Výsledky vyhledávání

  1. 1.
    0539814 - ÚMG 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
    Škuta, Ctibor - Cortes-Ciriano, I. - Dehaen, W. - Kříž, P. - van Westen, G.J.P. - Tetko, I. V. - Bender, A. - Svozil, Daniel
    QSAR-derived affinity fingerprints (part 1): fingerprint construction and modeling performance for similarity searching, bioactivity classification and scaffold hopping.
    Journal of Cheminformatics. Roč. 12, č. 1 (2020), č. článku 39. ISSN 1758-2946. E-ISSN 1758-2946
    Institucionální podpora: RVO:68378050
    Klíčová slova: Affinity fingerprint * Biological fingerprint * qsar * Similarity searching * Bioactivity modeling * Scaffold hopping
    Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
    Impakt faktor: 5.514, rok: 2020
    Způsob publikování: Open access
    https://jcheminf.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13321-020-00443-6
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0317517
     
     
  2. 2.
    0538137 - ÚMG 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
    Cortes-Ciriano, I. - Škuta, Ctibor - Bender, A. - Svozil, Daniel
    QSAR-derived affinity fingerprints (part 2): modeling performance for potency prediction.
    Journal of Cheminformatics. Roč. 12, č. 1 (2020), č. článku 41. ISSN 1758-2946. E-ISSN 1758-2946
    Grant CEP: GA MŠk LM2015063
    Institucionální podpora: RVO:68378050
    Klíčová slova: qsar * Affinity fingerprints * ChEMBL * Bioactivity modeling * Cytotoxicity * Drug sensitivity prediction * Drug sensitivity
    Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
    Impakt faktor: 5.514, rok: 2020
    Způsob publikování: Open access
    https://jcheminf.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13321-020-00444-5
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0315960
     
     
  3. 3.
    0502626 - ÚMG 2019 RIV CZ cze J - Článek v odborném periodiku
    Škuta, Ctibor - Svozil, Daniel
    QSAR – Modelování kvantitativních vztahů mezi strukturou a aktivitou chemických látek.
    [QSAR – Modelling of Quantitative Relations between Structure and Activity of Chemical Compounds.]
    Chemické listy. Roč. 111, č. 11 (2017), s. 747-753. ISSN 0009-2770. E-ISSN 1213-7103
    Grant CEP: GA MŠk LO1220
    Institucionální podpora: RVO:68378050
    Klíčová slova: QSAR * biological activity modelling * data mining * virtual screening * applicability domain * conformal prediction
    Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
    Impakt faktor: 0.260, rok: 2017
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0294522
     
     
  4. 4.
    0502026 - ÚMG 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
    Oltová, Jana - Jindřich, Jindřich - Škuta, Ctibor - Svoboda, Ondřej - Machoňová, Olga - Bartůněk, Petr
    Zebrabase: An Intuitive Tracking Solution for Aquatic Model Organisms.
    Zebrafish. Roč. 15, č. 6 (2018), s. 642-647. ISSN 1545-8547. E-ISSN 1557-8542
    Grant CEP: GA ČR GA16-21024S; GA MŠk LO1419
    Institucionální podpora: RVO:68378050
    Klíčová slova: zebrafish * tracking * husbandry * facility database * Django * Python
    Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
    Impakt faktor: 1.742, rok: 2018
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0293979
    Název souboruStaženoVelikostKomentářVerzePřístup
    Zebrafish_J_Oltova_2018.pdf11289.8 KBVydavatelský postprintvyžádat
     
     
  5. 5.
    0495161 - ÚMG 2019 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
    Bruštíková, Kateřina - Sedlák, David - Kubíková, Jana - Škuta, Ctibor - Šolcová, Kateřina - Malík, Radek - Bartůněk, Petr - Svoboda, Petr
    Cell-Based Reporter System for High-Throughput Screening of MicroRNA Pathway Inhibitors and Its Limitations.
    Frontiers in genetics. Roč. 9, Únor (2018), č. článku 45. E-ISSN 1664-8021
    Grant CEP: GA ČR GA13-29531S; GA MŠk LO1220; GA MŠk LM2015063
    Institucionální podpora: RVO:68378050
    Klíčová slova: miRNA * high-throughput screening * let-7 * miR-30 * Argonaute
    Obor OECD: Cell biology
    Impakt faktor: 3.517, rok: 2018
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288172
     
     
  6. 6.
    0487037 - ÚMG 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
    Škuta, Ctibor - Popr, M. - Muller, Tomáš - Jindřich, Jindřich - Kahle, Michal - Sedlák, David - Svozil, Daniel - Bartůněk, Petr
    Probes & Drugs portal: an interactive, open data resource for chemical biology.
    Nature Methods. Roč. 14, č. 8 (2017), s. 758-759. ISSN 1548-7091. E-ISSN 1548-7105
    Grant CEP: GA MŠk LO1220
    Institucionální podpora: RVO:68378050
    Klíčová slova: bioactive compound, ,, * chemical probe * chemical biology * portal
    Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
    Impakt faktor: 26.919, rok: 2017
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0281725
    Název souboruStaženoVelikostKomentářVerzePřístup
    Nature_Methods_C_Skuta_2017.pdf4981.7 KBVydavatelský postprintvyžádat
     
     
  7. 7.
    0468176 - MBÚ 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
    Biedermann, David - Buchta, M. - Holečková, Veronika - Sedlák, David - Valentová, Kateřina - Cvačka, Josef - Bednárová, Lucie - Křenková, Alena - Kuzma, Marek - Škuta, Ctibor - Peikerová, Žaneta - Bartůněk, Petr - Křen, Vladimír
    Silychristin: Skeletal Alterations and Biological Activities.
    Journal of Natural Products. Roč. 79, č. 12 (2016), s. 3086-3092. ISSN 0163-3864. E-ISSN 1520-6025
    Grant CEP: GA ČR(CZ) GA15-03037S; GA MZd(CZ) NV16-27317A; GA MŠk LO1220; GA MŠk LM2015063; GA MŠk(CZ) LD15081
    Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:68378050 ; RVO:61388963
    Klíčová slova: Silychristin * skeletal alterations * biological activities
    Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
    Impakt faktor: 3.281, rok: 2016
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0266155
    Název souboruStaženoVelikostKomentářVerzePřístup
    114_SilychristinSkeletalAlterationsAndBiologicalActivities.pdf4496.1 KBVydavatelský postprintvyžádat
     
     
  8. 8.
    0441263 - ÚMG 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
    Škuta, Ctibor - Bartůněk, Petr - Svozil, Daniel
    InCHlib - interactive cluster heatmap for web applications.
    Journal of Cheminformatics. Roč. 6, č. 44 (2014). ISSN 1758-2946. E-ISSN 1758-2946
    Grant CEP: GA MŠk LO1220
    Institucionální podpora: RVO:68378050
    Klíčová slova: Data clustering * Cluster heatmap * Scientific visualization * Web integration * Client-side scripting * JavaScript library * Big data * Exploration
    Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
    Impakt faktor: 4.547, rok: 2014
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0244328
    Název souboruStaženoVelikostKomentářVerzePřístup
    0441263.pdf121.5 MBVydavatelský postprintvyžádat