Výsledky vyhledávání
- 1.0575354 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tužinčin, D. - Padrta, P. - Šanderová, Hana - Rabatinová, Alžběta - Bendová, K. - Krásný, Libor - Zídek, L. - Kadeřávek, P.
Characterization of a transitionally occupied state and thermal unfolding of domain 1.1 of s(A) factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis.
Proteins-Structure, Function and Bioinformatics. Roč. 91, č. 9 (2023), s. 1276-1287. ISSN 0887-3585. E-ISSN 1097-0134
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: s(A) factor * RNA polymerase * Bacillus subtilis * nmr * conformational exchange
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 2.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/prot.26531
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345141Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Characterization of a transitionally occupied state and thermal.pdf 1 1.8 MB Vydavatelský postprint povolen - 2.0511008 - ÚOCHB 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kubáň, V. - Srb, Pavel - Štégnerová, H. - Padrta, P. - Zachrdla, M. - Jeseňáková, Z. - Šanderová, Hana - Vítovská, Dragana - Krásný, Libor - Koval, Tomáš - Dohnálek, Jan - Ziemska-Legiecka, J. - Grynberg, M. - Jarnot, P. - Gruca, A. - Jensen, M. R. - Blackledge, M. - Žídek, L.
Quantitative Conformational Analysis of Functionally Important Electrostatic Interactions in the Intrinsically Disordered Region of Delta Subunit of Bacterial RNA Polymerase.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 141, č. 42 (2019), s. 16817-16828. ISSN 0002-7863. E-ISSN 1520-5126
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-12956S; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) LM2015055
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971 ; RVO:86652036
Klíčová slova: residual dipolar couplings * Bacillus subtilis * gene expression
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Microbiology (MBU-M); Biochemistry and molecular biology (BTO-N)
Impakt faktor: 14.612, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.9b07837
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0301354Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 121_Quantitative Conformational Analysis of Functionally Important.pdf 8 1.9 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 3.0477069 - MBÚ 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zachrdla, M. - Padrta, P. - Rabatinová, Alžběta - Šanderová, Hana - Barvík, I. - Krásný, Libor - Žídek, L.
Solution structure of domain 1.1 of the sigma(A) factor from Bacillus subtilis is preformed for binding to the RNA polymerase core.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 292, č. 28 (2017), s. 11610-11617. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Grant CEP: GA ČR GA13-16842S; GA MŠMT(CZ) LQ1601
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Bacillus * molecular modeling * nuclear magnetic resonance (NMR)
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.011, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0273469 - 4.0471360 - BFÚ 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kadeřávek, Pavel - Zapletal, V. - Fiala, R. - Srb, P. - Padrta, P. - Přecechtělová, J. - Šoltésová, M. - Kowalewski, J. - Widmalm, G. - Chmelík, Josef - Sklenář, V. - Žídek, L.
Spectral density mapping at multiple magnetic fields suitable for C-13 NMR relaxation studies.
Journal of Magnetic Resonance. A. Roč. 266, MAY2016 (2016), s. 23-40. ISSN 1064-1858
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:61388971
Klíčová slova: molecular-orbital methods * protein backbone dynamics
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika; EE - Mikrobiologie, virologie (MBU-M)
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0268748 - 5.0348132 - MBÚ 2011 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Motáčková, V. - Šanderová, Hana - Žídek, L. - Nováček, J. - Padrta, P. - Švenková, Alžběta - Korelusová, Jana - Jonák, Jiří - Krásný, Libor - Sklenář, V.
Solution structure of the N-terminal domain of Bacillus subtilis δ subunit of RNA polymerase and its classification based on structural homologs.
Proteins-Structure, Function and Bioinformatics. Roč. 78, č. 7 (2010), s. 1807-1810. ISSN 0887-3585. E-ISSN 1097-0134
Grant CEP: GA ČR GA204/09/0583; GA MZd NR9138
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50200510; CEZ:AV0Z50520514
Klíčová slova: RNA polymerase * delta subunit * gram-positive bacteria
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 2.813, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0188742 - 6.0340850 - MBÚ 2010 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Novák, P. - Žídek, L. - Motáčková, V. - Padrta, P. - Švenková, Alžběta - Nuzillard, J.-M. - Krásný, Libor - Sklenář, V.
S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments.
Journal of Biomolecular NMR. Roč. 46, č. 2 (2010), s. 191-197. ISSN 0925-2738. E-ISSN 1573-5001
Grant CEP: GA ČR GA204/09/0583
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50200510
Klíčová slova: Software * Sparky * Residual dipolar couplings
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 3.047, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0184010 - 7.0334395 - ÚOCHB 2010 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Macek, Pavel - Chmelík, Josef - Křížová, Ivana - Kadeřávek, P. - Padrta, P. - Žídek, L. - Wildová, Marcela - Hadravová, Romana - Chaloupková, R. - Pichová, Iva - Ruml, T. - Rumlová, Michaela - Sklenář, V.
NMR structure of the N-terminal domain of capsid protein from the Mason-Pfizer monkey virus.
Journal of Molecular Biology. Roč. 392, č. 1 (2009), s. 100-114. ISSN 0022-2836. E-ISSN 1089-8638
Grant CEP: GA MŠMT LC545; GA MŠMT 1M0508; GA ČR GA204/09/1388; GA ČR GESCO/06/E001
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) 1M0520; MŠk(CZ) LC06030
Program: 1M; LC
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506; CEZ:AV0Z50200510
Klíčová slova: M-PMV * betaretroviruses * capsid protein * NMR structure * internal dynamics
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.871, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0179142