Výsledky vyhledávání
- 1.0617433 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Contreras, M. - Rafael, M. - Sobrino, I. - Almazán, C. - Comin, J.J.P. - Valdés, James J. - Prudencio, C. R. - Neto, D.F.d.L. - Borin, V.A. - Agarwal, P.K. - Kasaija, P.D. - Fernandez-Melgar, R. - Rutaisire, J. - de la Fuente, J.
Modelling protein-protein interactions for the design of vaccine chimeric antigens with protective epitopes.
PLoS ONE. Roč. 20, č. 2 (2025), č. článku e0318439. ISSN 1932-6203. E-ISSN 1932-6203
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: vector infestations * molecular-dynamics * tick infestations * subolesin/akirin * complement * parameters * microplus * insights * ligand * server
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 2.9, rok: 2023 ; AIS: 0.886, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0318439DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0318439
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0365060 - 2.0601940 - BC 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Valdés, James J. - Petrash, Daniel A. - Konhauser, K.O.
A novel in-silico model explores LanM homologs among Hyphomicrobium spp.
Communications Biology. Roč. 7, č. 1 (2024), č. článku 1539. E-ISSN 2399-3642
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004624; GA ČR(CZ) GJ19-15096Y; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001782
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: rare-earth-elements * metal-ions * protein * parameters * genes * identification * substitutions * biosynthesis * separation * water
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.2, rok: 2023 ; AIS: 2.036, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://doi.org/10.1038/s42003-024-07258-3DOI: https://doi.org/10.1038/s42003-024-07258-3
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0359159 - 3.0574479 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Guerrib, F. - Ning, C. - Mateos-Hernández, L. - Rakotobe, S. - Park, Y. - Hajdušek, Ondřej - Perner, Jan - Vancová, Marie - Valdés, James J. - Šimo, L.
Dual SIFamide receptors in Ixodes salivary glands.
Insect Biochemistry and Molecular Biology. Roč. 158, JULY (2023), č. článku 103963. ISSN 0965-1748. E-ISSN 1879-0240
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GM22-18424M; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: SIFamide * SIFamide receptors * Ticks * Salivary gland acini * Synganglion
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.2, rok: 2023 ; AIS: 0.916, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0965174823000577?via%3DihubDOI: https://doi.org/10.1016/j.ibmb.2023.103963
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345444 - 4.0554305 - BC 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Mateos-Hernandez, L. - Pipova, N. - Allain, E. - Henry, C. - Rouxel, J. - Lagree, A. - Haddad, N. - Boulouis, H. - Valdés, James J. - Alberdi, P. - de la Fuente, J. - Cabezas-Cruz, A. - Šimo, L.
Enlisting the Ixodes scapularis Embryonic ISE6 Cell Line to Investigate the Neuronal Basis of Tick-Pathogen Interactions.
Pathogens. Roč. 10, č. 1 (2021), č. článku 70. ISSN 2076-0817. E-ISSN 2076-0817
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Ixodes scapularis ISE6 cell line * neuropeptides * Anaplasma phagocytophilum * synganglion
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.531, rok: 2021 ; AIS: 0.85, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.mdpi.com/2076-0817/10/1/70DOI: https://doi.org/10.3390/pathogens10010070
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0328939 - 5.0554258 - BC 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Leannec-Rialland, V. - Cabezas-Cruz, A. - Atanasova, V. - Chereau, S. - Ponts, N. - Tonk, M. - Vilcinskas, A. - Ferrer, N.G. - Valdés, James J. - Richard-Forget, F.
Tick defensin gamma-core reduces Fusarium graminearum growth and abrogates mycotoxins production with high efficiency.
Scientific Reports. Roč. 11, č. 1 (2021), č. článku 7962. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: antifungal plant defensins * force-field * protein * dynamics * automation * parameters * interface * peptides * acid * nad1
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.997, rok: 2021 ; AIS: 1.208, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.nature.com/articles/s41598-021-86904-wDOI: https://doi.org/10.1038/s41598-021-86904-w
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0328878 - 6.0540544 - BC 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Štefánik, M. - Valdés, James J. - Ezebuo, F.C. - Haviernik, J. - Uzochukwu, I.C. - Fojtiková, M. - Salát, J. - Eyer, Luděk - Růžek, Daniel
FDA-Approved Drugs Efavirenz, Tipranavir, and Dasabuvir Inhibit Replication of Multiple Flaviviruses in Vero Cells.
