Výsledky vyhledávání
- 1.0569309 - BFÚ 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Pečinka, P. - Bohalova, Natalia - Volna, A. - Kundratova, K. - Brázda, Václav - Bartas, M.
Analysis of G-Quadruplex-Forming Sequences in Drought Stress-Responsive Genes, and Synthesis Genes of Phenolic Compounds in Arabidopsis thaliana.
Life. Roč. 13, č. 1 (2023), č. článku 199. E-ISSN 2075-1729
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G-quadruplex * pqs * Arabidopsis thaliana * drought stress * phenolic compounds
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2075-1729/13/1/199
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344341 - 2.0560261 - BFÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Dobrovolná, Michaela - Bohalova, Natalia - Peška, Vratislav - Wang, J. - Luo, Y. - Bartas, M. - Volna, A. - Mergny, Jean-Louis - Brázda, Václav
The Newly Sequenced Genome of Pisum sativum Is Replete with Potential G-Quadruplex-Forming Sequences-Implications for Evolution and Biological Regulation.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 23, č. 15 (2022), č. článku 8482. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G-quadruplex * G4 propensity * chloroplast DNA * sequence prediction
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/23/15/8482
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340527 - 3.0558870 - ÚVGZ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Pech, R. - Volna, A. - Hunt, L. - Bartas, M. - Cerven, J. - Pečinka, P. - Špunda, Vladimír - Nezval, J.
Regulation of Phenolic Compound Production by Light Varying in Spectral Quality and Total Irradiance.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 23, č. 12 (2022), č. článku 6533. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000797
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: barley hordeum-vulgare * gene-expression * green light * red-light * anthocyanin biosynthesis * hydroxycinnamic acids * antioxidant activity * mediated regulation * oxidative stress * functional roles * antioxidants * flavonoids * hplc * miRNA * photoprotection * secondary metabolism * spectral quality of light * spring barley (Hordeum vulgare) * transcriptomics * UV tolerance
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.mdpi.com/1422-0067/23/12/6533
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0332369 - 4.0558374 - BFÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bartas, M. - Volna, A. - Beaudoin, C. - Poulsen, E. - Cerven, J. - Brázda, Václav - Špunda, V. - Blundell, T. L. - Pečinka, P.
Unheeded SARS-CoV-2 proteins? A deep look into negative-sense RNA.
Briefings in Bioinformatics. Roč. 23, č. 3 (2022). ISSN 1467-5463. E-ISSN 1477-4054
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: web server * visualization * translation * prediction * mechanism * helicase
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 9.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access s časovým embargem
https://academic.oup.com/bib/article/23/3/bbac045/6539840?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0339542 - 5.0555649 - BFÚ 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bartas, M. - Goswami, Pratik - Lexa, M. - Cerven, J. - Volna, A. - Fojta, Miroslav - Brázda, Václav - Pečinka, P.
Letter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains.
Briefings in Bioinformatics. Roč. 22, č. 5 (2021), č. článku bbab129. ISSN 1467-5463. E-ISSN 1477-4054
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: SARS-CoV-2 * mutations * inverted repeats
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.994, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/bib/article/22/5/bbab129/6219140
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0330106 - 6.0555382 - BFÚ 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Goswami, Pratik - Bartas, M. - Lexa, M. - Bohalova, Natalia - Volna, A. - Cerven, J. - Cervenova, V. - Pečinka, P. - Špunda, Vladimír - Fojta, Miroslav - Brázda, Václav
SARS-CoV-2 hot-spot mutations are significantly enriched within inverted repeats and CpG island loci.
Briefings in Bioinformatics. Roč. 22, č. 2 (2021), s. 1338-1345. ISSN 1467-5463. E-ISSN 1477-4054
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna * rna * methylation * genotype * protein * search
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (UEK-B)
Impakt faktor: 13.994, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/bib/article/22/2/1338/6042389
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329900 - 7.0554786 - BFÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Bartas, M. - Brázda, Václav - Volna, A. - Cerven, J. - Pečinka, P. - Zawacka-Pankau, J.
The Changes in the p53 Protein across the Animal Kingdom Point to Its Involvement in Longevity.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 22, č. 16 (2021), č. článku 8512. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: life-history * cancer * dna * tp53 * senescence
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.208, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/22/16/8512
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329435 - 8.0544245 - ÚVGZ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Volna, A. - Bartas, M. - Karlický, Václav - Nezval, J. - Kundratova, K. - Pečinka, P. - Špunda, Vladimír - Červen, J.
G-Quadruplex in Gene Encoding Large Subunit of Plant RNA Polymerase II: A Billion-Year-Old Story.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 22, č. 14 (2021), č. článku 7381. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-23702S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000797
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS III - 90123
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: dna-repair * transcription * visualization * instability * sequences * molecule * promoter * reveal * system * server * evolution * plant science * nucleic acids * circular dichroism * UV light
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 6.208, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/22/14/7381
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0321276 - 9.0539333 - BFÚ 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Bartas, M. - Brázda, Václav - Bohalova, Natalia - Cantara, Alessio - Volna, A. - Stachurová, T. - Malachová, K. - Jagelská, Eva - Porubiakova, Otilia - Cerven, J. - Pečinka, P.
In-Depth Bioinformatic Analyses ofNidoviralesIncluding Human SARS-CoV-2, SARS-CoV, MERS-CoV Viruses Suggest Important Roles of Non-canonical Nucleic Acid Structures in Their Lifecycles.
Frontiers in Microbiology. Roč. 11, jul 3 2020 (2020), č. článku 1583. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: g-quadruplex structures * web-based server * molecular-biology * rna * dna
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.640, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2020.01583/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0317023