Výsledky vyhledávání
- 1.0327972 - ÚOCHB 2010 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Berka, Karel - Hobza, Pavel - Vondrášek, Jiří
Analysis of Energy Stabilization inside the Hydrophobic Core of Rubredoxin.
ChemPhysChem. Roč. 10, č. 3 (2009), s. 543-548. ISSN 1439-4235. E-ISSN 1439-7641
Grant CEP: GA ČR GA203/05/0009; GA ČR GA203/06/1727; GA ČR(CZ) GD203/05/H001; GA AV ČR IAA400550510; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: hydrophobic core * protein stability * SAPT method
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.453, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0174393 - 2.0324799 - ÚOCHB 2009 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Berka, Karel - Laskowski, R. - Riley, K. E. - Hobza, Pavel - Vondrášek, Jiří
Representative amino acid side chain interactions in proteins. A comparison of highly accurate correlated ab initio quantum chemical and empirical potential procedures.
[Reprezentativní interakce aminokyselin v proteinech: srovnání přesných ab-initio kvantově chemických výpočtů s empirickými potenciály.]
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 5, č. 4 (2009), s. 982-992. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR GA203/05/0009; GA ČR(CZ) GD203/05/H001; GA AV ČR IAA400550510; GA MŠMT LC512
Grant ostatní: NSF(US) EPS-0701525
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: amino acid * ab initio methods * empirical potentials
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.804, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0172408 - 3.0315732 - ÚOCHB 2009 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Řezáč, Jan - Jurečka, Petr - Riley, Kevin Eugene - Černý, Jiří - Valdes, Haydee - Pluháčková, Kristýna - Berka, Karel - Řezáč, Tomáš - Pitoňák, Michal - Vondrášek, Jiří - Hobza, Pavel
Quantum chemical benchmark energy and geometry database for molecular clusters and complex molecular systems (www.begdb.com): a users manual and examples.
[Kvantově-chemická databáze energií a geometrií molekulových klastrů a komplexních molekulových systémů (www.begdb.com): uživatelský manuál a příklady.]
Collection of Czechoslovak Chemical Communications. Roč. 73, č. 10 (2008), s. 1261-1270. ISSN 0010-0765
Grant CEP: GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: ab initio calculations * coupled cluster method * internet database
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 0.784, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0165848 - 4.0315418 - ÚOCHB 2009 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Řezáč, Jan - Berka, Karel - Horinek, D. - Hobza, Pavel - Vondrášek, Jiří
The stabilization energy of the Glu-Lys salt bridge in the protein/water environment: Correlated quantum chemical ab initio, DFT and empirical potential studies.
[Stabilizační energie iontového páru Glu-Lys pro protein ve vodném prostředí: studie pomocí metod kvantové chemie, DFT a empirického potenciálu.]
Collection of Czechoslovak Chemical Communications. Roč. 73, 6/7 (2008), s. 921-936. ISSN 0010-0765
Grant CEP: GA AV ČR IAA400550510; GA ČR GA203/06/1727; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: salt bridges * ion pairs * protein stabilization * interaction energies * protein dielectric
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 0.784, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0165624 - 5.0314772 - ÚOCHB 2009 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Biedermannová, Lada - Riley, Kevin Eugene - Berka, Karel - Hobza, Pavel - Vondrášek, Jiří
Another role of proline: stabilization interactions in proteins and protein complexes concerning proline and tryptophane.
[Jiná úloha prolinu: stabilizační nterakce v proteinech a proteinových komlexech zahrnující prolin a tryptophane.]
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 10, č. 42 (2008), s. 6350-6359. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA ČR GA203/06/1727; GA ČR(CZ) GD203/05/H001; GA AV ČR IAA400550510; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506; CEZ:AV0Z50520701
Klíčová slova: proline * stabilization interaction * an-initio methods
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.064, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0165172