Výsledky vyhledávání
- 1.0532691 - MBÚ 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Brodsky, Katerina - Kutý, Michal - Pelantová, Helena - Cvačka, Josef - Rebroš, M. - Kotík, Michael - Kutá Smatanová, Ivana - Křen, Vladimír - Bojarová, Pavla
Dual Substrate Specificity of the Rutinosidase fromAspergillus nigerand the Role of Its Substrate Tunnel.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 21, č. 16 (2020), č. článku 5671. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-00091S; GA MŠMT(CZ) LTC20069
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61388963
Klíčová slova: azide * glycosylation * molecular modeling
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Analytical chemistry (UOCHB-X)
Impakt faktor: 5.924, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/21/16/5671
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0311112 - 2.0520852 - MBÚ 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Aryafard, Meysam - Jahanshah, M. - Harifi-Mood, A.R. - Minofar, Babak - Kutá Smatanová, Ivana
Experimental and Theoretical Studies of Preferential Solvation of 4-Nitroaniline and 4-Nitroanisole in an Amino Acid Ionic Liquid with Molecular Solvents.
Journal of Chemical and Engineering Data. Roč. 64, č. 12 (2019), s. 5755-5764. ISSN 0021-9568. E-ISSN 1520-5134
Výzkumná infrastruktura: CESNET II - 90042; CERIT-SC - 90085
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: solvatochromic comparison method * initial configurations * binary-mixtures
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 2.369, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jced.9b00719
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0305512Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 190_Experimental and Theoretical Studies of Preferential.pdf 3 5.5 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 3.0520840 - MBÚ 2020 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Chrást, L. - Tratsiak, K. - Planas-Iglesias, J. - Daniel, L. - Prudnikova, Tatyana - Brezovský, J. - Bednář, D. - Kutá Smatanová, Ivana - Chaloupková, R. - Dambrovský, J.
Deciphering the Structural Basis of High Thermostability of Dehalogenase from Psychrophilic Bacterium Marinobacter sp. ELB17.
Microorganisms. Roč. 7, č. 11 (2019), č. článku 498. E-ISSN 2076-2607
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015055
Výzkumná infrastruktura: C4SYS - 90055; RECETOX II - 90051; ELIXIR-CZ - 90047; CESNET II - 90042; CERIT-SC - 90085
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: haloalkane dehalogenase * thermostability * psychrophile
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.152, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2076-2607/7/11/498
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0305501 - 4.0508894 - ÚOCHB 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Havlíčková, P. - Brinsa, Vítězslav - Brynda, Jiří - Pachl, Petr - Prudnikova, Tatyana - Mesters, J. R. - Kaščáková, B. - Kutý, Michal - Pusey, M. L. - Ng, J. D. - Řezáčová, Pavlína - Kutá Smatanová, Ivana
A novel structurally characterized haloacid dehalogenase superfamily phosphatase from Thermococcus thioreducens with diverse substrate specificity.
Acta Crystallographica Section D-Structural Biology. Roč. 75, č. 8 (2019), s. 743-752. ISSN 2059-7983. E-ISSN 2059-7983
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LO1304
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: HAD superfamily * hypothetical phosphatase * crystal structure * docking * phosphatase assay
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.266, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
http://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?S2059798319009586
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0299685Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 190_A novel structurally characterized haloacid dehalogenase.pdf 7 1.6 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 5.0508541 - MBÚ 2020 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Prudnikova, Tatyana - Kascaková, B. - Mesters, J. R. - Grinkevich, P. - Havlíčková, P. - Mazur, Andrii - Shaposhnikova, Anastasiia - Chaloupková, R. - Dambrovský, J. - Kutý, Michal - Kutá Smatanová, Ivana
Crystallization and Crystallographic Analysis of a Bradyrhizobium Elkanii USDA94 Haloalkane Dehalogenase Variant with an Eliminated Halide-Binding Site.
