Výsledky vyhledávání
- 1.0452900 - ÚVGZ 2016 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Lišková, V. - Bednář, D. - Prudnikova, Tatyana - Řezáčová, P. - Koudeláková, T. - Šebestová, E. - Kutá-Smatanová, Ivana - Březovský, J. - Chaloupková, R. - Damborský, J.
Balancing the Stability–Activity Trade-Off by Fine-Tuning Dehalogenase Access Tunnels.
ChemCatChem. Roč. 7, č. 4 (2015), s. 648-659. ISSN 1867-3880. E-ISSN 1867-3899
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: alkanes * enzymes * catalysis * halogenation * molecular dynamics * protein engineering
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 4.724, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0253863 - 2.0452881 - ÚVGZ 2016 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lermark, L. - Degtjarik, Oksana - Steffler, F. - Sieber, V. - Kutá-Smatanová, Ivana
Crystallization behaviour of glyceraldehyde dehydrogenase from Thermoplasma acidophilum.
Acta Crystallographica Section F-Structural Biology Communications. Roč. 71, č. 12 (2015), s. 1475-1480. E-ISSN 2053-230X
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: TaAlDH * Thermoplasma acidophilum * bioproduction * cell-free enzyme cascade * glyceraldehyde dehydrogenase
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 0.647, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0253862 - 3.0452784 - ÚVGZ 2016 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Cséfalvay, Eva - Lapkouski, Mikalai - Guzanová, Alena - Cséfalvay, Ladislav - Baikova, T. - Shevelev, Igor - Bialevich, V. - Shamayeva, Katerina - Janščák, Pavel - Kutá-Smatanová, Ivana - Panjikar, S. - Carey, J. - Weiserová, Marie - Ettrich, Rüdiger
Functional Coupling of Duplex Translocation to DNA Cleavage in a Type I Restriction Enzyme.
PLoS ONE. Roč. 10, č. 6 (2015), e0128700. ISSN 1932-6203. E-ISSN 1932-6203
Grant CEP: GA ČR GAP207/12/2323; GA ČR GAP305/10/0281
Institucionální podpora: RVO:67179843 ; RVO:61388971 ; RVO:68378050
Klíčová slova: Escherichia-Coli * Endonuclease ecor1241 * HSDR subunit * RECBCD enzyme * proteins * genes * helicase * sequence * family * domain
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.057, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0253781 - 4.0435351 - ÚOCHB 2015 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Bumba, Ladislav - Sviridova, E. - Kutá-Smatanová, Ivana - Řezáčová, Pavlína - Veverka, Václav
Backbone resonance assignments of the outer membrane lipoprotein FrpD from Neisseria meningitidis.
Biomolecular NMR Assignments. Roč. 8, č. 1 (2014), s. 53-55. ISSN 1874-2718. E-ISSN 1874-270X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GAP207/11/0717; GA MŠMT(CZ) LK11205
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971 ; RVO:67179843
Klíčová slova: Neisseria meningitidis * FrpC * FrpD * backbone assignments * NMR * iron-regulated protein
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 0.760, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0239252 - 5.0435285 - ÚVGZ 2015 RIV DK eng J - Článek v odborném periodiku
Lahoda, M. - Mesters, J. R. - Stsiapanava, A. - Chaloupková, R. - Kutý, Michal - Damborský, J. - Kutá-Smatanová, Ivana
Crystallographic analysis of 1,2,3-trichloropropane biodegradation by the haloalkane dehalogenase DhaA31.
Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography. Roč. 70, FEB 2014 (2014), s. 209-217. ISSN 0907-4449
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: DhaA31 * substrate-free * 3rk4 * complex with TCP * 4fwb * wild-type DhaA * 4hzg
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 7.232, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0239193 - 6.0430522 - ÚOCHB 2015 RIV DK eng J - Článek v odborném periodiku
Chaloupková, R. - Prudnikova, T. - Řezáčová, Pavlína - Prokop, Z. - Koudeláková, T. - Daniel, L. - Březovský, J. - Ikeda-Ohtsubo, W. - Sato, Y. - Kutý, Michal - Nagata, Y. - Kutá-Smatanová, Ivana - Damborský, J.
