Výsledky vyhledávání
- 1.0576660 - ÚMG 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Miklík, Dalibor - Grim, Jiří - Elleder, Daniel - Hejnar, Jiří
Unraveling the palindromic and nonpalindromic motifs of retroviral integration site sequences by statistical mixture models.
Genome Research. Roč. 33, č. 8 (2023), s. 1395-1408. ISSN 1088-9051. E-ISSN 1549-5469
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA ČR(CZ) GA19-23407S
Institucionální podpora: RVO:67985556 ; RVO:68378050
Klíčová slova: IMMUNODEFICIENCY-VIRUS TYPE-1 * HIV-1 INTEGRATION * HUMAN GENOME
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8) (UTIA-B)
Impakt faktor: 7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://genome.cshlp.org/content/33/8/1395
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346204Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup genome-miklík-23.pdf 0 7.2 MB Vydavatelský postprint povolen - 2.0576431 - ÚMG 2024 US eng J - Článek v odborném periodiku
Krchlíková, Veronika - Lotke, R. - Haussmann, I. - Reinišová, Markéta - Kučerová, Dana - Pecnová, Lubomíra - Ungrová, Lenka - Hejnar, Jiří - Sauter, D. - Elleder, Daniel
Independent loss events of a functional tetherin gene in galliform birds.
Journal of Virology. Roč. 97, č. 10 (2023), č. článku e0080323. ISSN 0022-538X. E-ISSN 1098-5514
Grant CEP: GA ČR GA20-22063S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: retroviruses * restriction factors * gene loss * turkey * tetherin
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/jvi.00803-23
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0348338Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup JofVirology -krchlíková-et-al-2023.pdf 0 1 MB Vydavatelský postprint povolen - 3.0572429 - ÚMG 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Janušová, Šárka - Krchlíková, Veronika - Hron, Tomáš - Elleder, Daniel - Štěpánek, Ondřej
Identification of GC-rich LAT genes in birds.
PLoS ONE. Roč. 18, č. 4 (2023), č. článku e0283431. ISSN 1932-6203. E-ISSN 1932-6203
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: T-CELL-RECEPTOR * ACTIVATION * LINKER * PHOSPHORYLATION * MUTATION * PROTEINS
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0283431
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0343162Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup plosone_Janusova_23.pdf 1 1.3 MB Vydavatelský postprint povolen - 4.0567288 - ÚMG 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Krchlíková, Veronika - Hron, Tomáš - Těšický, M. - Li, T. - Ungrová, Lenka - Hejnar, Jiří - Vinkler, M. - Elleder, Daniel
Dynamic Evolution of Avian RNA Virus Sensors: Repeated Loss of RIG-I and RIPLET.
Viruses. Roč. 15, č. 1 (2023), č. článku 3. E-ISSN 1999-4915
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA ČR GA20-22063S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: avian genome * viral sensors * innate immunity * gene loss
Obor OECD: Immunology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1999-4915/15/1/3
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0338555Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0567288.pdf 4 3.1 MB Vydavatelský postprint povolen - 5.0556077 - ÚMG 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Yang, L. - Malhotra, R. - Chikhi, R. - Elleder, Daniel - Kaiser, T. - Rong, J. - Medvedev, P. - Poss, M.
Recombination Marks the Evolutionary Dynamics of a Recently Endogenized Retrovirus.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 38, č. 12 (2021), s. 5423-5436. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: endogenous retrovirus * CrERV * recombination * genome diversity * mule deer * insertional polymorphism
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 8.800, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/mbe/article/38/12/5423/6364191?login=false
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0330452 - 6.0555980 - ÚMG 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Burkhardt, N. B. - Elleder, Daniel - Schusser, B. - Krchlíková, Veronika - Goebel, T. - Haertle, S. - Kaspers, B.
The Discovery of Chicken Foxp3 Demands Redefinition of Avian Regulatory T Cells.
Journal of Immunology. Roč. 208, č. 5 (2022), s. 1128-1138. ISSN 0022-1767. E-ISSN 1550-6606
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: spleen-cells * antibody * genes * interleukin-2 * maintenance * infection * responses * complex * model * cd25
Obor OECD: Immunology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://journals.aai.org/jimmunol/article/208/5/1128/234858/The-Discovery-of-Chicken-Foxp3-Demands
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0331785 - 7.0554930 - ÚMG 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Krchlíková, Veronika - Hron, Tomáš - Těšický, M. - Li, T. - Hejnar, Jiří - Vinkler, M. - Elleder, Daniel
Repeated MDA5 Gene Loss in Birds: An Evolutionary Perspective.
Viruses. Roč. 13, č. 11 (2021), č. článku 2131. E-ISSN 1999-4915
Grant CEP: GA ČR GA20-22063S
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: avian genome * viral sensors * innate immunity * gene loss
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 5.818, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1999-4915/13/11/2131
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329549 - 8.0554917 - ÚMG 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Koslová, Anna - Trefil, P. - Mucksová, J. - Krchlíková, Veronika - Plachý, Jiří - Krijt, J. - Reinišová, Markéta - Kučerová, Dana - Geryk, Josef - Kalina, J. - Šenigl, Filip - Elleder, Daniel - Kožich, V. - Hejnar, Jiří
Knock-Out of Retrovirus Receptor Gene Tva in the Chicken Confers Resistance to Avian Leukosis Virus Subgroups A and K and Affects Cobalamin (Vitamin B-12)-Dependent Level of Methylmalonic Acid.
Viruses. Roč. 13, č. 12 (2021), č. článku 2504. E-ISSN 1999-4915
Grant CEP: GA MZe(CZ) QK1810344
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: avian leukosis virus subgroups A * k * tva * gene editing in chicken * vitamin B-12 * cobalamin
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 5.818, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1999-4915/13/12/2504
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329536 - 9.0543825 - ÚMG 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Krchlíková, Veronika - Mikešová, J. - Geryk, Josef - Bařinka, Cyril - Nexo, E. - Fedosov, S.N. - Kosla, Jan - Kučerová, Dana - Reinišová, Markéta - Hejnar, Jiří - Elleder, Daniel
The Avian Retroviral Receptor Tva Mediates the Uptake of Transcobalamin Bound Vitamin B-12 (Cobalamin).
Journal of Virology. Roč. 95, č. 8 (2021), č. článku e02136-20. ISSN 0022-538X. E-ISSN 1098-5514
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA ČR(CZ) GA17-23675S; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:86652036 ; RVO:68378050
Klíčová slova: avian leukosis virus * cobalamin * receptor * retrovirus
Obor OECD: Virology; Virology (BTO-N)
Impakt faktor: 6.549, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://journals-asm-org.d360prx.biomed.cas.cz/doi/epub/10.1128/JVI.02136-20
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320943 - 10.0525557 - ÚMG 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Krchlíková, Veronika - Fabryova, H. - Hron, Tomáš - Young, J.M. - Koslová, Anna - Hejnar, Jiří - Strebel, K. - Elleder, Daniel
Antiviral Activity and Adaptive Evolution of Avian Tetherins.
Journal of Virology. Roč. 94, č. 12 (2020), č. článku e00416-20. ISSN 0022-538X. E-ISSN 1098-5514
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-23675S; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: avian retrovirus * chicken * restriction factor * tetherin
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 5.103, rok: 2020
Způsob publikování: Omezený přístup
https://jvi.asm.org/content/94/12/e00416-20
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0309688