Výsledky vyhledávání
- 1.0571529 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Jedlička, Pavel - Tokan, Viktor - Kejnovská, Iva - Hobza, Roman - Kejnovský, Eduard
Telomeric retrotransposons show propensity to form G-quadruplexes in various eukaryotic species.
Mobile DNA. Roč. 14, č. 1 (2023), č. článku 3. ISSN 1759-8753. E-ISSN 1759-8753
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-00580S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Telomere * G-quadruplex * Retrotransposon * Drosophila * Het-A * tart * tahre
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 4.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://mobilednajournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13100-023-00291-9
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345689 - 2.0569371 - BFÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kejnovský, Eduard - Jedlička, Pavel
Nucleic acids movement and its relation to genome dynamics of repetitive DNA Is cellular and intercellular movement of DNA and RNA molecules related to the evolutionary dynamic genome components?
BioEssays. Roč. 44, č. 4 (2022), č. článku e2100242. ISSN 0265-9247. E-ISSN 1521-1878
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-00258S; GA ČR(CZ) GA21-00580S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna * genome dynamics * horizontal gene transfer * migration * movement * small RNA * transposable elements
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/bies.202100242
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340689 - 3.0564038 - BFÚ 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Stein, M. - Hile, S. E. - Weissensteiner, M. H. - Lee, M. - Zhang, S. - Kejnovský, Eduard - Kejnovská, Iva - Makova, K.D. - Eckert, K.
Variation in G-quadruplex sequence and topology differentially impacts human DNA polymerase fidelity.
Dna Repair. Roč. 119, NOV 2022 (2022), č. článku 103402. ISSN 1568-7864. E-ISSN 1568-7856
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Non-B DNA * Error signature * DNA replication * DNA polymerase ?
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1568786422001355?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340580 - 4.0560041 - BFÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lexa, Matej - Čechová, M. - Nguyen, S. H. - Jedlička, Pavel - Tokan, Viktor - Kubát, Zdeněk - Hobza, Roman - Kejnovský, Eduard
HiC-TE: a computational pipeline for Hi-C data analysis to study the role of repeat family interactions in the genome 3D organization.
Bioinformatics. Roč. 38, č. 16 (2022), s. 4030-4032. ISSN 1367-4803. E-ISSN 1460-2059
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-00580S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: TRANSPOSABLE ELEMENTS * SEQUENCE
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/38/16/4030/6628581?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340534 - 5.0542265 - BFÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Tokan, Viktor - Lorenzo, Jose Luis Rodriguez - Jedlička, Pavel - Kejnovská, Iva - Hobza, Roman - Kejnovský, Eduard
Quadruplex-Forming Motif Inserted into 3 ' UTR of Ty1his3-AI Retrotransposon Inhibits Retrotransposition in Yeast.
Biology. Roč. 10, č. 4 (2021), č. článku 347. E-ISSN 2079-7737
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-00258S; GA ČR(CZ) GA21-00580S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Ty1 LTR retrotransposon * G-quadruplex * retrotransposition * N-methyl mesoporphyrin (NMM) * Pif1 helicase * yeast
Obor OECD: Other biological topics
Impakt faktor: 5.168, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2079-7737/10/4/347
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319724 - 6.0539921 - BFÚ 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lexa, Matej - Jedlička, Pavel - Vanat, I. - Červeňanský, Michal - Kejnovský, Eduard
TE-greedy-nester: structure-based detection of LTR retrotransposons and their nesting.
Bioinformatics. Roč. 36, č. 20 (2020), s. 4991-4999. ISSN 1367-4803. E-ISSN 1460-2059
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-00258S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: transposable elements * visualization * annotation * identification * paleontology
Obor OECD: Biochemical research methods
Impakt faktor: 6.937, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/36/20/4991/5871348
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0317612 - 7.0539877 - BFÚ 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Jedlička, Pavel - Lexa, M. - Kejnovský, Eduard
What Can Long Terminal Repeats Tell Us About the Age of LTR Retrotransposons, Gene Conversion and Ectopic Recombination?
Frontiers in Plant Science. Roč. 11, MAY 20 2020 (2020), č. článku 644. ISSN 1664-462X. E-ISSN 1664-462X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-00258S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: rna-mediated recombination * transposable elements * genome size * evolution * rice * plants
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 5.754, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2020.00644/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0317575 - 8.0520376 - BFÚ 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Jedlička, Pavel - Lexa, M. - Vanat, I. - Hobza, Roman - Kejnovský, Eduard
Nested plant LTR retrotransposons target specific regions of other elements, while all LTR retrotransposons often target palindromes and nucleosome-occupied regions: in silico study.
Mobile DNA. Roč. 10, č. 1 (2019), č. článku 50. ISSN 1759-8753. E-ISSN 1759-8753
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-00258S; GA ČR GA16-08698S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: insertion site preferences * transposable elements * molecular-biology * genome structure * dna segments
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.161, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://mobilednajournal.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s13100-019-0186-z
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0305055 - 9.0506513 - BFÚ 2020 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Hobza, Roman - Kubát, Zdeněk - Čegan, Radim - Jesionek, Wojciech - Vyskot, Boris - Kejnovský, Eduard
Impact of repetitive DNA on sex chromosome evolution in plants.
Chromosome Research. Roč. 23, č. 3 (2015), s. 561-570. ISSN 0967-3849. E-ISSN 1573-6849
Grant CEP: GA ČR GBP501/12/G090; GA ČR GAP501/12/2220; GA ČR GJ15-21523Y; GA ČR GA15-02891S
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:61389030
Klíčová slova: primitive y-chromosome * transposable elements * dioecious plant * silene-latifolia * retrotransposon
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (UEB-Q)
Impakt faktor: 2.590, rok: 2015
Způsob publikování: Omezený přístup
https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10577-015-9496-2
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0297745 - 10.0503226 - BFÚ 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lexa, M. - Lapar, R. - Jedlička, Pavel - Vanat, I. - Červeňanský, Michal - Kejnovský, Eduard
TE-nester: a recursive software tool for structure-based discovery of nested transposable elements.
IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine-BIBM. Proceedings 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedecine (BIBM). - (Zheng, H.; Callejas, Z.; Griol, D.; Wang, H.; Hu, X.; Schmidt, H.; Baumbach, J.; Dickerson, J.; Zhang, L.). Roč. 2018, č. 2018 (2018), s. 2776-2778. ISBN 978-1-5386-5488-0. ISSN 2156-1125
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: annotation * efficient * visualization * finder
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Způsob publikování: Omezený přístup
https://ieeexplore.ieee.org/document/8621071
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0295050