Výsledky vyhledávání
- 1.0583349 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Dhillon, Arun - Persson, B. D. - Volkov, A. N. - Sülzen, Hagen - Kádek, Alan - Pompach, Petr - Kereiche, Sami - Lepšík, Martin - Danskog, K. - Uetrecht, C. - Arnberg, N. - Zoll, Sebastian
Structural insights into the interaction between adenovirus C5 hexon and human lactoferrin.
Journal of Virology. Roč. 98, č. 3 (2024), č. článku e01576-23. ISSN 0022-538X. E-ISSN 1098-5514
Grant CEP: GA MŠMT LM2023042; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0015974
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971 ; RVO:86652036
Klíčová slova: adenovirus * lactoferrin * cryo-EM * immune evasion * viral entry
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1128/jvi.01576-23
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351321
Vědecká data: ZENODO - 2.0582928 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pecina, Adam - Fanfrlík, Jindřich - Lepšík, Martin - Řezáč, Jan
SQM2.20: Semiempirical quantum-mechanical scoring function yields DFT-quality protein-ligand binding affinity predictions in minutes.
Nature Communications. Roč. 15, February (2024), č. článku 1127. E-ISSN 2041-1723
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: NDDO approximations * free-energies * docking
Impakt faktor: 16.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-024-45431-8
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350971
Vědecká data: ZENODO - 3.0574395 - ÚOCHB 2024 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Kuba, Miroslav - Khoroshyy, Petro - Lepšík, Martin - Kužmová, Erika - Kodr, David - Kraus, Tomáš - Hocek, Michal
Real-time Imaging of Nascent DNA in Live Cells by Monitoring the Fluorescence Lifetime of DNA-Incorporated Thiazole Orange-Modified Nucleotides.
Angewandte Chemie - International Edition. Roč. 62, č. 38 (2023), č. článku e202307548. ISSN 1433-7851. E-ISSN 1521-3773
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-00885X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: DNA synthesis * fluorescence lifetime imaging microscopy * fluorophores * metabolic labelling * nucleotides
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 16.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/anie.202307548
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344723 - 4.0571224 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pávová, Marcela - Reyes Gutierrez, Paul Eduardo - Kozák, Jaroslav - Dobiaš, Juraj - Yurenko, Yevgen - Lepšík, Martin - Teplý, Filip - Weber, Jan
Helquat dyes targeting G-quadruplexes as a new class of anti-HIV-1 inhibitors.
Scientific Reports. Roč. 13, April (2023), č. článku 6096. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: long terminal repeat * promoter * binding
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41598-023-33263-3
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342496Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup s41598-023-33263-3.pdf 1 1.9 MB Vydavatelský postprint povolen - 5.0569104 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Porkolab, V. - Lepšík, Martin - Ordanini, S. - St John, A. - Le Roy, A. - Thépaut, M. - Paci, E. - Ebel, C. - Bernardi, A. - Fieschi, F.
Powerful Avidity with a Limited Valency for Virus-Attachment Blockers on DC-SIGN: Combining Chelation and Statistical Rebinding with Structural Plasticity of the Receptor.
ACS Central Science. Roč. 9, č. 4 (2023), s. 709-718. ISSN 2374-7943. E-ISSN 2374-7951
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: lectin receptors * trans-infection * ligands
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 18.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acscentsci.2c01136
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340429 - 6.0567034 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Fanfrlík, Jindřich - Brynda, Jiří - Kugler, Michael - Lepšík, Martin - Pospíšilová, Klára - Holub, Josef - Hnyk, Drahomír - Nekvinda, Jan - Grüner, Bohumír - Řezáčová, Pavlína
B-H⋯π and C-H⋯π interactions in protein-ligand complexes: carbonic anhydrase II inhibition by carborane sulfonamides.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 25, č. 3 (2023), s. 1728-1733. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT LX22NPO5102; GA ČR(CZ) GA21-14409S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388980
Klíčová slova: ⋯π * hydrogen bond * dispersion
Obor OECD: Physical chemistry; Inorganic and nuclear chemistry (UACH-T)
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D2CP04673C
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0338302Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 10.1039D2CP04673C.pdf 2 2 MB Vydavatelský postprint povolen - 7.0564527 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lin, Jingjing - Selicharová, Irena - Mitrová, Katarína - Fabre, Benjamin - Miriyala, Vijay Madhav - Lepšík, Martin - Jiráček, Jiří - Garre Hernández, María Soledad
Targeting the insulin receptor with hormone and peptide dimers.
Journal of Peptide Science. Roč. 29, č. 4 (2023), č. článku e3461. ISSN 1075-2617. E-ISSN 1099-1387
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: insulin * dimer * bioconjugate * agonism * antagonism * peptidomimetics * receptor * peptide hormone
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.1, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/psc.3461
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0336187 - 8.0556783 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Giacobelli, V. G. - Fujishima, K. - Lepšík, Martin - Tretyachenko, V. - Kadavá, T. - Makarov, M. - Bednárová, Lucie - Novák, Petr - Hlouchová, Klára
In Vitro Evolution Reveals Noncationic Protein-RNA Interaction Mediated by Metal Ions.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 39, č. 3 (2022), č. článku msac032. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
GRANT EU: European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: RNA-protein interaction * genetic code evolution * protein evolution * mRNA-display
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 10.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/molbev/msac032
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0330979Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0556783.pdf 5 982.6 KB Vydavatelský postprint povolen
Vědecká data: Mendeley Data - 9.0556399 - ÚOCHB 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Tobola, F. - Lepšík, Martin - Zia, S. R. - Leffler, H. - Nilsson, U. J. - Blixt, O. - Imberty, A. - Wiltschi, B.
Engineering the Ligand Specificity of the Human Galectin-1 by Incorporation of Tryptophan Analogues.
Chembiochem. Roč. 23, č. 5 (2022), č. článku e202100593. ISSN 1439-4227. E-ISSN 1439-7633
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: lectins * molecular dynamic * non-canonical amino acids * protein engineering * synthetic glycobiolog
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.2, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/cbic.202100593
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0331096 - 10.0553871 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Benýšek, Jakub - Buša, Michal - Rubešová, Petra - Fanfrlík, Jindřich - Lepšík, Martin - Brynda, Jiří - Matoušková, Zuzana - Bartz, U. - Horn, Martin - Gütschow, M. - Mareš, Michael
Highly potent inhibitors of cathepsin K with a differently positioned cyanohydrazide warhead: structural analysis of binding mode to mature and zymogen-like enzymes.
Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry. Roč. 37, č. 1 (2022), s. 515-526. ISSN 1475-6366. E-ISSN 1475-6374
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Cathepsin K * protease inhibitor * cyanohydrazide warhead * azadipeptide nitrile * crystal structure
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1080/14756366.2021.2024527
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0328551