Výsledky vyhledávání
- 1.0584248 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Neumann, Pavel - Oliveira, Ludmila - Jang, Tae-Soo - Novák, Petr - Koblížková, Andrea - Schubert, V. - Houben, A. - Macas, Jiří
Disruption of the standard kinetochore in holocentric Cuscuta species.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 120, č. 21 (2023), č. článku e2300877120. ISSN 0027-8424. E-ISSN 1091-6490
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-25440S; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: kinetochore * centromere * holocentric * monocentric * Cuscuta
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 11.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2300877120
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352329 - 2.0584246 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Macas, Jiří - Robledillo, Laura Avila - Kreplak, J. - Novák, Petr - Koblížková, Andrea - Vrbová, Iva - Burstin, J. - Neumann, Pavel
Assembly of the 81.6 Mb centromere of pea chromosome 6 elucidates the structure and evolution of metapolycentric chromosomes.
PLoS Genetics. Roč. 19, č. 2 (2023), č. článku e1010633. ISSN 1553-7404. E-ISSN 1553-7404
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genome * kinetochore * duplication * annotation * generation * alignment * sequence * provides * shows * gene
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 4.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1010633
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352322 - 3.0571900 - ÚEB 2024 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Jayakodi, M. - Golicz, A. A. - Kreplak, J. - Fechete, L. I. - Angra, D. - Bednář, P. - Bornhofen, E. - Zhang, H. - Boussageon, R. - Kaur, S. - Cheung, K. - Čížková, Jana - Gundlach, H. - Hallab, A. - Imbert, E. - Keeble-Gagnère, G. - Koblížková, Andrea - Kobrlová, L. - Krejčí, P. - Mouritzen, T. W. - Neumann, Pavel - Nadzieja, M. - Nielsen, L. K. - Novák, Petr - Orabi, J. - Padmarasu, S. - Robertson-Shersby-Harvie, T. - Robledillo, Laura Avila - Schiemann, A. - Tanskanen, J. - Törönen, P. - Warsame, A. O. - Wittenberg, A. H.J. - Himmelbach, A. - Aubert, G. - Courty, P.-E. - Doležel, Jaroslav - Holm, L. U. - Janss, L. L. - Khazaei, H. - Macas, Jiří - Mascher, M. - Smýkal, P. - Snowdon, R. J. - Stein, N. - Stoddard, F. L. - Stougaard, J. - Tayeh, N. - Torres, A. M. - Usadel, C. - Schubert, I. - O’Sullivan, D. - Schulman, A. H. - Andersen, S.U.
The giant diploid faba genome unlocks variation in a global protein crop.
Nature. Roč. 615, č. 7953 (2023), s. 652-659. ISSN 0028-0836. E-ISSN 1476-4687
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-24252S; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:60077344
Klíčová slova: NUCLEAR-DNA CONTENT * SEQUENCE * PROGRAM
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3); Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BC-A)
Impakt faktor: 64.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41586-023-05791-5
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342790Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2023_Jayakodi_NATURE_652.pdf 2 11.5 MB Jiná povolen - 4.0548344 - BC 2022 RIV SE eng J - Článek v odborném periodiku
Vondrak, Tihana - Oliveira, Ludmila - Novák, Petr - Koblížková, Andrea - Neumann, Pavel - Macas, Jiří
Complex sequence organization of heterochromatin in the holocentric plant Cuscuta europaea elucidated by the computational analysis of nanopore reads.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 19, Apr 22 (2021), s. 2179-2189. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-24252S; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR-CZ II - 90131
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Satellite DNA * Heterochromatin * Oxford Nanopore sequencing * Fluorescence in situ hybridization * Holocentric chromosomes * LINE elements
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 6.155, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037021001227?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329092 - 5.0535085 - BC 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Neumann, Pavel - Oliveira, Ludmila - Čížková, Jana - Jang, Tae-Soo - Klemme, Sonja - Novák, Petr - Stelmach, K. - Koblížková, Andrea - Doležel, Jaroslav - Macas, Jiří
Impact of parasitic lifestyle and different types of centromere organization on chromosome and genome evolution in the plant genus Cuscuta.
