Výsledky vyhledávání

  1. 1.
    0586626 - ÚEB 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
    Pavlů, Šimon - Nikumbh, S. - Kováčik, Martin - An, T. - Lenhard, B. - Šimková, Hana - Navrátilová, Pavla
    Core promoterome of barley embryo.
    Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 23, DEC (2024), s. 264-277. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
    Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-18794S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827
    Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
    Institucionální podpora: RVO:61389030
    Klíčová slova: Cap Analysis of Gene Expression * Core promoter * Hordeum vulgare * Initiator * Morex * TOR-signaling * Transcription regulation
    Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
    Impakt faktor: 6, rok: 2022
    Způsob publikování: Open access
    https://doi.org/10.1016/j.csbj.2023.12.003
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0354071
    Název souboruStaženoVelikostKomentářVerzePřístup
    2024_Pavlu_Computational and Structural Biotechnology Journal_264.pdf112.7 MBJinápovolen
     
     
  2. 2.
    0571534 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
    Weidner, J. - Neitzel, Ch. - Gote, M. - Deck, J. - Kuentzelmann, K. - Pilarczyk, G. - Falk, Martin - Hausmann, M.
    Advanced image-free analysis of the nano-organization of chromatin and other biomolecules by Single Molecule Localization Microscopy (SMLM).
    Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 21, MAR 2023 (2023), s. 2018-2034. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
    Grant CEP: GA ČR GC20-04109J
    Institucionální podpora: RVO:68081707
    Klíčová slova: Single molecule localization microscopy * (smlm) * Ripley distance frequency histograms * Persistent homology * Persistent image * Principal component analysis * Application of mathematical analysis tools to * chromatin organization and DNA repair * processes
    Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
    Impakt faktor: 6, rok: 2022
    Způsob publikování: Open access
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037023001083?via%3Dihub
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349895
     
     
  3. 3.
    0571383 - FGÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
    Masaryk, Jakub - Kale, Deepika - Pohl, Pavel - Ruiz-Castilla, F. J. - Zimmermannová, Olga - Obšilová, Veronika - Ramos, J. - Sychrová, Hana
    The second intracellular loop of the yeast Trk1 potassium transporter is involved in regulation of activity, and interaction with 14–3-3 proteins.
    Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 21, April (2023), s. 2705-2716. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
    Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-04420S; GA ČR(CZ) GA21-08985S; GA MŠMT(CZ) LTC20005
    Institucionální podpora: RVO:67985823
    Klíčová slova: potassium ion uptake * Saccharomyces cerevisiae * phosphorylation * Trk1 * 14–3–3 proteins
    Obor OECD: Microbiology
    Impakt faktor: 6, rok: 2022
    Způsob publikování: Open access
    https://doi.org/10.1016/j.csbj.2023.04.019
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342627
     
     
  4. 4.
    0570259 - ÚFE 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
    Průša, Jiří - Cifra, Michal
    Electro-detachment of kinesin motor domain from microtubule in silico.
    Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 21, FEB 2023 (2023), s. 1349-1361. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
    Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-06873X
    Grant ostatní: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy - GA MŠk(CZ) LM2018140
    Institucionální podpora: RVO:67985882
    Klíčová slova: Electric field * Proteins * Tubulin * Microtubules * Molecular dynamics simulation
    Obor OECD: Biophysics
    Impakt faktor: 6, rok: 2022
    Způsob publikování: Omezený přístup
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345167
    Název souboruStaženoVelikostKomentářVerzePřístup
    UFE 0570259.pdf37 MBJinávyžádat
     
    Vědecká data v ASEP:
    Raw data for the paper Molecular dynamics simulation trajectories dataset of a kinesin on tubulin heterodimers in electric field A2103
     
  5. 5.
    0569718 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
    Veverka, Pavel - Brom, T. - Janovic, T. - Stojaspal, Martin - Pinkas, M. - Nováček, J. - Hofr, C.
    Electron microscopy reveals toroidal shape of master neuronal cell differentiator REST RE1-silencing transcription factor.
    Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 21, JAN 2023 (2023), s. 731-741. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
    Institucionální podpora: RVO:68081707
    Klíčová slova: rest * RE1-silencing transcription factor * Neuron-restrictive silencer factor * Neuronal * Differentiation * rest-n62 * rest4 * nrsf * em * Electron microscopy
    Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
    Impakt faktor: 6, rok: 2022
    Způsob publikování: Open access
    https://www.csbj.org/action/showPdf?pii=S2001-0370%2822%2900582-7
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344342
     