Crystals. Roč. 9, č. 7 (2019), č. článku 375. ISSN 2073-4352. E-ISSN 2073-4352
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015055
Grant ostatní: AV ČR(CZ) DAAD-16-09
Program: Bilaterální spolupráce
Výzkumná infrastruktura: C4SYS - 90055
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Haloalkane dehalogenase * halide-binding site * random microseeding
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.404, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2073-4352/9/7/375
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0299416Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 190_Crystallization and Crystallographic Analysis of a.pdf 2 3.2 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 6.0505903 - ÚMG 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tratsiak, K. - Prudnikova, Tatyana - Drienovská, I. - Damborský, J. - Brynda, Jiří - Pachl, P. - Kutý, Michal - Chaloupková, R. - Řezáčová, Pavlína - Kutá Smatanová, Ivana
Crystal structure of the cold-adapted haloalkane dehalogenase DpcA from Psychrobacter cryohalolentis K5.
Acta Crystallographica Section F-Structural Biology Communications. Roč. 75, Pt 5 (2019), s. 324-331. E-ISSN 2053-230X
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:61388971
Klíčová slova: haloalkane dehalogenase * alpha/beta-hydrolase * X-ray diffraction * psychrophiles * structural analysis * Psychrobacter cryohalolentis
Obor OECD: Biophysics; Biochemistry and molecular biology (MBU-M)
Impakt faktor: 0.968, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
http://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?S2053230X19002796
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0297526 - 7.0473584 - MBÚ 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Sviridova, Ekaterina - Řezáčová, Pavlína - Bondar, Alexey - Veverka, V. - Novák, Petr - Schenk, G. - Svergun, D.I. - Kutá Smatanová, Ivana - Bumba, Ladislav
Structural basis of the interaction between the putative adhesion-involved and iron-regulated FrpD and FrpC proteins of Neisseria meningitidis.
Scientific Reports. Roč. 7, JAN 13 (2017), s. 1-14, č. článku 40408. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA ČR(CZ) GAP207/11/0717; GA ČR(CZ) GA15-11851S; GA MŠMT(CZ) LD15089; GA MŠMT(CZ) LO1304; GA MŠMT(CZ) LM2015064; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:68378050
Klíčová slova: MEMBRANE LIPOPROTEIN FRPD * RTX PROTEINS * CROSS-LINKING
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.122, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0270717 - 8.0472361 - MBÚ 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Březovský, J. - Babková, P. - Degtjarik, Oksana - Fořtová, A. - Gora, A. - Iermak, Iuliia - Řezáčová, Pavlína - Dvořák, P. - Kutá Smatanová, Ivana - Prokop, Z. - Chaloupková, R. - Damborský, J.
Engineering a de Novo Transport Tunnel.
ACS Catalysis. Roč. 6, č. 11 (2016), s. 7597-7610. ISSN 2155-5435. E-ISSN 2155-5435
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:68378050
Klíčová slova: transport tunnel * protein engineering * protein design
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 10.614, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0269689 - 9.0468157 - MBÚ 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Degtjarik, Oksana - Brynda, Jiří - Ettrichová, Olga - Kutý, Michal - Sinha, Dhiraj - Kutá Smatanová, Ivana - Carey, Jannette - Ettrich, Rüdiger - Řeha, David
Quantum Calculations Indicate Effective Electron Transfer between FMN and Benzoquinone in a New Crystal Structure of Escherichia coli WrbA.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 120, č. 22 (2016), s. 4867-4877. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015055; GA ČR GAP207/10/1934
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:68378050
Klíčová slova: MACROMOLECULAR CRYSTALLOGRAPHY * NONCOVALENT INTERACTIONS * MOLECULAR-REPLACEMENT
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 3.177, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0266157Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 190_Quantum Calculations Indicate Effective Electron Transfer.pdf 3 3.3 MB Vydavatelský postprint vyžádat