Výsledky vyhledávání
- 1.0583805 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kavagutti, Vinicius Silva - Bulzu, Paul-Adrian - Chiriac, Maria-Cecilia - Salcher, Michaela M. - Mukherjee, Indranil - Shabarova, Tatiana - Grujčič, Vesna - Mehrshad, Maliheh - Kasalický, Vojtěch - Andrei, A.S. - Jezberová, Jitka - Seďa, Jaromír - Rychtecký, Pavel - Znachor, Petr - Šimek, Karel - Ghai, Rohit
High-resolution metagenomic reconstruction of the freshwater spring bloom.
Microbiome. Roč. 11, č. 1 (2023), č. článku 15. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA21-21990S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR GA22-03662S; GA ČR(CZ) GA19-23261S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: bacterioplankton populations * seasonal succession * giant virus * chrysochromulina
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 15.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s40168-022-01451-4
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351803 - 2.0583794 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Park, Hongjae - Shabarova, Tatiana - Salcher, Michaela M. - Kosová, Lenka - Rychtecký, Pavel - Mukherjee, Indranil - Šimek, Karel - Porcal, Petr - Seďa, Jaromír - Znachor, Petr - Kasalický, Vojtěch
In the right place, at the right time: the integration of bacteria into the Plankton Ecology Group model.
Microbiome. Roč. 11, č. 1 (2023), č. článku 112. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GA19-00113S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417; GA ČR GA22-33245S; GA ČR GF22-35826K
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: rna gene-sequences * niche separation * Freshwater reservoirs * Microbial communities * Spatiotemporal dynamics * Microdiversity * PEG model
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 15.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s40168-023-01522-0
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351793 - 3.0538633 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Grujčič, Vesna - Mukherjee, Indranil - Kasalický, Vojtěch - Nedoma, Jiří - Posch, T. - Mehrshad, Maliheh - Salcher, Michaela M.
Cascading effects in freshwater microbial food webs by predatory Cercozoa, Katablepharidacea and ciliates feeding on aplastidic bacterivorous cryptophytes.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 96, č. 10 (2020), č. článku fiaa121. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ciliates * bacterivorous and predatory flagellates * Cercozoa * Cryptophyceae * freshwater microbial food webs * Katablepharidacea
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 4.194, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/femsec/fiaa121
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0316400Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup SIMEK FEMS Microbiol Ecol 2020.pdf 0 3.9 MB Autorský preprint povolen - 4.0495270 - BC 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nguyen, N.H.A. - Špánek, R. - Kasalický, Vojtěch - Ribas, D. - Vlková, D. - Řeháková, H. - Kejzlar, P. - Ševců, A.
Different effects of nano-scale and micro-scale zero-valent iron particles on planktonic microorganisms from natural reservoir water.
Environmental Science-Nano. Roč. 5, č. 5 (2018), s. 1117-1129. ISSN 2051-8153. E-ISSN 2051-8161
Grant CEP: GA ČR GA15-12197S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: in-situ remediation * zerovalent iron * bacterial communities * groundwater remediation
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 7.704, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288289 - 5.0495062 - BC 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Grujčič, Vesna - Hahn, M.W. - Horňák, Karel - Jezberová, Jitka - Kasalický, Vojtěch - Nedoma, Jiří - Salcher, Michaela M. - Shabarova, Tatiana
Bacterial prey food characteristics modulate community growth response of freshwater bacterivorous flagellates.
Limnology and Oceanography. Roč. 63, č. 1 (2018), s. 484-502. ISSN 0024-3590. E-ISSN 1939-5590
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: spring phytoplankton bloom * in-situ hybridization * bacterioplankton populations * metazoan zooplankton * genus limnohabitans
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.325, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288084 - 6.0495058 - BC 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Grujčič, Vesna - Nuy, J.K. - Salcher, Michaela M. - Shabarova, Tatiana - Kasalický, Vojtěch - Boenigk, J. - Jensen, M. - Šimek, Karel
Cryptophyta as major bacterivores in freshwater summer plankton.
The ISME Journal. Roč. 12, č. 7 (2018), s. 1668-1681. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: in-situ hybridization * ribosomal-rna genes * community composition * protist diversity * functional diversity
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 9.493, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288083 - 7.0487086 - BC 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kasalický, Vojtěch - Zeng, Yonghui - Piwosz, Kasia - Šimek, Karel - Kratochvílová, Hana - Koblížek, Michal
Aerobic Anoxygenic Photosynthesis Is Commonly Present within the Genus Limnohabitans.
Applied and Environmental Microbiology. Roč. 84, č. 1 (2018), č. článku e02116-17. ISSN 0099-2240. E-ISSN 1098-5336
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EE2.3.30.0032; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR GA15-12197S; GA MŠMT(CZ) LO1416
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61388971
Klíčová slova: fish * IR microscopy * Limnohabitans * bacteriochlorophyll * bchY
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (MBU-M)
Impakt faktor: 4.077, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0281771 - 8.0483176 - BC 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Horňák, K. - Kasalický, Vojtěch - Šimek, Karel - Grossart, H. P.
Strain-specific consumption and transformation of alga-derived dissolved organic matter by members of the Limnohabitans-C and Polynucleobacter-B clusters of Betaproteobacteria.
Environmental Microbiology. Roč. 19, č. 11 (2017), s. 4519-4535. ISSN 1462-2912. E-ISSN 1462-2920
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: bacterial community composition * fresh-water reservoir * free amino-acids * extracellular products * marine-bacteria
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.974, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0278570 - 9.0480568 - BC 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Jezberová, Jitka - Jezbera, Jan - Znachor, Petr - Nedoma, Jiří - Kasalický, Vojtěch - Šimek, Karel
The Limnohabitans genus harbors generalistic and opportunistic subtypes: Evidence from spatiotemporal succession in a canyon-shaped reservoir.
Applied and Environmental Microbiology. Roč. 83, č. 21 (2017), č. článku e01530-17. ISSN 0099-2240. E-ISSN 1098-5336
Grant CEP: GA ČR GA15-12197S; GA ČR(CZ) GA13-00243S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Limnohabitans * canyon-shaped freshwater reservoir * bacterial diversity * reverse line blot hybridization
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.633, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0276320 - 10.0479532 - BC 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Shabarova, Tatiana - Kasalický, Vojtěch - Šimek, Karel - Nedoma, Jiří - Znachor, Petr - Posch, T. - Pernthaler, J. - Salcher, Michaela M.
Distribution and ecological preferences of the freshwater lineage LimA (genus Limnohabitans) revealed by a new double hybridization approach.
Environmental Microbiology. Roč. 19, č. 3 (2017), s. 1296-1309. ISSN 1462-2912. E-ISSN 1462-2920
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR GA15-12197S; GA ČR GA15-09721S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: dissolved organic-matter * in-situ hybridization * bacterial community composition * polynucleobacter-necessarius
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.974, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0275522