Výsledky vyhledávání
- 1.0584248 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Neumann, Pavel - Oliveira, Ludmila - Jang, Tae-Soo - Novák, Petr - Koblížková, Andrea - Schubert, V. - Houben, A. - Macas, Jiří
Disruption of the standard kinetochore in holocentric Cuscuta species.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 120, č. 21 (2023), č. článku e2300877120. ISSN 0027-8424. E-ISSN 1091-6490
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-25440S; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: kinetochore * centromere * holocentric * monocentric * Cuscuta
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 11.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2300877120
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352329 - 2.0584246 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Macas, Jiří - Robledillo, Laura Avila - Kreplak, J. - Novák, Petr - Koblížková, Andrea - Vrbová, Iva - Burstin, J. - Neumann, Pavel
Assembly of the 81.6 Mb centromere of pea chromosome 6 elucidates the structure and evolution of metapolycentric chromosomes.
PLoS Genetics. Roč. 19, č. 2 (2023), č. článku e1010633. ISSN 1553-7404. E-ISSN 1553-7404
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genome * kinetochore * duplication * annotation * generation * alignment * sequence * provides * shows * gene
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 4.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1010633
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352322 - 3.0584200 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Edwards, A. - Njaci, I. - Sarkar, A. - Jiang, Z. - Kaithakottil, G. G. - Moore, C. - Cheema, J. - Stevenson, C. E. M. - Rejzek, M. - Novák, Petr - Vigouroux, M. - Vickers, M. - Wouters, R. H. M. - Paajanen, P. - Steuernagel, B. - Moore, J. D. - Higgins, J. - Swarbreck, D. - Martens, S. - Kim, C. Y. - Weng, J. - Mundree, S. - Kilian, B. - Kumar, S. - Loose, M. - Yant, L. - Macas, Jiří - Wang, T. L. - Martin, C. - Emmrich, P. M. F.
Genomics and biochemical analyses reveal a metabolon key to β-L-ODAP biosynthesis in Lathyrus sativus.
Nature Communications. Roč. 14, č. 1 (2023), č. článku 5199. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Grass pea (Lathyrus sativus L.) * L. sativus genome * biosynthetic pathway * neurotoxin
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 16.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-023-36503-2
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352311 - 4.0571900 - ÚEB 2024 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Jayakodi, M. - Golicz, A. A. - Kreplak, J. - Fechete, L. I. - Angra, D. - Bednář, P. - Bornhofen, E. - Zhang, H. - Boussageon, R. - Kaur, S. - Cheung, K. - Čížková, Jana - Gundlach, H. - Hallab, A. - Imbert, E. - Keeble-Gagnère, G. - Koblížková, Andrea - Kobrlová, L. - Krejčí, P. - Mouritzen, T. W. - Neumann, Pavel - Nadzieja, M. - Nielsen, L. K. - Novák, Petr - Orabi, J. - Padmarasu, S. - Robertson-Shersby-Harvie, T. - Robledillo, Laura Avila - Schiemann, A. - Tanskanen, J. - Törönen, P. - Warsame, A. O. - Wittenberg, A. H.J. - Himmelbach, A. - Aubert, G. - Courty, P.-E. - Doležel, Jaroslav - Holm, L. U. - Janss, L. L. - Khazaei, H. - Macas, Jiří - Mascher, M. - Smýkal, P. - Snowdon, R. J. - Stein, N. - Stoddard, F. L. - Stougaard, J. - Tayeh, N. - Torres, A. M. - Usadel, C. - Schubert, I. - O’Sullivan, D. - Schulman, A. H. - Andersen, S.U.
The giant diploid faba genome unlocks variation in a global protein crop.
Nature. Roč. 615, č. 7953 (2023), s. 652-659. ISSN 0028-0836. E-ISSN 1476-4687
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-24252S; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:60077344
Klíčová slova: NUCLEAR-DNA CONTENT * SEQUENCE * PROGRAM
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3); Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BC-A)
Impakt faktor: 64.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41586-023-05791-5
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342790Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2023_Jayakodi_NATURE_652.pdf 2 11.5 MB Jiná povolen - 5.0568619 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Schley, R. J. - Pellicer, J. - Ge, X. - Barrett, C. - Bellot, S. - Guignard, M. S. - Novák, Petr - Suda, Jan - Fraser, D. - Baker, W. J. - Dodsworth, S. - Macas, Jiří - Leitch, A. R. - Leitch, I. J.
