Výsledky vyhledávání
- 1.0364223 - ÚOCHB 2012 CZ eng A - Abstrakt
Beššeová, Ivana - Réblová, Kamila - Leontis, N. B. - Šponer, Jiří
Intrinsically flexible ribosomal RNA segments. Family C3-way junctions and their possible role in the translation.
3rd Quantum Bioinorganic Chemistry Conference. Praha: -, 2011. s. 50-51.
[Quantum Bioinorganic Chemistry Conference /3./. 25.06.2011-28.06.2011, Český Krumlov]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: ribosomal RNA segments
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0199758 - 2.0332811 - BFÚ 2010 ES eng A - Abstrakt
Réblová, Kamila - Rázga, F. - Li, F. - Gao, W. - Frank, J. - Šponer, Jiří
Dynamics of the base of ribosomal A-site finger revealed by molecular dynamics simulations and Cryo-EM.
[Dynamika základu ribosomálního A-site fingru odkrytá pomocí molekulově dynamických simulací a Cryo-EM.]
Program & Abstracts. Barcelona, 2009. s. 15.
[Expanding the frontiers of molecular dynamics simulations in biology. BSC-IRB Joint Conference. 23.11.2009-25.11.2009, Barcelona]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: RNA * molecular dynamics * simulations
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0177947 - 3.0332770 - BFÚ 2010 ES eng A - Abstrakt
Beššeová, Ivana - Réblová, Kamila - Leontis, N.B. - Šponer, Jiří
Three-way junctions can act as flexible RNA structural elements in large RNA molecules: A molecular simulation analysis.
[Trojcestná rozhraní RNA mohou fungovat jako flexibilní strukturní elementy RNA ve velkých molekulách RNA: Analýza molekulové simulace.]
Program & Abstracts. Barcelona, 2009. s. 48.
[Expanding the frontiers of molecular dynamics simulations in biology. BSC-IRB Joint Conference. 23.11.2009-25.11.2009, Barcelona]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: RNA * molecular dynamics * simulations
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0177914 - 4.0327074 - BFÚ 2010 US eng A - Abstrakt
Réblová, Kamila - Rázga, Filip - Li, W. - Gao, H. - Frank, J. - Šponer, Jiří
Structural dynamics of elbow segment of E.coli ribosomal A-site finger. Comparison of simulations with cryo-EM data and with equivalent segments in other species.
[Strukturní dynamika ohnutého segmentu v ribosomálním A-site fingeru E. coli. Srovnání simulací s kryo-EM daty a s ekvivalentními segmenty z ostatních organismů.]
Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. Taylor & Francis. Roč. 26, č. 6 (2009), s. 793. ISSN 0739-1102.
[The 17th Conversation. 16.06.2009-20.06.2009, Albany]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: E. coli * A-site finger
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0173975 - 5.0327055 - BFÚ 2010 US eng A - Abstrakt
Beššeová, Ivana - Réblová, Kamila - Leontis, N.B. - Šponer, Jiří
RNA three-way junctions can act as flexible RNA structural elements in large RNA molecules: a molecular simulation analysis.
Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. Taylor & Francis. Roč. 26, č. 6 (2009), s. 830-831. ISSN 0739-1102.
[The 17th Conversation. 16.06.2009-20.06.2009, Albany]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: RNA three-way junctions * RNA
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0173959 - 6.0311842 - BFÚ 2009 PL eng A - Abstrakt
Šponer, Judit E. - Mládek, Arnošt - Réblová, Kamila - Mokdad, A. - Leszczynski, J. - Šponer, Jiří
Principles of RNA base pairing. Structures and energies of the most frequent interaction patterns from quantum chemical calculations.
[Principy RNA párování. Struktura a energetika nejčastějších interakčních vzorů z kvantově chemických výpočtů.]
Book of Abstracts. Kraków, 2008 - (Eilmes, A.; Korchowiec, J.). P17. ISBN 978-83-921060-5-0.
[Current Trends in Theoretical Chemistry V. 06.07.2008-10.07.2008, Kraków]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: RNA base pairing * structures of interactions patterns
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0163074 - 7.0097034 - BFÚ 2008 UA eng A - Abstrakt
Krasovská, Maryna V. - Šefčíková, J. - Rhodes, M.M. - Špačková, Naďa - Réblová, Kamila - Walter, N.G. - Šponer, Jiří
Structural dynamics of ribozymes studied by MD simulations.
[Strukturní dynamika ribozymů studovaných MD simulacemi.]
Book of Abstracts. Kyiv, 2007. s. 67.
[2nd International Symposium. 02.07.2007-04.07.2007, Kyiv]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA203/05/0388; GA ČR(CZ) GA203/05/0009; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: molecular dynamics * RNA * ribosome
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0156268 - 8.0097015 - BFÚ 2008 UA eng A - Abstrakt
Šponer, Judit E. - Réblová, Kamila - Mokdad, A. - Sychrovský, Vladimír - Leszczynski, J. - Šponer, Jiří
The leading RNA tertiary interactions: Structures, energies and water insertion of A-minor and P-interactions. A quantum chemical view.
[Hlavní RNA terciární interakce: Struktura, energie a inzerce vod v A-minor a P-interakcích. Kvantově chemický pohled.]
Book of Abstracts. Kyiv, 2007. s. 60.
[2nd International Symposium. 02.07.2007-04.07.2007, Kyiv]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA203/05/0009; GA ČR(CZ) GA203/05/0388; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: quantum chemistry * RNa interaction
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0156253 - 9.0086303 - BFÚ 2008 CZ eng A - Abstrakt
Réblová, Kamila
Study of unusual RNA structures using molecular dynamics methods.
[Studium neobvyklých struktur RNA pomocí molekulově dynamických metod.]
List of Abstracts. Prague, 2007. s. 45.
[Conference on Modeling Interactions in Biomolecules III. 08.09.2007-13.09.2007, Prague]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA203/05/0009; GA ČR(CZ) GA203/05/0388; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: molecular dynamics * RNA building blocks * ribosome
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0148604 - 10.0084180 - BFÚ 2008 US eng A - Abstrakt
Réblová, Kamila - Lankaš, F. - Šponer, Jiří
Study of structure, dynamics and local elasticity of 16S rRNA Helix 44 using molecular dynamics methods.
[Studium struktury, dynamiky a lokální elasticity 16S rRNA Helixu 44 užitím molekulově dynamických metod.]
Abstract. Albany, 2007. s. 635-636. ISSN 0739-1102.
[The 15th Conversation. 19.06.2007-23.06.2007, Albany]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: 16S rRNA Helix 44 * molecular dynamics
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0147164