Výsledky vyhledávání
- 1.0573993 - ÚMG 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zapletalová, D. - Kubíček, K. - Svoboda, Petr - Štefl, R.
Dicer structure and function: conserved and evolving features.
Embo Reports. Roč. 24, č. 7 (2023), č. článku e57215. ISSN 1469-221X. E-ISSN 1469-3178
Grant CEP: GA ČR GX20-03950X
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Dicer * dsRBD * helicase * miRNA * siRNA
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.embopress.org/doi/epdf/10.15252/embr.202357215
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344368 - 2.0567476 - ÚMG 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Petržílek, Jan - Pasulka, Josef - Malík, Radek - Horvat, Filip - Kataruka, Shubhangini - Fulka, Helena - Svoboda, Petr
De novo emergence, existence, and demise of a protein-coding gene in murids.
BMC BIOLOGY. Roč. 20, č. 1 (2022), č. článku 272. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045; GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA MŠMT(CZ) LM2018126
GRANT EU: European Commission(XE) 647403 - D-FENS
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: De novo * Gene * Evolution * ltr * Retrotransposon * cag * Polyserine * D6Ertd527e * Oocyte
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-022-01470-5
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0338724 - 3.0567393 - ÚMG 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zapletal, D. - Táborská, Eliška - Pasulka, Josef - Malík, Radek - Kubíček, Karel - Zanova, M. - Much, C. - Šebesta, M. - Buccheri, Valeria - Horvat, Filip - Jeníčková, Irena - Procházková, Michaela - Procházka, Jan - Pinkas, M. - Nováček, J. - Florian Joseph, Diego André - Sedláček, Radislav - Bernecky, C. - O'Carroll, D. - Štefl, R. - Svoboda, Petr
Structural and functional basis of mammalian microRNA biogenesis by Dicer.
Molecular Cell. Roč. 82, č. 21 (2022), s. 4064-4079e.13. ISSN 1097-2765. E-ISSN 1097-4164
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018126; GA MŠMT(CZ) LM2018131; GA ČR GX20-03950X; GA MŠMT EF18_046/0015861
GRANT EU: European Commission(XE) 647403 - D-FENS
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140; CIISB II - 90127
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: cryo-em structure * guide strand selection * rna-binding * structure validation * expression * molprobity * trbp complex * mouse * specifity
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 16, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.molcel.2022.10.010
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0338651 - 4.0555394 - ÚMG 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Malík, Radek - Svoboda, Petr
CRISPR-Induced Expression of N-Terminally Truncated Dicer in Mouse Cells.
Genes. Roč. 12, č. 4 (2021), č. článku 540. E-ISSN 2073-4425
Grant CEP: GA ČR GX20-03950X
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: RNAi * Dicer * crispr * dCas9 * vp64 * ms2 * sgRNA
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 4.141, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2073-4425/12/4/540
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329915 - 5.0555019 - ÚMG 2022 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Loubalová, Zuzana - Fulka, Helena - Horvat, Filip - Pasulka, Josef - Malík, Radek - Hirose, M. - Ogura, A. - Svoboda, Petr
Formation of spermatogonia and fertile oocytes in golden hamsters requires piRNAs.
Nature Cell Biology. Roč. 23, č. 9 (2021), s. 992-1021. ISSN 1465-7392. E-ISSN 1476-4679
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018126; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Výzkumná infrastruktura: CCP II - 90126; Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: piwi proteins * genome activation * mammalian oocytes * r package * mili * retrotransposon * genes * mov10l1 * stage * roles
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 28.213, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41556-021-00746-2
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329636 - 6.0554909 - ÚMG 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kataruka, Shubhangini - Kinterová, Veronika - Horvat, Filip - Kulmann, Marcos Iuri Roos - Kaňka, Jiří - Svoboda, Petr
Physiologically relevant miRNAs in mammalian oocytes are rare and highly abundant.
Embo Reports. Roč. 23, č. 2 (2022), č. článku e53514. ISSN 1469-221X. E-ISSN 1469-3178
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:67985904
Klíčová slova: miR-10b * miR-205 * miRNA * NanoLuc * oocyte
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.embopress.org/doi/full/10.15252/embr.202153514
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329524 - 7.0539799 - ÚMG 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Svoboda, Petr
Key Mechanistic Principles and Considerations Concerning RNA Interference.
Frontiers in Plant Science. Roč. 11, August (2020), č. článku 1237. ISSN 1664-462X. E-ISSN 1664-462X
Grant CEP: GA MŠMT LO1419
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: RNAi * dicer * argonaute * miRNA * dsRNA * off-targeting
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.754, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2020.01237/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0317500 - 8.0537847 - ÚMG 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kataruka, Shubhangini - Modrák, Martin - Kinterová, Veronika - Malík, Radek - Zeitler, D.M. - Horvat, Filip - Kaňka, Jiří - Meister, G. - Svoboda, Petr
MicroRNA dilution during oocyte growth disables the microRNA pathway in mammalian oocytes.
Nucleic Acids Research. Roč. 48, č. 14 (2020), s. 8050-8062. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT LO1419; GA MŠMT(CZ) LM2015047; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:61388971 ; RVO:67985904
Klíčová slova: 3 abundance classes * gene-expression * messenger-rna * endogenous sirnas * let-7 represses * mouse oocytes * binding * dicer * cell * transcriptome
Obor OECD: Reproductive biology (medical aspects to be 3); Developmental biology (UZFG-Y); Biochemistry and molecular biology (MBU-M)
Impakt faktor: 16.971, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/48/14/8050/5866099
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0315680 - 9.0525646 - ÚMG 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Ganesh, Sravya - Horvat, Filip - Drutovič, Dávid - Efenberková, Michaela - Pinkas, Dominik - Jindrová, Anna - Pasulka, Josef - Iyyappan, Rajan - Malík, Radek - Šušor, Andrej - Vlahovicek, K. - Šolc, Petr - Svoboda, Petr
The most abundant maternal lncRNA Sirena1 acts post-transcriptionally and impacts mitochondrial distribution.
Nucleic Acids Research. Roč. 48, č. 6 (2020), s. 3211-3227. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT LO1419; GA MŠMT(CZ) LO1609; GA MŠMT(CZ) LM2011032; GA MŠMT(CZ) LM2015040; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LM2015062; GA ČR(CZ) GA18-19395S
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) LM2015042
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:67985904
Klíčová slova: gene-expression * messenger-rna * mouse oocytes * maturation * single * cell * normalization * transcription * evolution * sirnas
Obor OECD: Reproductive biology (medical aspects to be 3); Cell biology (UZFG-Y)
Impakt faktor: 16.971, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/48/6/3211/5709715
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0309757 - 10.0521827 - ÚMG 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Demeter, Tomáš - Vaškovicová, Michaela - Malík, Radek - Horvat, Filip - Pasulka, Josef - Svobodová, Eliška - Flemr, Matyáš - Svoboda, Petr
Main Constraints for RNAi Induced by Expressed Long dsRNA in Mouse Cells.
Life Science Alliance. Roč. 2, č. 1 (2019), č. článku e201800289. E-ISSN 2575-1077
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP305/12/G034; GA MŠMT LO1419
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) LM2015042
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: RNAi * dsRNA * Dicer
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.622, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://www.life-science-alliance.org/content/2/1/e201800289
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0306388Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Life_Science_Alliance_T_Demeter_2019.pdf 3 2.1 MB Vydavatelský postprint vyžádat