Výsledky vyhledávání
- 1.0181453 - UFCH-W 20020121 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hobza, Pavel - Šponer, Jiří
Towards True DNA Base Stacking Energies: MP2, CCSD(T) and Complete Basis Set Calculations.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 124, - (2002), s. 11802-11808. ISSN 0002-7863. E-ISSN 1520-5126
Grant CEP: GA MŠMT LN00A032
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z4040901
Klíčová slova: DNA base * Complete basis set calculations
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 6.201, rok: 2002
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0078018 - 2.0181433 - UFCH-W 20020099 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wärmländer, S. - Šponer, Jiří - Leijon, M. - Šponer, Judit E.
The Influence of the Thymine C5 Methyl Group on Spontaneous Base Pair Breathing in DNA.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 277, č. 32 (2002), s. 28491-28497. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Grant CEP: GA MŠMT LN00A016
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z4040901
Klíčová slova: thymine * DNA * base pairs
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 6.696, rok: 2002
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0078004 - 3.0181432 - UFCH-W 20020098 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Schmidt, K. S. - Reedijk, J. - Weisz, K. - Janke, E. M. B. - Šponer, Judit E. - Šponer, Jiří - Lippert, B.
Loss of Hoogsteen Pairing Ability upon N1 Adenine Platinum Binding.
Inorganic Chemistry. Roč. 41, č. 11 (2002), s. 2855-2863. ISSN 0020-1669. E-ISSN 1520-510X
Grant CEP: GA MŠMT LN00A016; GA AV ČR IAA4040903
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z4040901
Klíčová slova: adenine * thymine * Hoogsteen pairing ability
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 2.950, rok: 2002
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0001886 - 4.0181425 - UFCH-W 20020091 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Trygubenko, S. A. - Bogdan, T. V. - Rueda, M. - Orozco, M. - Lugue, F. J. - Šponer, Jiří - Slavíček, Petr - Hobza, Pavel
Correlated ab initio Study of Nucleic Acid Bases and Their Tautomers in the Gas Phase, Microhydrated Environment, and in Aqueous Solution. Part 1. Cytosine.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 4, - (2002), s. 4192-4203. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA MŠMT LN00A032
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z4040901
Klíčová slova: correlated ab initio study * nucleic acid bases * cytosine
Kód oboru RIV: CH - Jaderná a kvantová chemie, fotochemie
Impakt faktor: 1.838, rok: 2002
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0077998 - 5.0181417 - UFCH-W 20020086 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lankaš, Filip - Cheatham III, T. E. - Špačková, Naďa - Hobza, Pavel - Langowski, I. - Šponer, Jiří
Critical Effect of the N2 Amino Group on Structure, Dynamics, and Elasticity of DNA Polypurine Tracts.
Biophysical Journal. Roč. 82, č. 5 (2002), s. 2592-2609. ISSN 0006-3495. E-ISSN 1542-0086
Grant CEP: GA MŠMT LN00A032
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z4040901
Klíčová slova: elasticity of DNA * polypurine tracts * MD simulations
Kód oboru RIV: CH - Jaderná a kvantová chemie, fotochemie
Impakt faktor: 4.643, rok: 2002
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0077991 - 6.0181402 - UFCH-W 20020066 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šponer, Jiří - Leszczynski, J. - Hobza, Pavel
Electronic Properties, Hydrogen Bonding, Stacking, and Cation Binding of DNA and RNA Bases.
Biopolymers. Roč. 61, č. 1 (2002), s. 3-31. ISSN 0006-3525. E-ISSN 1097-0282
Grant CEP: GA MŠMT LN00A032
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z4040901
Klíčová slova: hydrogen bonding * stacking * cation binding of DNA and RNA bases
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 2.372, rok: 2002
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0077978 - 7.0181401 - UFCH-W 20020065 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Řeha, David - Kabeláč, Martin - Ryjáček, Filip - Šponer, Jiří - Šponer, Judit E. - Elstner, M. - Suhai, S. - Hobza, Pavel
Intercalators. 1. Nature of Stacking Interactions between Intercalators (Ethidium, Daunomycin, Ellipticine and 4'',6-Diaminide-2-phenylindole) and DNA Base Pairs. Ab initio Quantum Chemical, Density Functional Theory and Empirical Potentional Study.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 124, č. 13 (2002), s. 3366-3376. ISSN 0002-7863. E-ISSN 1520-5126
Grant CEP: GA MŠMT LN00A032
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z4040901
Klíčová slova: DNA * intercalators * an initio calculations
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 6.201, rok: 2002
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0077977 - 8.0181281 - UFCH-W 20010202 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šponer, Judit E. - Glahé, F. - Leszczynski, J. - Lippert, B. - Šponer, Jiří
How Nucleobases Rotate When Bonded to a Metal Ion: Detailed View from an ab initio Quantum Chemical Study of a Cytosine Complex of trans-a2PTII.
Journal of Physical Chemistry. B. Roč. 105, č. 48 (2001), s. 12171-12179. ISSN 1089-5647
Grant CEP: GA MŠMT LN00A032
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z4040901
Klíčová slova: ab initio * metaleted base pairs * metal cations
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.379, rok: 2001
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0077863 - 9.0181270 - UFCH-W 20010188 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Šponer, Judit E. - Šponer, Jiří - Čejka, Jiří
Ab initio Quantum Chemical Study on the Zeolite Catalyzed Transformations of Para-Xylene.
Journal of Molecular Structure. Theochem. Roč. 540, č. 1 (2001), s. 145-152. ISSN 0166-1280
Grant CEP: GA AV ČR IAA4040707
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z4040901
Klíčová slova: xylene * catalysis * zeolite
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 0.919, rok: 2001
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0077853 - 10.0181262 - UFCH-W 20010178 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Burda, J. V. - Šponer, Jiří - Leszczynski, J.
The Influence of Square Planar Platinum Complexes on DNA Bases Pairing. An ab initio DFT Study.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 3, č. 19 (2001), s. 4404-4411. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA MŠMT LN00A032
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z4040901
Klíčová slova: DNA base pairing * platinated base pairs * ab initio DFT study
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 1.787, rok: 2001
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0077845