The ecology of palm genomes: repeat-associated genome size expansion is constrained by aridity.
New Phytologist. Roč. 236, č. 2 (2022), s. 433-446. ISSN 0028-646X. E-ISSN 1469-8137
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:67985939
Klíčová slova: adaptation * Arecaceae (palms) * ecology * genome size * phylogenetic regression * plant evolution * trait evolution * transposable elements
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3); Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BU-J)
Impakt faktor: 9.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.18323
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0339892 - 6.0568618 - BC 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hofstatter, P. G. - Thangavel, G. - Lux, T. - Neumann, Pavel - Vondrak, Tihana - Novák, Petr - Zhang, M. - Costa, L. - Castellani, M. - Scott, A. - Toegelová, Helena - Fuchs, J. - Mata-Sucre, Y. - Dias, Y. - Vanzela, A.L.L. - Huettel, B. - Almeida, C. C. S. - Šimková, Hana - Souza, G. - Pedrosa-Harand, A. - Macas, Jiří - Mayer, K. F. X. - Houben, A. - Marques, A.
Repeat-based holocentromeres influence genome architecture and karyotype evolution.
Cell. Roč. 185, č. 17 (2022), s. 3153-3168. ISSN 0092-8674. E-ISSN 1097-4172
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-24252S; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61389030
Klíčová slova: spatial genome organization * holocentric chromosomes * genome regulation * centromere * Rhynchospora * transposable elements * whole-genome duplication
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3); Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (UEB-Q)
Impakt faktor: 64.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867422007978?via%3Dihub#kwrds0010
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0339891 - 7.0548344 - BC 2022 RIV SE eng J - Článek v odborném periodiku
Vondrak, Tihana - Oliveira, Ludmila - Novák, Petr - Koblížková, Andrea - Neumann, Pavel - Macas, Jiří
Complex sequence organization of heterochromatin in the holocentric plant Cuscuta europaea elucidated by the computational analysis of nanopore reads.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 19, Apr 22 (2021), s. 2179-2189. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-24252S; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR-CZ II - 90131
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Satellite DNA * Heterochromatin * Oxford Nanopore sequencing * Fluorescence in situ hybridization * Holocentric chromosomes * LINE elements
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 6.155, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037021001227?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329092 - 8.0538723 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hoang, P.T. N. - Fiebig, A. - Novák, Petr - Macas, Jiří - Cao, H.X. - Stepanenko, A. - Chen, G. - Borisjuk, N. - Scholz, U. - Schubert, I.
Chromosome-scale genome assembly for the duckweed Spirodela intermedia, integrating cytogenetic maps, PacBio and Oxford Nanopore libraries.
Scientific Reports. Roč. 10, č. 1 (2020), č. článku 19230. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: lemna-minor * annotation * polyrhiza * sequence * evolution * l.
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 4.380, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-020-75728-9
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0316459 - 9.0535085 - BC 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Neumann, Pavel - Oliveira, Ludmila - Čížková, Jana - Jang, Tae-Soo - Klemme, Sonja - Novák, Petr - Stelmach, K. - Koblížková, Andrea - Doležel, Jaroslav - Macas, Jiří
Impact of parasitic lifestyle and different types of centromere organization on chromosome and genome evolution in the plant genus Cuscuta.
New Phytologist. Roč. 229, č. 4 (2021), s. 2365-2377. ISSN 0028-646X. E-ISSN 1469-8137
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-09750S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61389030
Klíčová slova: centromere * Convolvulaceae * Cuscuta * genome size * holocentric chromosomes * monocentric chromosomes * repetitive DNA
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3); Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (UEB-Q)
Impakt faktor: 10.323, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.17003
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320779 - 10.0534690 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Novák, Petr - Neumann, Pavel - Macas, Jiří
Global analysis of repetitive DNA from unassembled sequence reads using RepeatExplorer2.
Nature Protocols. Roč. 15, č. 11 (2020), s. 3745-3776. ISSN 1754-2189. E-ISSN 1750-2799
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001777
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: generation * evolution * elements
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 13.491, rok: 2020
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.nature.com/articles/s41596-020-0400-y
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0312865