Výsledky vyhledávání
- 1.0575407 - BC 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Záhonová, Kristýna - Valach, M. - Tripathi, Pragya - Benz, Corinna - Opperdoes, F. R. - Baráth, P. - Lukáčová, V. - Danchenko, M. - Faktorová, Drahomíra - Horváth, A. - Burger, G. - Lukeš, Julius - Škodová-Sveráková, Ingrid
Subunit composition of mitochondrial dehydrogenase complexes in diplonemid flagellates.
Biochimica et Biophysica Acta-General Subjects. Roč. 1867, č. 9 (2023), č. článku 130419. ISSN 0304-4165. E-ISSN 1872-8006
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Grant ostatní: Gordon and Betty Moore Foundation(US) #9354
Program: Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Dehydrogenase complexes * Evolution * Diplonema papillatum * Diplonemids * Protist * Mitochondrion
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0304416523001174?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345272 - 2.0574463 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Valach, M. - Benz, Corinna - Aguilar, L.C. - Gahura, Ondřej - Faktorová, Drahomíra - Zíková, Alena - Oeffinger, M. - Burger, G. - Gray, M.W. - Lukeš, Julius
Miniature RNAs are embedded in an exceptionally protein-rich mitoribosome via an elaborate assembly pathway.
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 12 (2023), s. 6443-6460. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA ČR(CZ) GJ20-04150Y; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
GRANT EU: European Commission(XE) 101044951 - MitoSignal
Grant ostatní: Gordon and Betty Moore Foundation(US) GBMF9354
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: RNAs * protein-rich mitoribosome
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/51/12/6443/7173778?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344803Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Valach_2023_NucAcidRes.pdf 4 2.3 MB Vydavatelský postprint povolen - 3.0572381 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Valach, M. - Moreira, S. - Petitjean, C. - Benz, Corinna - Butenko, Anzhelika - Flegontova, Olga - Nenarokova, Anna - Prokopchuk, Galina - Batstone, T. - Lapébie, P. - Lemogo, L. - Sarrasin, M. - Stretenowich, P. - Tripathi, Pragya - Yazaki, E. - Nara, T. - Henrissat, B. - Lang, B.F. - Gray, M.W. - Williams, T.A. - Lukeš, Julius - Burger, G.
Recent expansion of metabolic versatility in Diplonema papillatum, the model species of a highly speciose group of marine eukaryotes.
BMC BIOLOGY. Roč. 21, č. 1 (2023), č. článku 99. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA20-07186S; GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA ČR(CZ) GA23-07695S
Grant ostatní: Gordon and Betty Moore Foundation(US) #9354
Program: Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Paradiplonema papillatum * Protists * Genome * Transcriptome * Proteome * Gene-family evolution * Lateral gene transfer * CAZymes * Feeding strategy * Geographical distribution * Ecological distribution
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-023-01563-9
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344455 - 4.0559941 - ÚMG 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Gray, M.W. - Burger, G. - Derelle, R. - Klimeš, V. - Leger, M.M. - Sarrasin, M. - Vlček, Čestmír - Roger, A. J. - Eliáš, M. - Lang, B.F.
The draft nuclear genome sequence and predicted mitochondrial proteome of Andalucia godoyi, a protist with the most gene-rich and bacteria-like mitochondrial genome.
BMC BIOLOGY. Roč. 18, č. 1 (2020), č. článku 22. E-ISSN 1741-7007
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Mitochondrion * Mitochondrial genome * Mitochondrial proteome * Mitochondrial evolution * Protist * Jakobids * Andalucia godoyi
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 7.431, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-020-0741-6
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0333061 - 5.0554256 - BC 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lax, G. - Kolísko, Martin - Eglit, Y. - Lee, W. - Yubuki, N. - Karnkowska, A. - Leander, B. S. - Burger, G. - Keeling, P. J. - Simpson, A.
Multigene phylogenetics of euglenids based on single-cell transcriptomics of diverse phagotrophs.
