Výsledky vyhledávání
- 1.0456227 - BTÚ 2016 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nováková, Zora - Černý, Jiří - Choy, C.J. - Nedrow, J.R. - Choi, J.K. - Lubkowski, J. - Berkman, C.E. - Bařinka, Cyril
Design of composite inhibitors targeting glutamate carboxypeptidase II: the importance of effector functionalities.
FEBS Journal. Roč. 283, č. 1 (2016), s. 130-143. ISSN 1742-464X. E-ISSN 1742-4658
Grant CEP: GA ČR GAP301/12/1513; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) CZ.1.07/2.3.00/30.0045
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: molecular modeling * NAALADase * prostate-specific membrane antigen * X-ray crystallography
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 3.902, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0256806 - 2.0444448 - ÚOCHB 2016 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tykvart, Jan - Bařinka, Cyril - Svoboda, Michal - Navrátil, Václav - Souček, Radko - Hubálek, Martin - Hradilek, Martin - Šácha, Pavel - Lubkowski, J. - Konvalinka, Jan
Structural and Biochemical Characterization of a Novel Aminopeptidase from Human Intestine.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 290, č. 18 (2015), s. 11321-11336. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Grant CEP: GA ČR GAP304/12/0847; GA MŠMT LO1302; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:86652036
Klíčová slova: glutamate carboxypeptidase II * reaction mechanism * expression
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 4.258, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0247123 - 3.0433586 - BTÚ 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Pavlíček, Jiří - Ptáček, Jakub - Černý, Jiří - Byun, Y. - Škultétyová, Ĺubica - Pomper, M.G. - Lubkowski, J. - Bařinka, Cyril
Structural characterization of P1 '-diversified urea-based inhibitors of glutamate carboxypeptidase II.
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. Roč. 24, č. 10 (2014), s. 2340-2345. ISSN 0960-894X. E-ISSN 1464-3405
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Grant ostatní: EMBO(DE) 1978
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: GCPII * Prostate-specific membrane antigen * PSMA
Kód oboru RIV: FR - Farmakologie a lékárnická chemie
Impakt faktor: 2.420, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0238115Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Pavlicek_BioorgMedChemLett_24_2340_14.pdf 6 1.3 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 4.0431487 - ÚOCHB 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Navrátil, Michal - Ptáček, Jakub - Šácha, Pavel - Starková, Jana - Lubkowski, J. - Bařinka, Cyril - Konvalinka, Jan
Structural and biochemical characterization of the folyl-poly-gamma-L-glutamate hydrolyzing activity of human glutamate carboxypeptidase II.
FEBS Journal. Roč. 281, č. 14 (2014), s. 3228-3242. ISSN 1742-464X. E-ISSN 1742-4658
Grant CEP: GA ČR GAP304/12/0847; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Grant ostatní: OPPC(CZ) CZ.2.16/3.1.00/24016
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:86652036
Klíčová slova: arene-binding site * crystal structure * folate hydrolase 1 * H475Y(1561C -> T) * polymorphism * zinc metalloprotease
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 4.001, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0236127Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Navratil_FEBSJ_281_3228_14.pdf 2 1.1 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 5.0377067 - ÚOCHB 2013 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tykvart, Jan - Šácha, Pavel - Bařinka, Cyril - Knedlík, Tomáš - Starková, Jana - Lubkowski, J. - Konvalinka, Jan
Efficient and versatile one-step affinity purification of in vivo biotinylated proteins: Expression, characterization and structure analysis of recombinant human glutamate carboxypeptidase II.
Protein Expression and Purification. Roč. 82, č. 1 (2012), s. 106-115. ISSN 1046-5928. E-ISSN 1096-0279
Grant CEP: GA MŠMT 1M0508; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506; CEZ:AV0Z50520701
Klíčová slova: affinity purification * biotin acceptor peptide * recombinant protein expression * biotin-protein ligase (BirA) * co-localization * PSMA
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 1.429, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0215606 - 6.0369329 - BTÚ 2012 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Plechanovová, Anna - Byun, Y. - Alquicer, Glenda - Škultétyová, Ĺubica - Mlčochová, Petra - Němcová, Adriana - Kim, H.-J. - Navrátil, Michal - Mease, R. - Lubkowski, J. - Pomper, M. - Konvalinka, Jan - Rulíšek, Lubomír - Bařinka, Cyril
Novel Substrate-Based Inhibitors of Human Glutamate Carboxypeptidase II with Enhanced Lipophilicity.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 54, č. 21 (2011), s. 7535-7546. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ME10031; GA MŠMT LC512
Grant ostatní: EMBO(DE) 1978
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50520701; CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: Glutamate carboxypeptidase II. * QM/MM calculations * X-ray crystallography * lipophilicity * inhibitors
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 5.248, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0203422Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Plechanovova_JMedChem_54_7535_11.pdf 3 3.3 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 7.0349788 - BTÚ 2011 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zhang, A.X. - Murelli, R.P. - Bařinka, Cyril - Michel, J. - Cocleaza, A. - Jorgensen, W.L. - Lubkowski, J. - Spiegel, D.A.
A remote arene-binding site on prostate specific membrane antigen revealed by antibody-recruiting small molecules.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 132, č. 36 (2010), s. 12711-12716. ISSN 0002-7863. E-ISSN 1520-5126
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50520701
Klíčová slova: Prostate-specific membrane antigen * antibody recruiting molecules * Structure-activity relationship
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 9.019, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0189938Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Zhang_JACS_132_12711_10.pdf 18 881.5 KB Vydavatelský postprint vyžádat - 8.0333023 - ÚOCHB 2010 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hlouchová, Klára - Bařinka, C. - Konvalinka, Jan - Lubkowski, J.
Structural insight into the evolutionary and pharmacologic homology of glutamate carboxypeptidases II and III.
FEBS Journal. Roč. 276, č. 16 (2009), s. 4448-4462. ISSN 1742-464X. E-ISSN 1742-4658
Grant CEP: GA MŠMT 1M0508
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: GCPIII * NAALADase II * metallopeptidase
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.042, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0178112 - 9.0326498 - ÚOCHB 2010 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Klusák, Vojtěch - Bařinka, C. - Plechanovová, Anna - Mlčochová, Petra - Konvalinka, Jan - Rulíšek, Lubomír - Lubkowski, J.
Reaction mechanism of glutamate carboxypeptidase II revealed by mutagenesis, X-ray crystallography and computational methods.
Biochemistry. Roč. 48, č. 19 (2009), s. 4126-4138. ISSN 0006-2960
Grant CEP: GA MŠMT 1M0508; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: reaction mechanism * QM/MM calculations * glutamate carboxypeptidase II * X-ray crystallography * mutant activity
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.226, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0173587 - 10.0306830 - ÚOCHB 2008 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bařinka, C. - Hlouchová, Klára - Rovenská, Miroslava - Majer, P. - Dauter, M. - Hin, N. - Ko, Y. S. - Tsukamoto, T. - Slusher, B. S. - Konvalinka, Jan - Lubkowski, J.
Structural basis of interactions between human glutamate carboxypeptidase II and its substrate analogs.
[Strukturální podstata interakcí lidské glutamát karboxypeptidasy II a analogů jejích substrátů.]
Journal of Molecular Biology. Roč. 376, č. 5 (2008), s. 1438-1450. ISSN 0022-2836. E-ISSN 1089-8638
Grant CEP: GA MŠMT 1M0508
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: prostate-specific membrane antigen * metallopeptidase * folate hydrolase * NAALADase * phosphapeptide
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 4.146, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0159746