Microorganisms. Roč. 8, č. 4 (2020), č. článku 599. ISSN 2076-2607. E-ISSN 2076-2607
Grant CEP: GA MZd(CZ) NV16-34238A
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: nucleoside inhibitors * virus * protein * screen * pele * fda * flavivirus * Zika virus * tick-borne encephalitis virus * West Nile virus * antiviral
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.128, rok: 2020 ; AIS: 0.885, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.mdpi.com/2076-2607/8/4/599DOI: https://doi.org/10.3390/microorganisms8040599
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0318171 - 7.0537402 - BC 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Gobl, Julia - Sinha, Deepak Kumar - Šíma, Radek - Perner, Jan - Kopáček, Petr - Valdés, James J. - Rego, Ryan O. M. - Cabezas-Cruz, A.
Histone Methyltransferase DOT1L Is Involved in Larval Molting and Second Stage Nymphal Feeding in Ornithodoros moubata.
Vaccines. Roč. 8, č. 2 (2020), č. článku 157. ISSN 2076-393X. E-ISSN 2076-393X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-01832S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: rhipicephalus boophilus microplus * tick * methylation * acari * chromatin * midgut * domain * genes * Ornithodoros moubata * histone methyltransferase * dot1l
Obor OECD: Immunology
Impakt faktor: 4.422, rok: 2020 ; AIS: 1.346, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.mdpi.com/2076-393X/8/2/157DOI: https://doi.org/10.3390/vaccines8020157
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0315118 - 8.0537154 - BC 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Artigas-Jerónimo, S. - Pastor Comin, J.J. - Villar, M. - Contreras, M. - Alberdi, P. - Leon Viera, I. - Soto, L. - Cordero, R. - Valdés, James J. - Cabezas-Cruz, A. - Estrada-Peña, A. - de la Fuente, J.
A Novel Combined Scientific and Artistic Approach for the Advanced Characterization of Interactomes: The Akirin/Subolesin Model.
Vaccines. Roč. 8, č. 1 (2020), č. článku 77. ISSN 2076-393X. E-ISSN 2076-393X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: vector infestations * gene-expression * nuclear-factor * interaction map * ifn-beta * tick * drosophila * subolesin/akirin * prediction * proteins * akirin * subolesin * interactome * art * evolution * music * yeast two-hybrid * NF-kappa B * vaccine * quantum vaccinomics * protective epitope
Obor OECD: Immunology
Impakt faktor: 4.422, rok: 2020 ; AIS: 1.346, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.mdpi.com/2076-393X/8/1/77DOI: https://doi.org/10.3390/vaccines8010077
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0314905 - 9.0520583 - BC 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Valdés, James J. - Miller, A. D.
New opportunities for designing effective small interfering RNAs.
Scientific Reports. Roč. 9, NOV 6 2019 (2019), č. článku 16146. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: active-site * hepatitis-c * all-atom * protein * replication * exploration * inhibition * pseudoknot * expression * pele
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.998, rok: 2019 ; AIS: 1.261, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.nature.com/articles/s41598-019-52303-5.pdf
DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-019-52303-5
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0305239 - 10.0519417 - BC 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Eyer, Luděk - Nougairede, A. - Uhlířová, M. - Driouich, J.-S. - Zouharová, D. - Valdés, James J. - Haviernik, J. - Gould, E. A. - De Clercq, E. - de Lamballerie, X. - Růžek, Daniel
An E460D Substitution in the NS5 Protein of Tick-Borne Encephalitis Virus Confers Resistance to the Inhibitor Galidesivir (BCX4430) and Also Attenuates the Virus for Mice.
Journal of Virology. Roč. 93, č. 16 (2019), č. článku e00367-19. ISSN 0022-538X. E-ISSN 1098-5514
Grant CEP: GA MZd(CZ) NV16-34238A
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: zika virus * nucleoside analog * polymerase * culture * fever * dna * bcx4430 * galidesivir * attenuation * drug resistance * mutation * tick-borne encephalitis virus
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.501, rok: 2019 ; AIS: 1.423, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://jvi.asm.org/content/jvi/early/2019/05/23/JVI.00367-19.full.pdf
DOI: https://doi.org/10.1128/JVI.00367-19
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0304389