     
  6. 6.
    0567811 - BC 2023 RIV SE eng J - Článek v odborném periodiku
    Gerasimov, E. S. - Afonin, D.A. - Korzhavina, O.A. - Lukeš, Julius - Low, R. - Hall, N. - Tyler, K. - Yurchenko, V. - Zimmer, S.L.
    Mitochondrial RNA editing in Trypanoplasma borreli: New tools, new revelations.
    Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 20, NOV (2022), s. 6388-6402. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
    Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-01026S
    Institucionální podpora: RVO:60077344
    Klíčová slova: ATPase 6 * Euglenozoa * guide RNA * Maxicircle * Metakinetoplastina * Mitochondrion * RNA editing
    Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
    Impakt faktor: 6, rok: 2022
    Způsob publikování: Open access
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037022005177?via%3Dihub
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0339051
     
     
  7. 7.
    0567744 - MBÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
    Masuda, Takako - Inomura, K. - Gao, M. - Armin, G. - Kotabová, Eva - Bernát, Gábor - Lawrenz-Kendrick, Evelyn - Lukeš, Martin - Bečková, Martina - Steinbach, Gabor - Komenda, Josef - Prášil, Ondřej
    The balance between photosynthesis and respiration explains the niche differentiation between Crocosphaera and Cyanothece.
    Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 21, January 23 (2023), s. 58-65. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
    Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-17627S; GA ČR(CZ) GX19-29225X
    Institucionální podpora: RVO:61388971
    Klíčová slova: ucyn-b * ucyn-c * Niche separation * Carbon consumption
    Obor OECD: Microbiology
    Impakt faktor: 6, rok: 2022
    Způsob publikování: Open access
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037022005256?via%3Dihub
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342540
     
     
  8. 8.
    0565346 - ÚOCHB 2023 RIV SE eng J - Článek v odborném periodiku
    Musil, M. - Jezik, A. - Jankujova, M. - Stourac, J. - Galgonek, Jakub - Eyrilmez, S.M. - Vondrášek, Jiří - Damborský, J. - Bednář, D.
    Fully automated virtual screening pipeline of FDA-approved drugs using Caver Web.
    Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 20, January (2022), s. 6512-6518. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
    Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018131; GA MŠMT LX22NPO5102
    Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
    Institucionální podpora: RVO:61388963
    Klíčová slova: caver * caverdock * channel * FDA-approved drug * tunnel * virtual screening * web
    Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
    Impakt faktor: 6, rok: 2022
    Způsob publikování: Open access
    https://doi.org/10.1016/j.csbj.2022.11.031
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0336898
    Název souboruStaženoVelikostKomentářVerzePřístup
    10.1016j.csbj.2022.11.031.pdf11.6 MBVydavatelský postprintpovolen
     
     
  9. 9.
    0559398 - BC 2023 RIV SE eng J - Článek v odborném periodiku
    Selinger, Martin - Věchtová, P. - Tykalová, Hana - Oslejskova, P. - Rumlová, M. - Štěrba, J. - Grubhoffer, Libor
    Integrative RNA profiling of TBEV-infected neurons and astrocytes reveals potential pathogenic effectors.
    Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 20, JUN (2022), s. 2759-2777. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
    Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTARF18021; GA ČR(CZ) GA18-27204S
    Institucionální podpora: RVO:60077344
    Klíčová slova: Alternative splicing * Astrocytes * miRNA * Neurons * Response to infection * Neuropathogenesis * Tick-borne encephalitis virus * Transcriptomics
    Obor OECD: Microbiology
    Impakt faktor: 6, rok: 2022
    Způsob publikování: Open access
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037022002070?via%3Dihub
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340284
     
     
  10. 10.
    0557418 - BFÚ 2023 RIV SE eng J - Článek v odborném periodiku
    Nikitin, D. - Mican, J. - Toul, J. - Bednar, D. - Pešková, Michaela - Kittová, Patrícia - Thalerová, Sandra - Víteček, Jan - Damborský, J. - Mikulik, R. - Fleishman, S. - Prokop, Z. - Marek, M.
    Computer-aided engineering of staphylokinase toward enhanced affinity and selectivity for plasmin.
    Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 20, MAR 2022 (2022), s. 1366-1377. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
    Institucionální podpora: RVO:68081707
    Klíčová slova: angiographic patency trial * recombinant staphylokinase * mechanical stability * ischemic-stroke * activator * fibrin
    Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
    Impakt faktor: 6, rok: 2022
    Způsob publikování: Open access
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037022000794?via%3Dihub
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0339575
     
     

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.