Výsledky vyhledávání
- 1.0577299 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šponer, Judit E. - Kloužek, Jaroslav - Výravský, J. - Wunnava, S. - Scheu, B. - Braun, N. - Mojzsis, Stephen J. - Palacký, Jan - Vorlíčková, Michaela - Šponer, Jiří - Matyášek, Roman - Kovařík, Aleš
Influence of Silicate Rock Glass Compositions on the Efficacy of Prebiotic RNA Polymerization Reactions: The Case of 3',5' Cyclic Guanosine Monophosphate.
CHEMSYSTEMSCHEM. Roč. 5, č. 5 (2023). E-ISSN 2570-4206
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-25057S
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:67985891
Klíčová slova: oligomerization * prebiotic chemistry * oligonucleotides * rock glasses * basicity
Obor OECD: Analytical chemistry; Analytical chemistry (USMH-B)
Impakt faktor: 3.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/syst.202300016
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346507 - 2.0571533 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Školáková, Petra - Gajarský, M. - Palacký, Jan - Šubert, Denis - Renčiuk, Daniel - Trantírek, L. - Mergny, Jean-Louis - Vorlíčková, Michaela
DNA i-motif formation at neutral pH is driven by kinetic partitioning.
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 6 (2023), s. 2950-2962. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-17063S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G-QUADRUPLEX * THERMODYNAMICS * STABILITY * PROMOTER
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/51/6/2950/7076469?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349778 - 3.0557410 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Holoubek, Jiří - Bednářová, Klára - Haviernik, Jan - Huvarová, I. - Dvořáková, Zuzana - Černý, J. - Outlá, Martina - Salát, Jiří - Konkoľová, Eva - Bouřa, Evžen - Růžek, Daniel - Vorlíčková, Michaela - Eyer, Luděk - Renčiuk, Daniel
Guanine quadruplexes in the RNA genome of the tick-borne encephalitis virus: their role as a new antiviral target and in virus biology.
Nucleic Acids Research. Roč. 50, č. 8 (2022), s. 4574-4600. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-20229S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68081707 ; RVO:61388963
Klíčová slova: intercalator displacement assay * forming sequences * small-molecule * binding * dna * fluorescence * zika * identification * pyridostatin * inactivation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (BFU-R); Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/50/8/4574/6568495?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0339132 - 4.0555432 - BFÚ 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Novotný, A. - Novotný, J. - Kejnovská, Iva - Vorlíčková, Michaela - Fiala, R. - Marek, R.
Revealing structural peculiarities of homopurine GA repetition stuck by i-motif clip.
Nucleic Acids Research. Roč. 49, č. 20 (2021), s. 11425-11437. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA19-17063S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: parallel-stranded dna * molecular-dynamics * circular-dichroism * rna duplexes
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 19.160, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/49/20/11425/6413599
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329949 - 5.0554847 - BFÚ 2022 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Kejnovská, Iva - Stadlbauer, Petr - Trantírek, L. - Renčiuk, Daniel - Gajarský, M. - Krafčík, D. - Palacký, Jan - Bednářová, Klára - Šponer, Jiří - Mergny, Jean-Louis - Vorlíčková, Michaela
G-Quadruplex Formation by DNA Sequences Deficient in Guanines: Two Tetrad Parallel Quadruplexes Do Not Fold Intramolecularly.
Chemistry - A European Journal. Roč. 27, č. 47 (2021), s. 12115-12125. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-17063S; GA ČR(CZ) GA20-20229S; GA ČR(CZ) GA21-23718S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: amber force-field * human telomere * molecular-dynamics * nucleic-acids * k+ solution * crystal-structure
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.020, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/chem.202100895
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329475 - 6.0537735 - BFÚ 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Bednářová, Klára - Vorlíčková, Michaela - Renčiuk, Daniel
Diversity of Parallel Guanine Quadruplexes Induced by Guanine Substitutions.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 21, č. 17 (2020), č. článku 6123. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ17-19170Y; GA ČR(CZ) GA20-20229S; GA ČR(CZ) GA19-17063S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: anti-hiv * stability * stacking * lesions * dimer * parallel guanine quadruplex * circular dichroism
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.924, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
http://apps.webofknowledge.com/InboundService.do?customersID=Alerting&mode=FullRecord&IsProductCode=Yes&product=WOS&Init=Yes&Func=Frame&DestFail=http%3A%2F%2Fwww.webofknowledge.com&action=retrieve&SrcApp=Alerting&SrcAuth=Alerting&SID=E4SFQpVfVUW1Pa8UB8d&UT=WOS%3A000571160100001
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0315587 - 7.0536138 - BFÚ 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Islam, Barira - Stadlbauer, Petr - Vorlíčková, Michaela - Mergny, Jean-Louis - Otyepka, Michal - Šponer, Jiří
Stability of Two-Quartet G-Quadruplexes and Their Dimers in Atomistic Simulations.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 16, č. 6 (2020), s. 3447-3463. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA19-17063S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: molecular-dynamics simulations * human telomeric rna * resolution crystal-structure * monovalent ion parameters * force-field * k+ solution
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 6.006, rok: 2020
Způsob publikování: Omezený přístup
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.9b01068
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0313961 - 8.0536135 - BFÚ 2021 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Školáková, Petra - Badri, Z. - Foldynová-Trantírková, Silvie - Ryneš, J. - Šponer, Jiří - Fojtová, Miloslava - Fajkus, Jiří - Marek, R. - Vorlíčková, Michaela - Mergny, Jean-Louis - Trantírek, L.
Composite 5-methylations of cytosines modulate i-motif stability in a sequence-specific manner: Implications for DNA nanotechnology and epigenetic regulation of plant telomeric DNA.
Biochimica et Biophysica Acta-General Subjects. Roč. 1864, č. 9 (2020), č. článku 129651. ISSN 0304-4165. E-ISSN 1872-8006
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA19-17063S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: base-pairing energies * promoter region * g-quadruplex * noncovalent interactions * thermal-stability * molecular switch * rational design
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.770, rok: 2020
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S030441652030163X?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0313957 - 9.0520332 - BFÚ 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Palacký, Jan - Mojzes, P. - Kejnovská, Iva - Vorlíčková, Michaela
Does Raman spectroscopy recognize different G-quadruplex arrangements?
Journal of Raman Spectroscopy. -, NOV 2019 (2019). ISSN 0377-0486. E-ISSN 1097-4555
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR GA17-12075S; GA ČR(CZ) GA19-17063S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * k+ solution * dna quadruplex * structure polymorphism * circular-dichroism
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.000, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/jrs.5772
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0305019 - 10.0511784 - BFÚ 2020 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Bednářová, Klára - Kejnovská, Iva - Vorlíčková, Michaela - Renčiuk, Daniel
Guanine Substitutions Prevent Conformational Switch from Antiparallel to Parallel G-Quadruplex.
Chemistry - A European Journal. Roč. 25, č. 58 (2019), s. 13422-13428. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ17-19170Y; GA ČR(CZ) GA19-17063S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: human telomeric dna * k+ solution * cd spectra * stability * sequence
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 4.857, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/chem.201903015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0302031