Výsledky vyhledávání
- 1.0525126 - MBÚ 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Pandey, Saurabh Kumar - Melicherčík, Milan - Řeha, David - Ettrich, Rüdiger - Carey, Jannette
Conserved Dynamic Mechanism of Allosteric Response to L-arg in Divergent Bacterial Arginine Repressors.
Molecules. Roč. 25, č. 9 (2020), č. článku 2247. E-ISSN 1420-3049
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-21053S; GA MŠMT(CZ) LM2015055
Výzkumná infrastruktura: CESNET II - 90042
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: entropy * global motion * salt bridges
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 4.412, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1420-3049/25/9/2247
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0309338 - 2.0519579 - MBÚ 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bonhenry, Daniel - Schober, R. - Schmidt, T. - Waldherr, L. - Ettrich, Rüdiger - Schindel, R.
Mechanistic insights into the Orai channel by molecular dynamics simulations.
Seminars in Cell & Developmental Biology. Roč. 94, October 2019 SI (2019), s. 50-58. ISSN 1084-9521. E-ISSN 1096-3634
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-21053S; GA MŠMT(CZ) LM2015055; GA MŠMT(CZ) LM2015055; GA MŠMT(CZ) LTC17069
GRANT EU: European Commission(CZ) ATCZ14 EFRR Project Interreg Austria-Czech Republic; European Commission(CZ) BM 1406
Výzkumná infrastruktura: C4SYS - 90055
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Molecular dynamics * MD-simulations * Orai
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 6.691, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1084952118300375?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0304574Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 190_Mechanistic insights into the Orai channel.pdf 5 1.2 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 3.0483350 - MBÚ 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Frischauf, I. - Litviňuková, M. - Schober, R. - Zayats, Vasilina - Svobodová, B. - Bonhenry, Daniel - Lunz, V. - Cappello, S. - Tociu, L. - Řeha, David - Stallinger, A. - Hochreiter, A. - Pammer, T. - Butorac, C. - Muik, M. - Groschner, K. - Bogeski, I. - Ettrich, Horst Rüdiger - Romanin, Ch. - Schindl, R.
Transmembrane helix connectivity in Orai1 controls two gates for calcium-dependent transcription.
Science Signaling. Roč. 10, č. 507 (2017), č. článku eaao0358. ISSN 1945-0877. E-ISSN 1937-9145
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-21053S; GA MŠMT(CZ) LM2015055; GA MŠMT(CZ) LTC17069
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: COMPREHENSIVE MOLECULAR CHARACTERIZATION * FAST CA2+-DEPENDENT INACTIVATION * ACTIVATES CRAC CHANNELS
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.378, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0278714Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 190_Transmembrane helix connectivity in Orai1 controls.pdf 4 2.8 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 4.0479823 - MBÚ 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Taherkhani, F. - Minofar, Babak
Effect of Nitrogen Doping on Glass Transition and Electrical Conductivity of [EMIM][PF6] Ionic Liquid Encapsulated in a Zigzag Carbon Nanotube.
Journal of Physical Chemistry C. Roč. 121, č. 29 (2017), s. 15493-15508. ISSN 1932-7447. E-ISSN 1932-7455
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-21053S; GA MŠMT(CZ) LM2015055
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS * FORCE-FIELD * ELECTRONIC-PROPERTIES
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.484, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0275751 - 5.0473351 - ÚVGZ 2017 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Zayats, Vasilina - Stockner, T. - Pandey, Saurabh Kumar - Woerz, K. - Ettrich, Rüdiger - Ludwig, J.
A refined atomic scale model of the Saccharomyces cerevisiae K+-translocation protein Trk1p combined with experimental evidence confirms the role of selectivity filter glycines and other key residues.