Structural and functional analysis of a novel haloalkane dehalogenase with two halide-binding sites.
Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography. Roč. 70, July (2014), s. 1884-1897. ISSN 0907-4449
Grant ostatní: GA ČR(CZ) GAP207/12/0775; GA MŠk(CZ) LO1214; GA MŠk(CZ) LM2010005
Program: GA
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:67179843
Klíčová slova: haloalkane dehalogenase * halide-binding site * catalytic activity * substrate specificity * enzyme stability
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 7.232, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0235571 - 7.0427169 - ÚFCH JH 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sýkora, Jan - Brezovský, J. - Koudeláková, T. - Lahoda, M. - Fořtová, A. - Chernovets, Tatsiana - Chaloupková, R. - Štěpánková, V. - Prokop, Z. - Kutá-Smatanová, Ivana - Hof, Martin - Damborský, J.
Dynamics and hydration explain failed functional transformation in dehalogenase design.
Nature Chemical Biology. Roč. 10, č. 6 (2014), s. 428-430. ISSN 1552-4450. E-ISSN 1552-4469
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:67179843
Klíčová slova: fluorescence * dynamics * hydration
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie; CE - Biochemie (UEK-B)
Impakt faktor: 12.996, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0232868 - 8.0425304 - ÚVGZ 2014 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Koudeláková, T. - Chaloupková, R. - Březovský, J. - Prokop, Z. - Šebestová, E. - Hesseler, M. - Khabiri, Morteza - Plevaka, M. - Kulik, D. - Kutá-Smatanová, Ivana - Řezáčová, Pavlína - Ettrich, Rüdiger - Bornscheuer, U.T. - Damborský, J.
Engineering Enzyme Stability and Resistance to an Organic Cosolvent by Modification of Residues in the Access Tunnel.
Angewandte Chemie - International Edition. Roč. 52, č. 7 (2013), s. 1959-1963. ISSN 1433-7851. E-ISSN 1521-3773
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06010
Institucionální podpora: RVO:67179843 ; RVO:68378050
Klíčová slova: directed evolution * enzyme catalysis * enzymes * protein engineering * protein stability
Kód oboru RIV: CE - Biochemie; EB - Genetika a molekulární biologie (UMG-J)
Impakt faktor: 11.336, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0231180Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0425304.pdf 3 1.3 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 9.0424557 - ÚVGZ 2014 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lapkouski, Mikalai - Panjikar, S. - Janscak, P. - Kutá-Smatanová, Ivana - Carrey, J. - Ettrich, Rüdiger - Cséfalvay, Eva
Structure of the motor subunit of type I restriction-modification complex EcoR124I.
Nature Structural & Molecular Biology. Roč. 16, č. 1 (2009), s. 94-95. ISSN 1545-9993. E-ISSN 1545-9985
Grant CEP: GA MŠMT LC06073
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z60870520
Klíčová slova: SWI2/SNF2 ATPASE * DNA * endonuclease * protein * translocation * helicase * treckings * enzymes * core * time
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 12.273, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0230617 - 10.0399279 - ÚVGZ 2014 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tratsiak, K. - Degtjarik, Oksana - Drienovská, I. - Chrást, L. - Řezáčová, Pavlína - Kutý, Michal - Chaloupková, R. - Damborský, J. - Kutá-Smatanová, Ivana
Crystallographic analysis of new psychrophilic haloalkane dehalogenases: DpcA from Psychrobacter cryohalolentis K5 and DmxA from Marinobacter sp. ELB17.
Acta Crystallographica Section F-Structural Biology and Crystallization Communications. Roč. 69, č. 6 (2013), s. 683-688. ISSN 1744-3091. E-ISSN 2053-230X
Institucionální podpora: RVO:67179843 ; RVO:61388963
Klíčová slova: haloalkane dehalogenases * DpcA * Psychrobacter cryohalolentis K5 * DmxA * Marinobacter sp. ELB17
Kód oboru RIV: CE - Biochemie; CE - Biochemie (UOCHB-X)
Impakt faktor: 0.568, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0226641