New Phytologist. Roč. 229, č. 4 (2021), s. 2365-2377. ISSN 0028-646X. E-ISSN 1469-8137
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-09750S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61389030
Klíčová slova: centromere * Convolvulaceae * Cuscuta * genome size * holocentric chromosomes * monocentric chromosomes * repetitive DNA
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3); Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (UEB-Q)
Impakt faktor: 10.323, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.17003
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320779 - 6.0533992 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Novák, Petr - Guignard, M.S. - Neumann, Pavel - Kelly, L.J. - Mlinarec, J. - Koblížková, Andrea - Dodsworth, S. - Kovařík, Aleš - Pellicer, J. - Wang, W. - Macas, Jiří - Leitch, I. J. - Leitch, A.R.
Repeat-sequence turnover shifts fundamentally in species with large genomes.
Nature Plants. Roč. 6, č. 11 (2020), s. 1325-1329. ISSN 2055-026X. E-ISSN 2055-0278
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001777; GA MŠMT(CZ) LM2015047
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68081707
Klíčová slova: beta regression * stomatal size * evolution * rates * photosynthesis
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3); Plant sciences, botany (BFU-R)
Impakt faktor: 15.793, rok: 2020
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.nature.com/articles/s41477-020-00785-x
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0312866 - 7.0532455 - BC 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Robledillo, Laura Avila - Neumann, Pavel - Koblížková, Andrea - Novák, Petr - Vrbová, Iva - Macas, Jiří
Extraordinary Sequence Diversity and Promiscuity of Centromeric Satellites in the Legume Tribe Fabeae.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 37, č. 8 (2020), s. 2341-2356. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-09750S; GA MŠMT(CZ) LM2015047
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: centromere evolution * satellite DNA * CENH3 * ChIP-seq * plant chromosomes
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 16.240, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/mbe/article/37/8/2341/5817320
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0310942 - 8.0532441 - BC 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Oliveira, Ludmila - Neumann, Pavel - Jang, Tae-Soo - Klemme, Sonja - Schubert, J. - Koblížková, Andrea - Houben, A. - Macas, Jiří
Mitotic Spindle Attachment to the Holocentric Chromosomes of Cuscuta europaea Does Not Correlate With the Distribution of CENH3 Chromatin.
Frontiers in Plant Science. Roč. 10, January (2020), č. článku 1799. ISSN 1664-462X. E-ISSN 1664-462X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-09750S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: centromere * kinetochore * cenh3 * holocentric chromosomes * repetitive DNA analysis * satellite DNA * Cuscuta
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 5.754, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2019.01799/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0310933 - 9.0532438 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vondrak, Tihana - Robledillo, Laura Avila - Novák, Petr - Koblížková, Andrea - Neumann, Pavel - Macas, Jiří
Characterization of repeat arrays in ultra-long nanopore reads reveals frequent origin of satellite DNA from retrotransposon-derived tandem repeats.
Plant Journal. Roč. 101, č. 2 (2020), s. 484-500. ISSN 0960-7412. E-ISSN 1365-313X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001777
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: nanopore sequencing * centromeres * heterochromatin * fluorescence in situ hybridization (FISH) * technical advance
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 6.486, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.14546
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0310931 - 10.0495072 - BC 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Robledillo, Laura Avila - Koblížková, Andrea - Novák, Petr - Bottinger, K. - Vrbová, Iva - Neumann, Pavel - Schubert, I. - Macas, Jiří
Satellite DNA in Vicia faba is characterized by remarkable diversity in its sequence composition, association with centromeres, and replication timing.
Scientific Reports. Roč. 8, April 11 (2018), č. článku 5838. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA ČR GBP501/12/G090; GA MŠMT(CZ) LM2015047
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: in-situ hybridization * cytogenetic characterization * genome
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 4.011, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288091