Výsledky vyhledávání
- 1.0582122 - ÚFCH JH 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lolicato, F. - Steringer, J. P. - Saleppico, R. - Beyer, D. - Fernandez-Sobaberas, J. - Unger, S. - Klein, S. - Riegerová, Petra - Wegehingel, S. - Müller, H.-M. - Schmitt, X. J. - Kaptan, S. - Freund, Ch. - Hof, Martin - Šachl, Radek - Chlanda, P. - Vattulainen, I. - Nickel, W.
Disulfide bridge-dependent dimerization triggers FGF2 membrane translocation into the extracellular space.
eLife. Roč. 13, JAN 2024 (2024), č. článku RP88579. ISSN 2050-084X. E-ISSN 2050-084X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GC20-01401J
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: biochemistry * chemical biology * Protein-protein interaction
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 7.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://elifesciences.org/articles/88579
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350225Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0582122preprint.pdf 0 13.9 MB open access Autorský preprint povolen - 2.0581631 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Martin, A. - Tempra, Carmelo - Yu, Y. - Liekkinen, J. - Thakker, R. - Lee, H. - de Santos Moreno, B. - Vattulainen, I. - Rossios, C. - Javanainen, Matti - de la Serna, J. B.
Exposure to Aldehyde Cherry e-Liquid Flavoring and Its Vaping Byproduct Disrupt Pulmonary Surfactant Biophysical Function.
Environmental Science & Technology Letters. Roč. 58, č. 3 (2024), s. 1495-1508. ISSN 2328-8930
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: e-cigarettes * vaping * lung surfactant * inhalationtoxicology * mechanistictoxicology * exposureand human health
Impakt faktor: 10.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.est.3c07874
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349740 - 3.0571957 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Fábián, Balázs - Vattulainen, I. - Javanainen, Matti
Protein Crowding and Cholesterol Increase Cell Membrane Viscosity in a Temperature Dependent Manner.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 19, č. 9 (2023), s. 2630-2643. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * lateral diffusion * force field
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jctc.3c00060
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342809 - 4.0570790 - ÚFCH JH 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Liekkinen, J. - Olžyńska, Agnieszka - Cwiklik, Lukasz - de la Serna, J. B. - Vattulainen, I. - Javanainen, Matti
Surfactant Proteins SP-B and SP-C in Pulmonary Surfactant Monolayers: Physical Properties Controlled by Specific Protein-Lipid Interactions.
Langmuir. Roč. 39, č. 12 (2023), s. 4338-4350. ISSN 0743-7463
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-19854S
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: Compression * Isotherms * Lipids
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342129Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0570790.pdf 0 8.5 MB open access Vydavatelský postprint povolen - 5.0561666 - ÚFCH JH 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Ragaller, F. - Andronico, L. - Sýkora, Jan - Kulig, W. - Rog, T. - Urem, Y. B. - Abhinav, Abhinav - Danylchuk, D. I. - Hof, Martin - Klymchenko, A. - Amaro, Mariana - Vattulainen, I. - Sezgin, E.
Dissecting the mechanisms of environment sensitivity of smart probes for quantitative assessment of membrane properties.
Open Biology. Roč. 12, č. 9 (2022), č. článku 220175. E-ISSN 2046-2441
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-26854X
GRANT EU: European Commission(XE) 860592 - PROTON
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: environment-sensitive probes * spectralimaging * lipid saturation
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0334190Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0561666.pdf 2 46.5 MB open access Vydavatelský postprint povolen - 6.0544836 - ÚMG 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vuorio, J. - Škerlová, Jana - Fábry, Milan - Veverka, V. - Vattulainen, I. - Řezáčová, Pavlína - Martinez-Seara, H.
N-Glycosylation can selectively block or foster different receptor-ligand binding modes.
Scientific Reports. Roč. 11, č. 1 (2021), č. článku 5239. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: N-glycosylation * simulations and NMR * importance of glycosylation in protein function
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 4.997, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-021-84569-z
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0321647 - 7.0541666 - ÚOCHB 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Souza, P. C.T. - Alessandri, R. - Barnoud, J. - Thallmair, S. - Faustino, I. - Grünewald, F. - Patmanidis, I. - Abdizadeh, H. - Bruininks, B. M.H. - Wassenaar, T. A. - Kroon, P. C. - Melcr, J. - Nieto, V. - Corradi, V. - Khan, H. M. - Domański, J. - Javanainen, Matti - Martinez-Seara, Hector - Reuter, N. - Best, R. B. - Vattulainen, I. - Monticelli, L. - Periole, X. - Tieleman, D. P. - de Vries, A. H. - Marrink, S. J.
Martini 3: a general purpose force field for coarse-grained molecular dynamics.
Nature Methods. Roč. 18, č. 4 (2021), s. 382-388. ISSN 1548-7091. E-ISSN 1548-7105
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-19561S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics * coarse-grained model * simulations
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 47.990, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1038/s41592-021-01098-3
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319198
Vědecká data: GitHub - 8.0541209 - ÚOCHB 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vuorio, J. - Škerlová, Jana - Fábry, M. - Veverka, Václav - Vattulainen, I. - Řezáčová, Pavlína - Martinez-Seara, Hector
N-Glycosylation can selectively block or foster different receptor–ligand binding modes.
Scientific Reports. Roč. 11, č. 1 (2021), č. článku 5239. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA ČR(CZ) GA19-19561S; GA MŠMT(CZ) LO1304
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: glycosylation * ligand binding * sugar-protein interaction
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.997, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41598-021-84569-z
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0318805 - 9.0536178 - ÚFCH JH 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Olžyńska, Agnieszka - Kulig, W. - Mikkolainen, H. - Czerniak, T. - Jurkiewicz, Piotr - Cwiklik, Lukasz - Rog, T. - Hof, Martin - Jungwirth, Pavel - Vattulainen, I.
Tail-Oxidized Cholesterol Enhances Membrane Permeability for Small Solutes.
Langmuir. Roč. 36, č. 35 (2020), s. 10438-10447. ISSN 0743-7463
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-26854X; GA ČR(CZ) GA18-26751S; GA ČR(CZ) GA17-06792S
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: molecular-dynamics simulations * alkyl chain unsaturation * atom force-field * lipid-bilayer * phospholipids * liposomes * oxidation * translocation * transitions * oxysterols
Obor OECD: Physical chemistry; Physical chemistry (UOCHB-X)
Impakt faktor: 3.882, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0313993Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0536178.pdf 3 2.6 MB open access Vydavatelský postprint povolen - 10.0535901 - ÚOCHB 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Liekkinen, J. - de Santos Moreno, B. - Paananen, R. O. - Vattulainen, I. - Monticelli, L. - de la Serna, J. B. - Javanainen, Matti
Understanding the Functional Properties of Lipid Heterogeneity in Pulmonary Surfactant Monolayers at the Atomistic Level.
Frontiers in Cell and Developmental Biology. Roč. 8, Nov 16 (2020), č. článku 581016. ISSN 2296-634X. E-ISSN 2296-634X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: pulmonary surfactant * lipid monolayer * molecular dynamics simulation * pressure-area isotherm * atomic force microscopy * heterogeneity * membrane domain
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 6.684, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fcell.2020.581016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0313859