Výsledky vyhledávání
- 1.0585509 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Polák, Marek - Černý, Jiří - Novák, Petr
Isotopic Depletion Increases the Spatial Resolution of FPOP Top-Down Mass Spectrometry Analysis.
Analytical Chemistry. Roč. 96, č. 4 (2024), s. 1478-1487. ISSN 0003-2700. E-ISSN 1520-6882
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5107; GA ČR(CZ) GA22-27695S; GA MŠMT(CZ) LM2018127; GA MŠMT(CZ) LM2023055; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
GRANT EU: European Commission(XE) 731077 - EU_FT-ICR_MS; European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652036
Klíčová slova: fast photochemical oxidation * amino-acid-residues * radiolytic modification * hydrogen-peroxide * structural probes * molecular-mass * cytochrome-c * protein * peptides * exchange
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 7.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.3c03759
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353192 - 2.0583323 - BTÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nováková, Zora - Tehrani, Zahra Aliakbar - Jurok, R. - Motlová, Lucia - Kutil, Zsofia - Pavlíček, Jiří - Shukla, Shivam - Choy, C. J. - Havlínová, Barbora - Baranová, Petra - Berkman, C. E. - Kuchař, M. - Černý, Jiří - Bařinka, Cyril
Structural, Biochemical, and Computational Characterization of Sulfamides as Bimetallic Peptidase Inhibitors.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 64, č. 3 (2024), s. 1030-1042. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102; GA MŠMT(CZ) LM2023055
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: glutamate-carboxypeptidase-ii * carbonic-anhydrase inhibitors * membrane antigen * siderophore biosynthesis
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.3c01542
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353346 - 3.0582988 - BTÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Schneider, Bohdan - Sweeney, B. A. - Bateman, A. - Černý, Jiří - Zok, T. - Szachniuk, M.
When will RNA get its AlphaFold moment?
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 18 (2023), s. 9522-9352. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023055
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR-CZ II - 90131
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: conformation-dependent restraints * 3-dimensional structure * structure prediction * ribosomal-subunit
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/51/18/9522/7272628?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351031 - 4.0582984 - BTÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Flores, S. C. - Malý, Michal - Hrebík, D. - Plevka, P. - Černý, Jiří
Are kuravirus capsid diameters quantized? The first all-atom genome tracing method for double-stranded DNA viruses.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 3 (2024). ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: bacteriophage * forces * rna
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/52/3/e12/7469970?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353358 - 5.0574533 - BTÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Malý, Martin - Kolenko, Petr - Stránský, Jan - Švecová, Leona - Dušková, Jarmila - Koval, Tomáš - Skálová, Tereza - Trundová, Mária - Adámková, Kristýna - Černý, Jiří - Božíková, Paulina - Dohnálek, Jan
Tetracycline-modifying enzyme SmTetX from Stenotrophomonas maltophilia.
Acta Crystallographica Section F-Structural Biology and Crystallization Communications. Roč. 79, JUL 2023 (2023), s. 180-192. ISSN 1744-3091. E-ISSN 2053-230X
Grant CEP: GA MŠMT EF16_019/0000778; GA MŠMT EF15_003/0000447; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0015974
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: FAD-dependent monooxygenases * tetracycline * antibiotic resistance
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 0.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?S2053230X23005381
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346203 - 6.0574529 - BTÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Svoboda, Jakub - Berdár, Daniel - Kolenko, Petr - Černý, Jiří - Nováková, Zora - Pavlíček, Jiří - Schneider, Bohdan
Conformation-based refinement of 18-mer DNA structures.
Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography. Roč. 79, JUL 2023 (2023), s. 655-665. ISSN 1399-0047. E-ISSN 2059-7983
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA18197; GA MŠMT EF16_019/0000778
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: DNA structure * dnatco.datmos.org * structure validation * structure refinement * base pairing
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?S2059798323004679
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345411 - 7.0569555 - BTÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Lišková, Veronika - Kosztyu, P. - Kuchař, Milan - Černý, Jiří - Bharadwaj, Shiv - Petroková, Hana - Vroblova, E. - Křupka, M. - Malý, Michal - Zosincuková, Tereza - Sulc, Josef - Kafkova, L. R. - Raška, M. - Malý, Petr
Myomedin replicas of gp120 V3 loop glycan epitopes recognized by PGT121 and PGT126 antibodies as non-cognate antigens for stimulation of HIV-1 broadly neutralizing antibodies.
Frontiers in Immunology. Roč. 13, DEC 8 2022 (2022), č. článku 1066361. ISSN 1664-3224. E-ISSN 1664-3224
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007397
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: hiv-1 * glycoprotein 120 * protein scaffold * protein engineering * broadly neutralizing antibody * vaccine
Obor OECD: Immunology
Impakt faktor: 7.3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fimmu.2022.1066361/full
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0341007 - 8.0569542 - BTÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vondráková, Jana - Frolíková, Michaela - Děd, Lukáš - Černý, Jiří - Postlerová, Pavla - Páleníková, Veronika - Šimoník, Ondřej - Nahácka, Zuzana - Bašus, Kryštof - Valášková, Eliška - Machan, R. - Pacey, A. - Holubcová, Z. - Koubek, P. - Ezrová, Zuzana - Park, S. - Liu, R. - Partha, R. - Clark, N. - Neužil, Jiří - Ikawa, M. - Erickson, K. - Lam, Kit S. - Moore, H. - Komrsková, Kateřina
MAIA, Fc receptor-like 3, supersedes JUNO as IZUMO1 receptor during human fertilization.
Science Advances. Roč. 8, č. 36 (2022), č. článku eabn0047. ISSN 2375-2548. E-ISSN 2375-2548
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-11275S; GA ČR(CZ) GA22-30494S; GA ČR(CZ) GX21-04607X
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: SPERM * REVEALS * PROTEIN * EGG * LIBRARY
Obor OECD: Reproductive biology (medical aspects to be 3)
Impakt faktor: 13.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abn0047
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340897 - 9.0560262 - BTÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Biedermannová, Lada - Černý, Jiří - Malý, Michal - Nekardová, Michaela - Schneider, Bohdan
Knowledge-based prediction of DNA hydration using hydrated dinucleotides as building blocks.
Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography. Roč. 78, AUG 1 2022 (2022), s. 1032-1045. ISSN 1399-0047. E-ISSN 2059-7983
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA18197; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: DNA hydration * water * dinucleotide fragments * knowledge-based prediction * WatNA
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 2.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?S2059798322006234
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0333870 - 10.0556414 - BTÚ 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Aliakbar Tehrani, Zahra - Rulíšek, Lubomír - Černý, Jiří
Molecular dynamics simulations provide structural insight into binding of cyclic dinucleotides to human STING protein.
Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. JUN 2021, JUN 2021 (2021), č. článku 2021-07-12. ISSN 0739-1102
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001777; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LM2018131; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001776; GA ČR(CZ) GA20-08772S
Výzkumná infrastruktura: CESNET II - 90042
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: NETWORK ANALYSIS * INTERFERON GENES * LIGAND * RECOGNITION
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.235, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/07391102.2021.1942213
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0330635