0503200 - ÚMG 2019 RIV CZ cze L4 - Software
Ehler, Edvard - Pačes, JanEXPheatmap softwarový nástroj.
[Extended Cross-Population heatmap EXPheatmap.]
Interní kód: 2019EXP ; 2019
Technické parametry: EXPheatmap je kombinace nových algoritmů a připravených postupů, která je vytvořena za účelem zpracování sekvenačních dat prostřednictvím analytické platformy. Je připraven jako knihovna v jazyce Python (v. 3.6). S použitím této knihovny je možné zpracovávat data poskytnutá ve standardní formě tak, aby došlo k vizualizaci výsledků komplexních sekvenačních procesů, které z dat ve standardní formě dosud vizualizovatelné nejsou. Tyto funkcionality výrazně zjednodušší uživatelům analýzu sekvenačních dat. Licence bude poskytována formou GNU General Public License. kontakt: edvard.ehler@img.cas.cz.
Ekonomické parametry: Použitím těchto nástrojů je možné zpracovávat data poskytnutá ve standardní formě tak, aby došlo k vizualizaci výsledků komplexních mezipopulačních charakteristik, které z dat ve standardní formě dosud vizualizovatelné nejsou. Tyto funkcionality výrazně zjednodušší uživatelům analýzu sekvenačních dat, populačních genetických dat, a jakýchkoliv dalších souborů vzorků, které obsahují definované podskupiny a vztahy mezi těmito podskupinami (např. vzdálenosti).
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TG01010066
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: visualization * cross-population parameters * heatmap * genomics
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
http://genomat.img.cas.cz/
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0295024