Molecular Phylogenetics and Evolution. Roč. 159, JUN 2021 (2021), č. článku 107088. ISSN 1055-7903. E-ISSN 1095-9513
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: living heterotrophic euglenids * ssu rdna data * character evolution * postgaardi-mariagerensis * feeding apparatus * n. gen. * ultrastructure * euglenozoa * position * software * Cell motility * Euglenozoa * Phylogenomics * Protozoa * Spirocuta * Symbiontida
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 5.019, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S105579032100021X?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0328876 - 6.0538265 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kaur, Binnypreet - Záhonová, Kristýna - Valach, M. - Faktorová, Drahomíra - Prokopchuk, Galina - Burger, G. - Lukeš, Julius
Gene fragmentation and RNA editing without borders: eccentric mitochondrial genomes of diplonemids.
Nucleic Acids Research. Roč. 48, č. 5 (2020), s. 2694-2708. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LL1601; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Grant ostatní: Gordon and Betty Moore Foundation(US) GBMF4983.01
Program: Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: transcriptome * algorithm * evolution * alignment * reconstruction * generation * protists * platform * extreme * tool
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 16.971, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/48/5/2694/5699674
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0316093 - 7.0537241 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Faktorová, Drahomíra - Nisbet, R.E.R. - Robledo, J.A.F. - Casacuberta, E. - Sudek, L. - Allen, A. E. - Ares, M. - Areste, C. - Balestreri, C. - Barbrook, A.C. - Beardslee, P. - Bender, S. - Booth, D.S. - Bowler, C. - Breglia, S.A. - Brownlee, C. - Burger, G. - Cerutti, H. - Cesaroni, R. - Chiurillo, M.A. - Clemente, T. - Coles, D.B. - Collier, J.L. - Cooney, E.C. - Coyne, K. - Docampo, R. - Dupont, C.L. - Edgcomb, V. - Einarsson, E. - Elustondo, P.A. - Federici, F. - Freire-Beneitez, V. - Freyria, N.J. - Fukuda, K. - Garcia, P.A. - Girguis, P.R. - Gomaa, F. - Hampl, V. - Kachale, Ambar - Kaur, Binnypreet - Keeling, P. J. - Vanclová-Novák, A.M.G. - Pyrih, J. - Lukeš, Julius … celkem 113 autorů
Genetic tool development in marine protists: emerging model organisms for experimental cell biology.
Nature Methods. Roč. 17, č. 5 (2020), s. 481-494. ISSN 1548-7091. E-ISSN 1548-7105
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Grant ostatní: Gordon and Betty Moore Foundation(US) GMBM4982.01
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: homologous recombination * transformation * genome
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 28.547, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41592-020-0796-x
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0314982 - 8.0498712 - BC 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kaur, Binnypreet - Valach, M. - Peña-Diaz, Priscila - Moreira, S. - Keeling, P. J. - Burger, G. - Lukeš, Julius - Faktorová, Drahomíra
Transformation of Diplonema papillatum, the type species of the highly diverse and abundant marine microeukaryotes Diplonemida (Euglenozoa).
Environmental Microbiology. Roč. 20, č. 3 (2018), s. 1030-1040. ISSN 1462-2912. E-ISSN 1462-2920
Grant CEP: GA ČR GA15-21974S; GA ČR(CZ) GA16-18699S; GA MŠMT LL1601
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: TRYPANOSOMA-BRUCEI * GENE-EXPRESSION * PROTEINS * DNA * KINETOPLASTIDA * RECOMBINATION * TRANSFECTION * EUKARYOTES
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 5.147, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0290994 - 9.0468794 - BC 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Valach, M. - Moreira, S. - Faktorová, Drahomíra - Lukeš, Julius - Burger, G.
Post-transcriptional mending of gene sequences: looking under the hood of mitochondrial gene expression in diplonemids.
RNA biology. Roč. 13, č. 12 (2016), s. 1204-1211. ISSN 1547-6286. E-ISSN 1555-8584
Grant CEP: GA ČR GA15-21974S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Cryptic genes * gene fragmentation * trans-splicing * RNA editing * multipartite mtDNA * diplonemids
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 3.900, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0266619 - 10.0364837 - BC 2012 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Flegontov, Pavel - Gray, M.W. - Burger, G. - Lukeš, Julius
Gene fragmentation: a key to mitochondrial genome evolution in Euglenozoa?
Current Genetics. Roč. 57, č. 4 (2011), 225-232. ISSN 0172-8083. E-ISSN 1432-0983
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z60220518
Klíčová slova: Euglena * Diplonema * Mitochondrial genome * RNA editing * Constructive neutral evolution
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 2.556, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0200214