Výsledky vyhledávání
- 1.0583620 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Porubiakova, Otilia - Havlík, J. - Indu, Indu - Sedy, M. - Přepechalová, Veronika - Bartas, M. - Bidula, S. - Šťastný, J. - Fojta, Miroslav - Brázda, Václav
Variability of Inverted Repeats in All Available Genomes of Bacteria.
Microbiology Spectrum. Roč. 11, č. 4 (2023). ISSN 2165-0497. E-ISSN 2165-0497
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna-structure * sticky dna * sp-nov. * evolution * stability * binding * server * gene * rnas
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/epub/10.1128/spectrum.01648-23
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351624 - 2.0583599 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Mergny, Jean-Louis
Quadruplexes and aging: G4-binding proteins regulate the presence of miRNA in small extracellular vesicles (sEVs).
Biochimie. Roč. 214, NOV 2023 (2023), s. 69-72. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: small-molecule * translation * mechanism * insights * biology * binding * dna * RNA-Binding protein * Exosome
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908423000147?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351605 - 3.0583206 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kratochvilová, Libuše - Vojsovič, Matůš - Valková, Natalia - Šislerová, Lucie - El Rashed, Z. - Inga, A. - Monti, P. - Brázda, Václav
The presence of a G-quadruplex prone sequence upstream of a minimal promoter increases transcriptional activity in the yeasti Saccharomyces/i cerevisiae.
Bioscience Reports. Roč. 43, č. 12 (2023), č. článku BSR20231348. ISSN 0144-8463. E-ISSN 1573-4935
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: small-molecule * thioflavin t * dna * p53 * transactivation * visualization * specificities * evolution * region
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://portlandpress.com/bioscirep/article/43/12/BSR20231348/233764/The-presence-of-a-G-quadruplex-prone-sequence
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351205 - 4.0582377 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Valková, Natalia - Dobrovolná, Michaela - Mergny, Jean-Louis
Abundance of G-Quadruplex Forming Sequences in the Hepatitis Delta Virus Genomes.
ACS Omega. Roč. 9, č. 3 (2024), s. 4096-4101. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: rna g-quadruplex * dna
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.3c09288
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352960 - 5.0574524 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Valková, Natalia - Kratochvilova, L. - Martinková, L. - Brázda, Václav
Dual mode of IFI16 binding to supercoiled and linear DNA: A closer insight.
Biochemical and Biophysical Research Communications. Roč. 667, JUL 30 2023 (2023), s. 89-94. ISSN 0006-291X. E-ISSN 1090-2104
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: ifi16 * Superhelicity * dna * afm * G-quadruplex * Inverted repeat
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.1, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006291X23006125?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349252 - 6.0574518 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Ferret, L. - Alvarez-Valadez, K. - Riviere, J. - Muller, A. - Bohalova, Natalia - Yu, L. - Guittat, L. - Brázda, Václav - Kroemer, G. - Mergny, Jean-Louis - Djavaheri-Mergny, M.
G-quadruplex ligands as potent regulators of lysosomes.
Autophagy. Roč. 19, č. 7 (2023), s. 1901-1915. ISSN 1554-8627. E-ISSN 1554-8635
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Autophagy * guanine-quadruplex * lysosome membrane permeabilization * tfeb * transcriptional regulation
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 13.3, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/15548627.2023.2170071
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350465 - 7.0574515 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Dobrovolná, Michaela - Bohalova, Natalia - Mergny, Jean-Louis
G-quadruplexes in the evolution of hepatitis B virus.
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 14 (2023), s. 7198-7204. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: FORMING SEQUENCES * GENOME * TRANSCRIPTION
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/51/14/7198/7217046?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350075 - 8.0574514 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Goswami, Pratik - Šislerová, Lucie - Dobrovolná, Michaela - Havlík, J. - Šťastný, J. - Brázda, Václav
Interaction of C-terminal p53 isoforms depends strongly upon DNA sequence and topology.
Biochimie. Roč. 208, MAY 2023 (2023), s. 93-99. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: p53 isoforms * G-quadruplex * Atomic force microscopy * p53-DNA binding * Supercoiled DNA
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908422003352?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350064 - 9.0571535 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Havlík, J. - Brázda, Václav - Stanek, K. - Ježek, M. - Šťastný, J.
Feature-overlapper: The tool for DNA analysis overlap.
SOFTWARE IMPACTS. Roč. 16, MAY 2023 (2023), č. článku 100498. ISSN 2665-9638
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna * R-loop * G-quadruplex * Annotation
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 2.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2665963823000350?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349900 - 10.0569719 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Legartová, Soňa - Fagherazzi, Paolo - Goswami, Pratik - Brázda, Václav - Lochmanová, G. - Koutná, I. - Bártová, Eva
Irradiation potentiates p53 phosphorylation and p53 binding to the promoter and coding region of the TP53 gene.
Biochimie. Roč. 204, č. 2023 (2023), s. 154-168. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant ostatní: AV ČR(CZ) StrategieAV21/7
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: p53 * 53bp1 * DNA damage * Epigenetics * Mass spectrometry * flim-fret * afm
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0300908422002498?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344343