Výsledky vyhledávání
- 1.0346457 - ÚOCHB 2011 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Crews, B. O. - Abo-Riziq, A. - Pluháčková, Kristýna - Thompson, P. - Hill, G. - Hobza, Pavel - de Vries, M. S.
Guanine–aspartic acid interactions probed with IR–UV resonance Spectroscopy.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 12, č. 14 (2010), s. 3597-3605. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA AV ČR IAA400550510
Grant ostatní: NSF(US) CHE-0911564
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: double resonance spectroscopy * correlated ab initio calculations * guanine-aspartic acid complexes
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.454, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0187481 - 2.0328589 - ÚOCHB 2010 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Zendlová, Lucie - Řeha, D. - Hocek, Michal - Hobza, Pavel
Theoretical study of the stability of the DNA duplexes modified by a series of hydrophobic base analogues.
Chemistry - A European Journal. Roč. 15, č. 31 (2009), s. 7601-7610. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA AV ČR IAA400550510; GA ČR GA203/05/0043
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: DNA structures * solvent effects * stacking interactions
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 5.382, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0174878 - 3.0327972 - ÚOCHB 2010 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Berka, Karel - Hobza, Pavel - Vondrášek, Jiří
Analysis of Energy Stabilization inside the Hydrophobic Core of Rubredoxin.
ChemPhysChem. Roč. 10, č. 3 (2009), s. 543-548. ISSN 1439-4235. E-ISSN 1439-7641
Grant CEP: GA ČR GA203/05/0009; GA ČR GA203/06/1727; GA ČR(CZ) GD203/05/H001; GA AV ČR IAA400550510; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: hydrophobic core * protein stability * SAPT method
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.453, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0174393 - 4.0327935 - ÚOCHB 2010 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Ran, Jiong - Hobza, Pavel
On the Nature of Bonding in Lone Pair ...pi-Electron Complexes: CCSD(T)/Complete Basis Set Limit Calculations.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 5, č. 4 (2009), s. 1180-1185. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA AV ČR IAA400550510
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: lone pair...pi-electron complexes * nature of bonding * CCSD(T)/ complete basis set limit calculations
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.804, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0174360 - 5.0324799 - ÚOCHB 2009 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Berka, Karel - Laskowski, R. - Riley, K. E. - Hobza, Pavel - Vondrášek, Jiří
Representative amino acid side chain interactions in proteins. A comparison of highly accurate correlated ab initio quantum chemical and empirical potential procedures.
[Reprezentativní interakce aminokyselin v proteinech: srovnání přesných ab-initio kvantově chemických výpočtů s empirickými potenciály.]
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 5, č. 4 (2009), s. 982-992. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR GA203/05/0009; GA ČR(CZ) GD203/05/H001; GA AV ČR IAA400550510; GA MŠMT LC512
Grant ostatní: NSF(US) EPS-0701525
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: amino acid * ab initio methods * empirical potentials
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.804, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0172408 - 6.0316489 - ÚOCHB 2009 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pluháčková, Kristýna - Grimme, S. - Hobza, Pavel
On the Importance of Electron Correlation Effects for the Intramolecular Stacking Geometry of a Bis-Thiophene Derivative.
[Důležitost elektronových korelačních efektů pro intramolekovou patrovou geometrii derivátu dithiofenu.]
Journal of Physical Chemistry A. Roč. 112, č. 48 (2008), s. 12469-12474. ISSN 1089-5639. E-ISSN 1520-5215
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA AV ČR IAA400550510
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: electron correlation effects * intramolecular stacking * thiophene derivative
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 2.871, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0004914 - 7.0315915 - ÚOCHB 2009 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Wang, Weizhou - Hobza, Pavel
Application of Berlin's theorem to bond-length changes in isolated molecules and red- and blue-shifting H-bonded clusters.
[Použití Berlinova teorému k předpovědi změn vazebných délek v izolovaných molekulách a červeného a modrého posunu v komplexech s vodíkovou vazbou.]
Collection of Czechoslovak Chemical Communications. Roč. 73, 6/7 (2008), s. 862-872. ISSN 0010-0765
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA AV ČR IAA400550510
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: Berlin's theorem * H-bonding * Blue-shifting H-bonding
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 0.784, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0165991 - 8.0315725 - ÚOCHB 2009 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Řezáč, Jan - Hobza, Pavel
Benzene dimer: Dynamic structure and thermodynamics derived from on-the-fly ab initio DFT-D molecular dynamic simulations.
[Benzen dimer: dynamická struktura a termodynamická data odvozená ab-initio molekulové dynamiky.]
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 4, č. 11 (2008), s. 1835-1840. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA AV ČR IAA400550510
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: benzene dimer * dynamic structure * on-the fly ab initio DFT-D molecular dynamic simulation
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.274, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0165841 - 9.0315418 - ÚOCHB 2009 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Řezáč, Jan - Berka, Karel - Horinek, D. - Hobza, Pavel - Vondrášek, Jiří
The stabilization energy of the Glu-Lys salt bridge in the protein/water environment: Correlated quantum chemical ab initio, DFT and empirical potential studies.
[Stabilizační energie iontového páru Glu-Lys pro protein ve vodném prostředí: studie pomocí metod kvantové chemie, DFT a empirického potenciálu.]
Collection of Czechoslovak Chemical Communications. Roč. 73, 6/7 (2008), s. 921-936. ISSN 0010-0765
Grant CEP: GA AV ČR IAA400550510; GA ČR GA203/06/1727; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: salt bridges * ion pairs * protein stabilization * interaction energies * protein dielectric
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 0.784, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0165624 - 10.0314788 - ÚOCHB 2009 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Valdes, Haydee - Pluháčková, Kristýna - Pitoňák, Michal - Řezáč, Jan - Hobza, Pavel
Benchmark database on isolated small peptides containing an aromatic side chain: comparison between wave function and density functional theory methods and empirical force field.
[Srovnávací databáze malých izolovaných peptidů obsahujících aromatický postranní řetězec: srovnání mezi metodami založenými na vlnové funkci, teorii hustotního funkcionálu a empirickém silovém poli.]
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 10, č. 19 (2008), s. 2747-2757. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA AV ČR IAA400550510; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: London dispersion forces * isolated small peptides * CCSD(T)/CBS benchmark data
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.064, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0165182