Chemical Cross-Linking on Protein Structure and Function.
Analytical Chemistry. Roč. 90, č. 2 (2018), s. 1104-1113. ISSN 0003-2700. E-ISSN 1520-6882
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) LH15010; GA MŠMT(CZ) LD15089; GA MŠMT(CZ) LO1509; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) BM1403
GRANT EU: European Commission(CZ) BM1403
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: TRANSFORM MASS-SPECTROMETRY * DISTANCE GEOMETRY METHOD * TOP-DOWN APPROACH
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.350, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0284071Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 163_Impact of Chemical Cross-Linking on Protein.pdf 3 5.5 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 10.0483974 - MBÚ 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Stráňava, M. - Man, Petr - Skálová, Tereza - Kolenko, Petr - Bláha, J. - Fojtíková, V. - Martínek, V. - Dohnálek, Jan - Lengalová, A. - Rosůlek, Michal - Shimizu, T. - Martínková, M.
Coordination and redox state-dependent structural changes of the heme-based oxygen sensor AfGcHK associated with intraprotein signal transduction.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 292, č. 51 (2017), s. 20921-20935. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001776
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652036
Klíčová slova: INDUCED CONFORMATIONAL-CHANGES * TRANSCRIPTION ACTIVATOR COOA * COUPLED HISTIDINE KINASE
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (BTO-N)
Impakt faktor: 4.011, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0279151