Biochimica Et Biophysica Acta-Biomembranes. Roč. 1848, č. 5 (2015), s. 1183-1195. ISSN 0005-2736. E-ISSN 1879-2642
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-21053S
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: molecular-dynamics simulations * potassium-transport * vibrio-alginolyticus * high-affinity * ion-channel * system * ktrab * prediction * symporters * currents * K+-translocation * Eukaryotic Trk * Saccharomyces cerevisiae * Homology modeling * Molecular dynamics * Selectivity filter
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.687, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0270493 - 6.0468739 - MBÚ 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Borthakur, P. - Boruah, P.K. - Hussain, N. - Sharma, B. - Das, M. R. - Matić, S. - Řeha, David - Minofar, Babak
Experimental and Molecular Dynamics Simulation Study of Specific Ion Effect on the Graphene Oxide Surface and Investigation of the Influence on Reactive Extraction of Model Dye Molecule at Water-Organic Interface.
Journal of Physical Chemistry C. Roč. 120, č. 26 (2016), s. 14088-14100. ISSN 1932-7447. E-ISSN 1932-7455
Grant CEP: GA ČR GA13-21053S; GA MŠMT(CZ) LM2015055
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: AIR/WATER INTERFACE * AQUEOUS-SOLUTIONS * INITIAL CONFIGURATIONS
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 4.536, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0267387Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 190_Experimental and Molecular Dynamics Simulation Study.pdf 4 6.3 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 7.0468730 - MBÚ 2017 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Harifi-Mood, A.R. - Ghobadi, R. - Matić, S. - Minofar, Babak - Řeha, David
Solvation analysis of some Solvatochromic probes in binary mixtures of reline, ethaline, and glyceline with DMSO.
Journal of Molecular Liquids. Roč. 22, OCT 2016 (2016), s. 845-853. ISSN 0167-7322. E-ISSN 1873-3166
Grant CEP: GA ČR GA13-21053S; GA MŠMT(CZ) LM2015055
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Deep eutectic solvents * Solvatochromic parameters * Preferential solvation
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 3.648, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0267388Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 190_Minofar_Reha_2016_JourMolecLiquids.pdf 6 981.1 KB Vydavatelský postprint vyžádat - 8.0464514 - MBÚ 2017 NL eng J - Článek v odborném periodiku
Zayats, Vasilina - Stockner, T. - Pandey, Saurabh Kumar - Wörz, K. - Ettrich, Rüdiger - Ludwig, Jost
A refined atomic scale model of the Saccharomyces cerevisiae K+-translocation protein Trk1p combined with experimental evidence confirms the role of selectivity filter glycines and other key residues.
Biochimica Et Biophysica Acta-Biomembranes. Roč. 1848, č. 5 (2015), s. 1183-1195. ISSN 0005-2736. E-ISSN 1879-2642
Grant CEP: GA ČR GA13-21053S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: K+-translocation * Eukaryotic Trk * Saccharomyces cerevisiae
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 3.687, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0263754 - 9.0463207 - MBÚ 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Frischauf, I. - Zayats, Vasilina - Deix, M. - Hochreiter, A. - Jardin, I. - Muik, M. - Lackner, B. - Svobodová, B. - Pammer, T. - Litviňuková, M. - Sridhar, A.A. - Derler, I. - Bogeski, I. - Romanin, Ch. - Ettrich, Rüdiger - Schindel, R.
A calcium-accumulating region, CAR, in the channel Orai1 enhances Ca2+ permeation and SOCE-induced gene transcription.
Science Signaling. Roč. 8, č. 408 (2015), ra131. ISSN 1945-0877. E-ISSN 1937-9145
Grant CEP: GA ČR GA13-21053S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS * CRAC CHANNEL * PORE ARCHITECTURE
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 7.359, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0262450 - 10.0463164 - MBÚ 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Derler, I. - Jardin, I. - Stathopulos, P.B. - Muik, M. - Fahrner, M. - Zayats, Vasilina - Pandey, Saurabh Kumar - Poteser, M. - Lackner, B. - Absolonova, M. - Schindl, R. - Groschner, K. - Ettrich, Rüdiger - Ikura, M. - Romanin, Ch.
Cholesterol modulates Orai1 channel function.
Science Signaling. Roč. 9, č. 412 (2016), ra10. ISSN 1945-0877. E-ISSN 1937-9145
Grant CEP: GA ČR GA13-21053S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: ACTIVATES CRAC CHANNELS * OPERATED CA2+ ENTRY * PLASMA-MEMBRANE
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 6.830, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0262422